Les SIB Bioinformatics Awards récompensent les réalisations exceptionnelles de bioinformaticiens en début de carrière et les ressources innovantes. Depuis 2008, ces prix récompensent des chercheurs exceptionnels du monde entier dans trois catégories : Prix de la thèse de doctorat, Prix de la jeune carrière et Prix de la ressource innovante. Découvrez l'excellence de nos anciens lauréats qui ont façonné le domaine de la bioinformatique et continuent d'inspirer les futures générations de scientifiques
Prix de thèse
(international depuis 2023, suisse avant cette date)
2021
Lauréats : Stephanie Hyland, Martin Faltys, Matthias Hüser, Xinrui Lyu et Thomas Gumbsch, regardez la présentation lors de la conférence[BC]2
Affiliations : ETH Zurich, Suisse ; Memorial Sloan Kettering Cancer Center, États-Unis ; Weill Cornell Medicine, États-Unis ; Hôpital universitaire de Zurich, Suisse ; Université de Berne ; SIB Institut Suisse de Bioinformatique
Article : Prédiction précoce de l'insuffisance circulatoire en unité de soins intensifs à l'aide de l'apprentissage automatique
2019
Lauréat : Jochen Singer, regardez la présentation lors de la conférence [BC]2
Affiliation: ETH Zurich, groupe Niko Beerenwinkel, Suisse
Article : Identification de mutations unicellulaires par inférence phylogénétique
2017
Lauréat : José Aguilar-Rodríguez, lire l'interview
Affiliation: Université de Zurich, laboratoire Andreas Wagner
Article : Un millier de paysages adaptatifs empiriques et leur navigabilité
2015
Lauréat : Hannes Röst Steiner, lire l'interview
Affiliation: Institut de biologie moléculaire des systèmes, Prof. Dr Rudolf Aebersold, ETH Zurich
Article : OpenSWATH permet l'analyse automatisée et ciblée de données MS acquises indépendamment des données
2014
Lauréate : Josephine Daub, lire l'interview
Affiliation: Génétique computationnelle et moléculaire des populations, Laurent Excoffier, SIB & Université de Berne
Article : Preuves d'une adaptation polygénique aux agents pathogènes dans le génome humain
2013
Lauréats : Slavica Dimitrieva et Charles Vejnar (co-lauréats - 2 publications différentes)
- Slavica Dimitrieva, lire l'interview
Affiliation: Génomique computationnelle du cancer, Philipp Bucher, SIB & EPFL
Article : OpenSWATH permet l'analyse automatisée et ciblée de données MS acquises indépendamment des données - Charles E. Vejnar, lire l'interview
Affiliation: Génomique évolutive computationnelle, Evgeny Zdobnov, SIB Université de Genève
Article : MiRmap : prédiction complète de la force de répression des microARN cibles
2012
Lauréats : Christoph Zechner & Jakob Ruess (coauteurs de la même publication), lire l'interview
Affiliation: groupe Heinz Koeppl, ETH Zurich (Christoph Zechner) et groupe John Lygeros, ETH Zurich (Jakob Ruess)
Article : L'inférence basée sur les moments prédit la bimodalité dans l'expression génique transitoire
2011
Lauréat : Guillaume Rey, lire l'interview
Affiliation: Laboratoire de biologie computationnelle des systèmes, groupe Felix Naef, SIB & EPFL
Article : Les rythmes de liaison à l'ADN à l'échelle du génome et spécifiques à la phase de BMAL1 contrôlent les fonctions circadiennes chez la souris vivante
2010
Lauréat : Rajesh Ramaswamy, lire l'interview
Affiliation: Groupe MOSAIC, Ivo Sbalzarini, SIB & ETH Zurich
Article : Une nouvelle classe d'algorithmes de simulation stochastique exacte hautement efficaces pour les réseaux de réactions chimiques
2009
Lauréat : Julien Roux, lire l'interview
Affiliation: Groupe de bioinformatique évolutive, groupe Marc Robinson-Rechavi, SIB & Université de Lausanne
Article : Contraintes développementales sur l'évolution du génome des vertébrés
Prix pour le début de carrière
2021
Lauréate : Heba Sailem, regardez sa présentation lors de la conférence[BC]2
Affiliation : Université d'Oxford, Royaume-Uni
Projet: KCML : un cadre d'apprentissage automatique pour l'inférence de fonctions génétiques à plusieurs échelles à partir de criblages de perturbations génétiques
2019
Lauréate : Eleonora Porcu, regardez sa présentation lors de la conférence [BC]2
Affiliation: SIB & Université de Lausanne, groupe Zoltán Kutalik, Suisse
Projet: Une approche statistique pour disséquer les fondements moléculaires causaux de maladies complexes
2017
Lauréat : Sebastian Waszak
Affiliation: EMBL, groupe Jan Korbel, Allemagne
Projet : Ses travaux exceptionnels en biologie computationnelle et statistique
2015
Lauréat : Shijulal Nelson-Sathi, lire l'interview
Affiliation: Institut d'évolution moléculaire, Prof. Dr William Martin, Université Heinrich-Heine de Düsseldorf, Allemagne
Projet : Flux génétiques majeurs dans l'évolution des procaryotes
2014
Lauréat : Joshua Payne, lire l'interview
Affiliation: Biologie des systèmes évolutifs, groupe Andreas Wagner, SIB & Université de Zurich, Suisse
Projet : Robustesse et évolutivité des sites de liaison des facteurs de transcription
2013
Lauréate : Anamaria Necsulea, lire l'interview
Affiliation: Génomique fonctionnelle et évolutive, Henrik Kaessmann, SIB & Université de Lausanne
Projet : L'évolution des transcriptomes tissulaires des vertébrés
2012
Lauréat : Christophe Dessimoz, lire l'interview
Affiliation: Bioinformatique évolutive, groupe Marc Robinson-Rechavi, SIB & Université de Lausanne (co-supervisé avec l'EBI - Institut européen de bioinformatique)
Projet : Résolution de la conjecture orthologique : les orthologues ont tendance à être faiblement, mais significativement, plus similaires en termes de fonction que les paralogues
2011
Lauréat : Nacho Molina, lire l'interview
Affiliation: Laboratoire de biologie computationnelle des systèmes, groupe Felix Naef, SIB & EPFL
Projet : Les gènes des mammifères sont transcrits avec des cinétiques d'explosion très différentes
2010
Lauréate : Aitana Neves, lire l'interview
Affiliation: Groupe de biologie computationnelle, Sven Bergmann, SIB & Université de Lausanne
Projet : Précision et mise à l'échelle dans les modèles de développement
2009
Lauréat : Lukas Burger, lire l'interview
Affiliation: Groupe de bioinformatique et de biologie des systèmes, groupe Erik van Nimwegen, Biozentrum, SIB & Université de Bâle
Projet : Comment prédire les interactions physiques entre les résidus protéiques en se basant uniquement sur des données séquentielles, à l'aide d'alignements multiples de séquences de protéines similaires
Prix de l'innovation en matière de ressources
2021
Ressource : Nextflow, permettant des workflows scientifiques évolutifs et reproductibles à l'aide de conteneurs logiciels
Représenté par : Cédric Notredame, regardez la présentation lors de la conférence [BC]2
Affiliation : Centre de régulation génomique, Espagne
Propriétaire du projet : Sequera labs
2019
Ressource : Velocyto - un nouveau cadre pour l'analyse de la vitesse de l'ARN dans les données RNAseq unicellulaires
Représenté par : Sten Linnarsson, voir la présentation lors de la conférence [BC]2
Affiliation : Laboratoire Linnarsson, Institut Karolinska, Suède
Propriétaire du projet : Développé conjointement par le laboratoire Linnarsson, Gioele La Manno (EPFL), Peter Kharchenko (Harvard) et Ruslan Soldatov (Harvard).
2017
Ressource : RepurposeDB - Base de données de référence sur les recherches en matière de repositionnement des médicaments
Représenté par : Shameer Khader, lire l'interview
Affiliation : Laboratoire Dudley, Institut de génomique et de biologie multiscalaire, École de médecine Icahn, Mount Sinai, États-Unis
Propriétaire du projet : Joel Dudley
2015
Ressource : ABySS, Assembly By Short Sequences - un assembleur de séquences de novo, parallèle et à extrémités appariées
Représenté par : Inanc Birol, lire l'interview
Affiliation : Centre des sciences génomiques Michael Smith du Canada, BC Cancer Agency
Propriétaire du projet : Anthony Raymond