Nacho Molina – Vincitore del Premio Il SIB 2011 per giovani bi informatici all'inizio della carriera
Nacho Molina ha ricevuto il premio SIB Early Career Bioinformatician Award per il suo progetto su come«i geni dei mammiferi vengono trascritti con cinetica di bursting molto diversa», realizzato nel team del leader del gruppo del SIB Félix Naef presso l'EPFL (Losanna).
Oggi Nacho guida con successo il proprio gruppo presso l'Istituto di genetica e biologia molecolare e cellulare (IGBMS) in Francia ed è anche ricercatore permanente presso il Centro nazionale francese per la ricerca scientifica (CNRS). Insieme al suo team, sta cercando di migliorare la nostra comprensione di come i processi stocastici influenzano la regolazione genica eucariotica. Per saperne di più sugli interessi di ricerca di Nacho, seguite @molina_lab su Twitter.
Informazioni sui premi SIB Bioinformatics Awards e sulla nostra serie di interviste "Incontra i vincitori delle passate edizioni dei premi SIB"
Lanciati nel 2008 come iniziativa volta a premiare i giovani bioinformatici svizzeri, i SIB Bioinformatics Awards hanno fatto molta strada da allora: da un unico premio nazionale sono diventati oggi tre diversi riconoscimenti, che premiano 1) i bioinformatici internazionali all'inizio della carriera (SIB Early Career Bioinformatician Award), 2) l'eccellenza nella comunità svizzera dei dottorandi (SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award) e 3) le risorse bioinformatiche innovative (SIB Bioinformatics Resource Innovation Award). Nel corso degli anni sono stati assegnati 21 premi, con nove vincitori premiati per la loro eccezionale carriera in fase iniziale, dieci dottorandi per le loro eccellenti pubblicazioni e due risorse bioinformatiche per il loro aspetto innovativo.
Nel 2019, i SIB Bioinformatics Awards saranno assegnati per ladecima volta, offrendo una grande occasione per contattare i vincitori delle edizioni precedenti e chiedere loro a che punto sono ora nella loro carriera: questa intervista fa parte di una serie che vi invita a conoscere i vincitori delle edizioni precedenti dei SIB Bioinformatics Awards.
A che punto della tua carriera ti trovavi quando hai ricevuto il premio Il SIB? Come ti sei sentito? Qual era l'argomento principale della tua ricerca in quel momento?
Ero ricercatore post-dottorato nel laboratorio di Félix Naef all'EPFL quando ho ricevuto il premio, poco dopo aver pubblicato il nostro progetto su Science. Era la prima volta che ricevevo un premio per la mia ricerca e mi sono sentito profondamente onorato. E, sebbene la pubblicazione su Science fosse già un modo importante per ottenere riconoscimento per il mio lavoro, per me è stato molto speciale essere premiato dalla comunità svizzera di bioinformatica, dai miei colleghi. Come dico sempre: scientificamente parlando, sono nato in Svizzera!
All'epoca stavo lavorando allo sviluppo di modelli matematici e metodi computazionali per studiare la stocasticità dell'espressione genica nelle cellule dei mammiferi. Ho sviluppato un quadro bayesiano che combina modelli Markov nascosti con modelli stocastici di reazioni biochimiche per analizzare le tracce di uno speciale reporter luciferasi (N.d.R.: un enzima che produce bioluminescenza e consente di tracciare l'attività di altri geni) che è stato progettato da David Suter nel laboratorio di Ueli Schibler a Ginevra. Insieme, siamo stati in grado di studiare i parametri fondamentali della trascrizione genica, come i tassi di attivazione e disattivazione dei geni o i tassi di sintesi dell'mRNA dei promotori endogeni. Inoltre, abbiamo scoperto che per essere riattivati, i geni devono attraversare un periodo refrattario, una sorta di periodo di reset in cui la trascrizione non può essere attivata.
Quali sono i tuoi attuali interessi di ricerca?
L'attività di ricerca principale del mio gruppo consiste nello sviluppo di modelli stocastici e biofisici della regolazione genica eucariotica. Il nostro lavoro si colloca all'interfaccia tra bioinformatica e biofisica, combinando strumenti e metodi provenienti da entrambi i campi. Sviluppiamo modelli meccanicistici di regolazione genica basati sia su dati genomici su larga scala che su dati di imaging di singole cellule. Più recentemente, ho iniziato a interessarmi alla modellizzazione delle dinamiche della regolazione genica nel contesto del ciclo cellulare e della differenziazione cellulare.
Al giorno d'oggi è quasi impossibile trovare una scoperta rivoluzionaria nel campo della biologia che non si basi in larga misura su sofisticati approcci computazionali per analizzare i dati sperimentali e modellare il processo biologico oggetto di studio
Secondo te, qual è la scoperta più interessante che è stata fatta grazie alla bioinformatica?
Al giorno d'oggi è quasi impossibile trovare un evento rivoluzionario nel campo della biologia che non si basi in larga misura su sofisticati approcci computazionali per analizzare i dati sperimentali e modellare il processo biologico oggetto di studio. Tuttavia, se dovessi scegliere un recente orientamento della ricerca nel campo della bioinformatica che personalmente trovo entusiasmante, sarebbe l'inferenza dei tipi cellulari, dei lignaggi di differenziazione e delle reti di regolazione genica a partire dai dati trascrittomici di singole cellule.
Cosa ti piace fare nel tempo libero?
Ho due figli di 7 e 5 anni: non ho tempo libero!
Qualche consiglio per la futura generazione di bioinformatici?
Continua a impegnarti perché il futuro della ricerca in biologia è tuo.
