I SIB Bioinformatics Awards celebrano i risultati eccezionali ottenuti dai bioinformatici all'inizio della loro carriera e le risorse innovative. Dal 2008, questi premi riconoscono ricercatori eccezionali provenienti da tutto il mondo in tre categorie: Premio per la tesi di dottorato, Premio per l'inizio della carriera e Premio per le risorse innovative. Scoprite l'eccellenza dei nostri precedenti vincitori che hanno plasmato il campo della bioinformatica e continuano a ispirare le future generazioni di scienziati
Premio per tesi di dottorato
(internazionale dal 2023, in tutta la Svizzera prima di tale data)
2021
Vincitori: Stephanie Hyland, Martin Faltys, Matthias Hüser, Xinrui Lyu e Thomas Gumbsch, guarda la presentazione alla conferenza[BC]2
Affiliazioni: ETH Zurigo, Svizzera; Memorial Sloan Kettering Cancer Center, Stati Uniti; Weill Cornell Medicine, Stati Uniti; Ospedale universitario di Zurigo, Svizzera; Università di Berna; il SIB Istituto Svizzero di Bioinformatica
Articolo: Previsione precoce dell'insufficienza circolatoria nell'unità di terapia intensiva mediante l'apprendimento automatico
2019
Laureato: Jochen Singer, guarda la presentazione alla conferenza [BC]2
Affiliazione: ETH Zurigo, gruppo Niko Beerenwinkel, Svizzera
Articolo: Identificazione delle mutazioni a livello di singola cellula tramite inferenza filogenetica
2017
Vincitore: José Aguilar-Rodríguez, leggi l'intervista
Affiliazione: Università di Zurigo, Laboratorio Andreas Wagner
Articolo: Mille paesaggi adattativi empirici e la loro navigabilità
2015
Vincitore: Hannes Röst Steiner, leggi l'intervista
Affiliazione: Istituto di biologia molecolare dei sistemi, Prof. Dr Rudolf Aebersold, ETH Zurigo
Articolo: OpenSWATH consente l'analisi automatizzata e mirata di dati MS acquisiti in modo indipendente dai dati
2014
Vincitrice: Josephine Daub, leggi l'intervista
Affiliazione: Genetica computazionale e molecolare delle popolazioni, Laurent Excoffier, il SIB e Università di Berna
Articolo: Prove dell'adattamento poligenico ai patogeni nel genoma umano
2013
Vincitori: Slavica Dimitrieva e Charles Vejnar (co-vincitori - 2 diverse pubblicazioni)
- Slavica Dimitrieva, leggi l'intervista
Affiliazione: Genomica computazionale del cancro, Philipp Bucher, il SIB & EPFL
Articolo: OpenSWATH consente l'analisi automatizzata e mirata dei dati MS acquisiti in modo indipendente dai dati - Charles E. Vejnar, leggi l'intervista
Affiliazione: Genomica computazionale evolutiva, Evgeny Zdobnov, il SIB Università di Ginevra
Articolo: MiRmap: previsione completa della forza di repressione dei target dei microRNA
2012
Laureati: Christoph Zechner & Jakob Ruess (coautori della stessa pubblicazione), leggi l'intervista
Affiliazione: gruppo Heinz Koeppl, ETH Zurigo (Christoph Zechner) e gruppo John Lygeros, ETH Zurigo (Jakob Ruess)
Articolo: L'inferenza basata sui momenti predice la bimodalità nell'espressione genica transitoria
2011
Vincitore: Guillaume Rey, leggi l'intervista
Affiliazione: Laboratorio di biologia computazionale dei sistemi, gruppo Felix Naef, al SIB & EPFL
Articolo: I ritmi di legame del DNA a livello genomico e specifici per fase di BMAL1 controllano le funzioni circadiane nei topi vivi
2010
Laureato: Rajesh Ramaswamy, leggi l'intervista
Affiliazione: Gruppo MOSAIC, Ivo Sbalzarini, il SIB & ETH Zurigo
Articolo: Una nuova classe di algoritmi di simulazione stocastica esatta altamente efficienti per le reti di reazioni chimiche
2009
Laureato: Julien Roux, leggi l'intervista
Affiliazione: Evolutionary Bioinformatica Group, Marc Robinson-Rechavi group , il SIB & Università di Losanna
Articolo: Vincoli evolutivi sull'evoluzione del genoma dei vertebrati
Premio per l'inizio della carriera
2021
Vincitrice: Heba Sailem, guarda la sua presentazione alla conferenza[BC]2
Affiliazione: Università di Oxford, Regno Unito
Progetto: KCML: un framework di machine learning per l'inferenza delle funzioni geniche multiscala da screening di perturbazioni genetiche
2019
Vincitrice: Eleonora Porcu, guarda la sua presentazione alla conferenza [BC]2
Affiliazione: il SIB & Università di Losanna, gruppo Zoltán Kutalik, Svizzera
Progetto: Un approccio statistico per analizzare le basi molecolari causali delle malattie complesse
2017
Vincitore: Sebastian Waszak
Affiliazione: EMBL, gruppo Jan Korbel, Germania
Progetto: Il suo eccezionale lavoro nel campo della biologia computazionale e statistica
2015
Vincitore: Shijulal Nelson-Sathi, leggi l'intervista
Affiliazione: Istituto di Evoluzione Molecolare, Prof. Dr William Martin, Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, Germania
Progetto: Principali flussi genici nell'evoluzione dei procarioti
2014
Vincitore: Joshua Payne, leggi l'intervista
Affiliazione: Biologia dei sistemi evolutivi, gruppo Andreas Wagner, al SIB e Università di Zurigo, Svizzera
Progetto: Robustezza ed evolvibilità dei siti di legame dei fattori di trascrizione
2013
Vincitrice: Anamaria Necsulea, leggi l'intervista
Affiliazione: Genomica evolutiva funzionale, Henrik Kaessmann, il SIB e Università di Losanna
Progetto: L'evoluzione dei trascrittomi dei tessuti dei vertebrati
2012
Vincitore: Christophe Dessimoz, leggi l'intervista
Affiliazione: bioinformatica evolutiva, gruppo Marc Robinson-Rechavi, il SIB e Università di Losanna (in collaborazione con l'EBI - European Bioinformatics Institute)
Progetto: Risoluzione della congettura ortologa: gli ortologhi tendono ad essere leggermente, ma significativamente, più simili nella funzione rispetto ai paraloghi
2011
Vincitore: Nacho Molina, leggi l'intervista
Affiliazione: Laboratorio di biologia computazionale dei sistemi, gruppo Felix Naef, al SIB & EPFL
Progetto: I geni dei mammiferi sono trascritti con cinetiche di bursting molto diverse tra loro
2010
Vincitrice: Aitana Neves, leggi l'intervista
Affiliazione: Gruppo di Biologia Computazionale, Sven Bergmann, il SIB & Università di Losanna
Progetto: Precisione e scalabilità nella modellizzazione dello sviluppo
2009
Vincitore: Lukas Burger, leggi l'intervista
Affiliazione: Gruppo di bioinformatica e Biologia dei Sistemi, gruppo Erik van Nimwegen, Biozentrum, Il SIB e Università di Basilea
Progetto: Come prevedere le interazioni fisiche tra i residui proteici basandosi interamente sui dati di sequenza, utilizzando allineamenti multipli di sequenze di proteine simili
Premio per le risorse innovative
2021
Risorsa: Nextflow, che consente flussi di lavoro scientifici scalabili e riproducibili utilizzando container software
Rappresentato da: Cédric Notredame, guarda la presentazione alla conferenza [BC]2
Affiliazione: Centro di Regolazione Genomica, Spagna
Responsabile del progetto: Sequera labs
2019
Risorsa: Velocyto - un nuovo framework per l'analisi della velocità dell'RNA nei dati RNAseq a singola cellula
Rappresentato da: Sten Linnarsson, guarda la presentazione alla conferenza [BC]2
Affiliazione: Linnarsson Lab, Karolinska Institute, Svezia
Titolare del progetto: Sviluppato congiuntamente dal Linnarsson Lab, Gioele La Manno (EPFL), Peter Kharchenko (Harvard) e Ruslan Soldatov (Harvard).
2017
Risorsa: RepurposeDB - Database di riferimento delle ricerche sul riposizionamento dei farmaci
Rappresentato da: Shameer Khader, leggi l'intervista
Affiliazione: Dudley Lab, Istituto di genomica e biologia multiscala, Icahn School of Medicine, Mount Sinai, USA
Responsabile del progetto: Joel Dudley
2015
Risorsa: ABySS, Assembly By Short Sequences - un assemblatore di sequenze de novo, parallelo e paired-end
Rappresentato da: Inanc Birol, leggi l'intervista
Affiliazione: Michael Smith Genome Sciences Centre, BC Cancer Agency, Canada
Responsabile del progetto: Anthony Raymond