Rajesh Ramaswamy – Vincitore del premio SIB 2010 per la migliore tesi di laurea in bioinformatica in Svizzera
Rajesh Ramaswamy ha ricevuto il premio per il suo articolo "A new class of highly efficient exact stochastic simulation algorithms for chemical reaction networks"(Una nuova classe di algoritmidi simulazione stocastica esatta altamente efficienti per le reti di reazioni chimiche), basato sul lavoro svolto come studente laureato nel team dell'ex responsabile del gruppo del SIB Ivo Sbalzarini (ora presso l'Istituto Max Planck di Dresda) presso il Politecnico federale di Zurigo.
Oggi Rajesh lavora come "Responsabile della scienza dei dati sanitari in Nord America" per EMD Serono, un'azienda biofarmaceutica di Merck KGaA con sede a Boston, negli Stati Uniti. Uno dei suoi compiti principali è lo sviluppo di metodi computazionali e algoritmi per la modellizzazione basata sui dati. Per scoprire altri progetti di ricerca a cui Rajesh ha lavorato, visita la sua pagina Google Scholar e leggi la nostra intervista.
Informazioni sui premi SIB Bioinformatics Awards e sulla nostra serie di interviste "Incontra i vincitori delle passate edizioni dei premi SIB"
Lanciati nel 2008 come iniziativa volta a premiare i giovani bioinformatici svizzeri, i SIB Bioinformatics Awards hanno fatto molta strada da allora: da un unico premio nazionale sono diventati oggi tre diversi riconoscimenti, che premiano 1) i bioinformatici internazionali all'inizio della carriera (SIB Early Career Bioinformatician Award), 2) l'eccellenza nella comunità svizzera dei dottorandi (SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award) e 3) le risorse bioinformatiche innovative (SIB Bioinformatics Resource Innovation Award). Nel corso degli anni sono stati assegnati 21 premi, con nove vincitori premiati per la loro eccezionale carriera in fase iniziale, dieci dottorandi per le loro eccellenti pubblicazioni e due risorse bioinformatiche per il loro aspetto innovativo.
Nel 2019, i SIB Bioinformatics Awards saranno assegnati per ladecima volta, offrendo una grande occasione per contattare i vincitori delle edizioni precedenti e chiedere loro a che punto sono ora nella loro carriera: questa intervista fa parte di una serie che vi invita a conoscere i vincitori delle edizioni precedenti dei SIB Bioinformatics Awards.
A che punto della tua carriera ti trovavi quando hai ricevuto il premio Il SIB? Come ti sei sentito? Qual era l'argomento principale della tua ricerca in quel momento?
Ho ricevuto il premio mentre stavo facendo il dottorato, due anni prima di laurearmi. Ricordo che ero super contento e motivato a continuare il mio lavoro sullo sviluppo di algoritmi di simulazione stocastica efficienti per grandi reti di reazioni chimiche. Avevamo pubblicato una nuova variante del cosiddetto "algoritmo di simulazione stocastica esatta (SSA)" per simulare reti di reazioni biochimiche. La nostra variante, denominata "SSA a propensione parziale", ha un costo computazionale significativamente inferiore rispetto ad altri metodi, indipendentemente dalla complessità della rete di reazioni, pur rimanendo esatta (per i dettagli, consultare l'articolo). In qualità di vincitore del premio, è stato fantastico avere l'opportunità di presentare il mio lavoro alla Basel Computational Biology Conference. Guardando indietro, posso dire che il premio mi ha motivato a impegnarmi ancora di più durante una fase critica del mio dottorato di ricerca.
Quali sono i tuoi attuali interessi di ricerca?
Il mio interesse principale è lo sviluppo di metodi computazionali e algoritmi per la modellizzazione basata sui dati e sulle ipotesi. Le aree di interesse sono: (1) elaborazione delle informazioni nelle reti di reazioni biochimiche, (2) soluzioni automatizzate basate sui dati, (3) inferenza causale e (4) meccanica attiva delle cellule e dei tessuti.
Secondo te, qual è la scoperta più interessante che è stata fatta grazie alla bioinformatica?
È difficile pensare oltre il progetto sul genoma umano. Sarà affascinante vedere i progressi compiuti durante il progetto sul genoma umano svolgere un ruolo importante nel futuro della medicina di precisione e personalizzata.
Pensate in grande, correte dei rischi, non ci sono limiti a ciò che ognuno di noi può realizzare.
Cosa ti piace fare nel tempo libero?
Mi piace fare sport, soprattutto correre, allenarmi con i pesi e giocare a squash. Mi piace anche molto andare ai concerti e frequentare pub alla moda per socializzare con gli altri avventori.
Qualche consiglio per la futura generazione di bioinformatici?
Pensate in grande, correte dei rischi, non ci sono limiti a ciò che ognuno di noi può realizzare.
