Bioinformatik-Ressourcen, wie sie am SIB entwickelt werden, ermöglichen es Wissenschaftlern weltweit, das Leben zu erforschen und neue Entdeckungen zu machen. Entdecken Sie die strenge Auswahlverfahren , der ihre Aufnahme in das Portfolio des Instituts regelt portfolio führender offener Biodatenressourcen, und die professionelle Unterstützung, von der sie während ihres gesamten Lebenszyklus profitieren. Unser einzigartiges Modell trägt dazu bei, dass diese unverzichtbaren Datenbanken und Software-Tools für ihre über 10 Millionen Nutzer pro Jahr ein Höchstmaß an Nützlichkeit, Genauigkeit und Zuverlässigkeit erreichen und aufrechterhalten. Die meisten SIB-Ressourcen haben internationale Anerkennung

Ein Portfolio mit wichtigen Ressourcen für die Bioinformatik

Über 160 Tools und Datenbanken werden von der SIB-Community entwickelt und sind auf Expasy, dem Schweizer Bioinformatik-Ressourcenportal, frei verfügbar. Davon sind 17 als SIB-Ressourcen ausgewiesen. Sie umfassen 40 Software-Tools und Datenbanken. Diese führenden offenen Biodatenressourcen wurden ausgewählt, um der globalen Life-Sciences-Community höchste Qualität zu garantieren.

Mehr über die Unterstützung der SIB während des gesamten Lebenszyklus der Ressourcen

Die Notwendigkeit, hochwertige offene Ressourcen zu fördern

Forschung und Aktivitäten in den Lebenswissenschaften produzieren riesige Mengen an grundlegenden Daten, die schwer zu reproduzieren sind. Offene Biodatenressourcen in Form von Software-Tools und Datenbanken spielen eine entscheidende Rolle bei der Anreicherung dieser grundlegenden Daten durch Kuration und Analyse, aber auch bei der Erleichterung ihrer Analyse und Visualisierung in verschiedenen Kontexten. Durch die Ermöglichung der Wissensspeicherung, die Gewährleistung der Reproduzierbarkeit und die Förderung wirkungsvoller Forschung tragen Bioinformatik-Ressourcen erheblich zur Verbesserung der Qualität der Wissenschaft bei.

In Anerkennung dieser Tatsache hat das Staatssekretariat für Bildung, Forschung und Innovation (SBFI) das SIB im Jahr 2000 mit dem Auftrag und den entsprechenden Mitteln ausgestattet, wichtige offene Ressourcen für die Bioinformatik zu identifizieren, zu unterstützen und weiterzuentwickeln.

Entdecken Sie den Einfluss der SIB-Ressourcen bei der Bewältigung globaler Herausforderungen

Durchsuchen Sie unser Portfolio

Durchsuchen Sie das SIB-Portfolio unten und besuchen Sie Expasy, das Schweizer Portal für Bioinformatik-Ressourcen, um alle von unserer Community entwickelten Ressourcen zu sehen.

Zugang zu Expasy

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Ein strenges Auswahlverfahren unter Einbeziehung internationaler Experten

Das SIB hat ein solides Auswahlmodell entwickelt, mit dem die besten Datenbanken und Software-Tools der Schweizer Life-Science-Landschaft identifiziert und vom Institut gefördert werden können. Alle vier Jahre empfiehlt unser unabhängiger wissenschaftlicher Beirat (SAB), welche Ressourcen aus der SIB-Community in das Portfolio des Instituts aufgenommen werden sollen. Seine Empfehlungen basieren auf der wissenschaftlichen Bedeutung sowie dem wissenschaftlichen Ertrag der Investitionen und der Übereinstimmung mit der Strategie des Instituts. Der SAB gibt auch Richtlinien für die kontinuierliche Weiterentwicklung vor, die alle zwei Jahre überprüft werden. Über den Umfang der Unterstützung in Form von Finanzmitteln und Personal für die Umsetzung des Aktionsplans entscheidet dann der Verwaltungsrat des SIB.

Die Bewertung und Überwachung der SIB-Ressourcen erfolgt alle vier Jahre anhand einer Reihe von rund 30 Indikatoren

Der wissenschaftliche Beirat der SIB

Als führendes Unternehmen im Bereich Bioinformatik und Anbieter von Biodatenressourcen von Weltklasse hat die SIB einen wissenschaftlichen Beirat eingerichtet, der die Auswahl und Entwicklung der Tools und Datenbanken ihres Portfolios im Einklang mit der Strategie des Instituts begleitet. Dieser Beirat vereint international renommierte Wissenschaftler aus den unterschiedlichsten Bereichen der Lebenswissenschaften.

Anpassbar an die Anforderungen der Branche

Alle SIB-Ressourcen können auf spezifische Bedürfnisse oder proprietäre Daten zugeschnitten werden . So wurde beispielsweise die Orthologiedatenbank OMA, Teil von SwissOrthology, an die Bedürfnisse des Chemieunternehmens BASF angepasst. Dies ermöglicht es dem Unternehmen, verschiedene Merkmale in Nutzpflanzen wie Sojabohnen und Weizen zu entwickeln, indem es anhand öffentlicher und proprietärer Genomsequenzen homologe Beziehungen zwischen Genen ableitet.

Professionelle Unterstützung für langfristige Nachhaltigkeit

Die SIB-Ressourcen werden kontinuierlich während ihres gesamten Lebenszyklus unterstützt, um ihre Wirkung und Qualität zu stärken. So entsteht ein positiver Kreislauf, der die Wahrscheinlichkeit erhöht, dass sie in Zukunft zusätzliche Mittel aus anderen Quellen erhalten, wodurch ihre Nachhaltigkeit gesichert wird. Dies wird vom Biodata Resources Team koordiniert und umfasst andere Teams in den Supportfunktionen des SIB. Dieses in der Wissenschaft einzigartige Dienstleistungsangebot umfasst technischen Support, Best Practices und Wissensaustausch, Infrastruktur-Hosting, Benutzererfahrung, Personalressourcen für Rechts- und Datenschutzfragen sowie Fördermittelmanagement.

Verwaltung des Lebenszyklus des SIB-Portfolios offener Datenressourcen

Der Fokus des Auswahlverfahrens des SIB liegt auf Ressourcen, die die Proof-of-Concept-Phase durchlaufen haben und oft im Rahmen von Forschungsprojekten finanziert werden. Das Institut unterstützt das Wachstum von Ressourcen, die somit als aufstrebend oder ausgereift definiert sind . Es hilft ihnen auch, internationale Anerkennung zu erlangen. Wenn eine SIB-Ressource ihre Tätigkeit einstellt – aufgrund unzureichender Finanzierung, Pensionierung oder Wegzug des Hauptforschers aus der Schweiz – sorgt das Institut auch dafür, dass die wichtigsten Ressourcen für die Life-Sciences-Community verfügbar bleiben.

Lesen Sie den vollständigen Artikel zu diesem Prozess

Das SIB-Netzwerk bildet einen sehr dynamischen Nährboden für die Entstehung grundlegender Ressourcen für die Forschung. In Verbindung mit den Bemühungen des Instituts um die Steigerung der Exzellenz der Schweizer Bioinformatik verfügt das Land über eine der grössten Anzahlen international anerkannter Ressourcen.

Derzeit auf europäischer und weltweiter Ebene anerkannte Ressourcen

5 SIB-Ressourcen sind auf europäischer Ebene als ELIXIR Core Data Resources (Cellosaurus, Rhea, STRING, SWISS-MODEL und UniProt) anerkannt und 5 sind als Global Core Biodata Resources (Bgee, Cellosaurus, Rhea, STRING und UniProt) ausgewiesen und damit weltweit anerkannt. Damit ist die Schweiz der zweitgrößte Anbieter von ELIXIR-CDRs in Europa und der drittgrößte Anbieter von GBCRs weltweit.

Anstreben einer internationalen Anerkennung als Biodaten-Infrastruktur

Das Schweizer Bioinformatik-Ressourcenportal, das auf Expasy gehostet wird , ist die wichtigste Unterstützung, die das SIB zur Pflege der von seinen Mitgliedern entwickelten Tools und Datenbanken bietet. Mit zunehmender Reife können sie in den Service Delivery Plan von ELIXIR Switzerland aufgenommen werden, eine Auswahl langfristiger, nachhaltiger und qualitativ hochwertiger Dienste, die von der Schweizer Bioinformatik-Community bereitgestellt werden. Sie haben dann das Potenzial, SIB-Ressourcen zu werden und von langfristiger professioneller Unterstützung und Finanzierung zu profitieren. Ressourcen, die ihren Wert für die internationale Gemeinschaft unter Beweis stellen, können auf europäischer Ebene durch die Aufnahme in die ELIXIR Core Data Resources und sogar weltweit als Global Core Biodata Resources anerkannt werden.

Solche Anerkennungen sind eine große Würdigung für die SIB-Gruppen, die sie entwickeln, und zeigen ihre anhaltende grundlegende Bedeutung für die weltweite Life-Science-Community sowie das Engagement der SIB für die Life-Science-Infrastruktur und die führende Expertise der Schweiz im Bereich biologischer Daten.

Sicherstellung, dass die Ressourcen der SIB auf dem neuesten Stand bleiben

Um sicherzustellen, dass die Ressourcen in Bezug auf Benutzererfahrung, wissenschaftliche Inhalte und Interoperabilität stets auf dem neuesten Stand der Forschung sind, sorgt das Biodata Resource Team für die Weiterverfolgung und Umsetzung der Empfehlungen des wissenschaftlichen Beirats. Dazu gehören die Unterstützung bei der Durchführung von Nutzerumfragen, die Beratung zur Verbesserung der FAIRness der Ressourcen sowie die Überwachung von KPIs und Analysen, die Verbesserung des UX-Designs, die Initiierung von Förderprojekten zur Entwicklung neuer wissenschaftlicher Ideen und die Förderung von Kooperationen innerhalb des Portfolios und mit dem SIB-Netzwerk