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Genome Systems Biology

Erik van Nimwegen
University of Basel
Basel

Il principale interesse di ricerca del gruppo Genome Systems Biology (GSB) è la struttura, la funzione e l'evoluzione delle reti regolatoriegenomiche che le cellule utilizzano per controllare il loro stato di espressione genica. Le domande tipiche che stiamo cercando di affrontare includono: Come vengono codificate le reti regolatorie nella sequenza genomica? Come viene letto questo codice regolatorio dalla cellula? Come si sono evolute queste reti regolatorie? Esistono dei "principi di progettazione" generali per queste reti regolatorie? Un altro interesse chiave del nostro gruppo è l'identificazione di leggi quantitative generali nell'evoluzione del genoma.

Abbiamo sviluppato una serie di strumenti computazionali per ricostruire automaticamente le reti di regolazione genica a partire da dati ad alta produttività, che sono resi disponibili attraverso il SIB.

Il gruppo sviluppa la risorsa al SIB Swiss Regulon, un portale di genomica regolatoria