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Genome Systems Biology

Erik van Nimwegen
University of Basel
Basel

Das Hauptforschungsinteresse der Gruppe Genom-Systembiologie (GSB) gilt der Struktur, Funktion und Evolution genomweiter regulatorischerNetzwerke, mit denen Zellen ihren Genexpressionszustand steuern. Typische Fragen, mit denen wir uns beschäftigen, sind: Wie sind die regulatorischen Netzwerke in der Genomsequenz kodiert? Wie wird dieser regulatorische Code von der Zelle gelesen? Wie haben sich diese regulatorischen Netzwerke entwickelt? Und gibt es allgemeine „Designprinzipien“ für diese regulatorischen Netzwerke? Ein weiteres wichtiges Forschungsgebiet unserer Gruppe ist die Identifizierung allgemeiner quantitativer Gesetze in der Genom-Evolution.

Wir haben eine Reihe von Computertools entwickelt, mit denen sich Genregulationsnetzwerke aus Hochdurchsatzdaten automatisch rekonstruieren lassen. Diese Tools werden über die SIB zur Verfügung gestellt.

Die Gruppe entwickelt die SIB-Ressource Swiss Regulon, ein Portal für regulatorische Genomik

Bereich(e) der Anwendung
Grundlagenforschung
Medizin und Gesundheit
Bereich der Tätigkeit
Gene und Genome