Riuniamo comunità interdisciplinari, armonizziamo e colleghiamo dati diversi e forniamo infrastrutture di ricerca su larga scala, il tutto a livello nazionale e internazionale. Ciò consente importanti progressi per la salute umana e del pianeta, massimizza gli investimenti pubblici nella scienza e promuove la reputazione, la sovranità e la competitività della Svizzera.
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Federazione della comunità svizzera di bioinformatica
Il SIB riunisce la comunità nazionale di bioinformatica attraverso una rete di gruppi affiliati, i cui leader sono esperti riconosciuti nel settore. Le loro istituzioni ospitanti sono partner del SIB e rappresentano le principali istituzioni accademiche e di ricerca della Svizzera.
Federare questa comunità è di fondamentale importanza per la Svizzera – e fa parte del nostro mandato da parte della Segreteria di Stato per la formazione, la ricerca e l'innovazione (SEFRI) – per mantenere la bioinformatica svizzera all'avanguardia nel campo delle scienze della vita e dell'innovazione a livello mondiale. Questa capacità, unica nel Paese, massimizza anche l'impatto degli investimenti pubblici e privati aumentando l'interoperabilità dei dati, sviluppando standard comuni in linea con quelli internazionali e facilitando la collaborazione scientifica.
Il SIB offre alla sua rete nazionale attività congiunte per la condivisione delle migliori pratiche e la promozione della collaborazione, ad esempio sotto forma di focus group. Il SIB organizza anche eventi scientifici e conferenze e fornisce supporto in settori che vanno dalla gestione delle sovvenzioni e dalla promozione scientifica alla consulenza legale o al trasferimento tecnologico. Il filo conduttore di tutte queste attività è l'eccellenza scientifica e la collaborazione.
Infine, questa rete nazionale conferisce al SIB la legittimità di rappresentare la Svizzera nelle iniziative relative alla bioinformatica sulla scena internazionale e di aumentare la visibilità del nostro Paese nell'eccellenza scientifica e nell'innovazione.
Collegare la bioinformatica svizzera alle iniziative globali in materia di dati
La comunità svizzera di bioinformatica deve essere collegata alle iniziative internazionali per evitare che i ricercatori rimangano isolati nel panorama scientifico. Attraverso attività quali la definizione e l'attuazione di standard internazionali per aumentare l'interoperabilità dei dati, la partecipazione a iniziative federate come nodo svizzero o la guida di pacchetti di lavoro a livello europeo (vedi sotto), il SIB sta rafforzando il profilo della Svizzera nel mondo.
Il SIB ha instaurato legami e collaborazioni con organizzazioni globali quali:
- ELIXIR, l'organizzazione intergovernativa che riunisce le risorse nel campo delle scienze della vita di tutta Europa, di cui il SIB è il nodo svizzero. Il nostro coinvolgimento abbraccia una vasta gamma di argomenti, dalla manutenzione di software e banche dati svizzeri aperti per le scienze della vita attraverso il Service Delivery Plan, alla co-direzione di pacchetti di lavoro in progetti o piattaforme europei. Un esempio significativo è la co-direzione degli sforzi europei per promuovere la condivisione aperta dei dati genomici SARS-CoV-2 nel progetto ELIXIR-CONVERGE.
Risorse SIB selezionate come ELIXIR Core Data Resources
- La Global Alliance For Genomics & Health (GA4GH), un'organizzazione mondiale che mira a consentire la condivisione responsabile dei dati genomici e di cui il SIB è membro.
- La Global Biodata Coalition, il forum per i finanziatori della ricerca volto a promuovere una gestione efficiente e la crescita delle risorse di biodati in tutto il mondo. Il nostro istituto ha contribuito alla sua creazione e i nostri ex direttori esecutivi fanno ora parte del comitato consultivo scientifico.
Le risorse al SIB selezionate come risorse globali fondamentali di biodati
Realizzazione di infrastrutture di ricerca nazionali e internazionali
Grazie alle nostre attività di coordinamento nazionale, il nostro istituto è naturalmente posizionato per creare infrastrutture nazionali o internazionali, sia nel campo dei dati di ricerca aperti (ORD) che dei dati di ricerca clinica.
Coordinamento dei dati di ricerca aperti
Sin dalla sua fondazione, il SIB si è impegnato a favore della scienza aperta e della diffusione dei principi FAIR il più ampiamente possibile. ORD è coordinato al SIB attraverso le risorse aperte sviluppate dai suoi membri, che costituiscono elementi fondamentali per l'attuazione della scienza aperta.
Stiamo ulteriormente promuovendo la scienza aperta in Svizzera e in Europa attraverso il nostro coinvolgimento nell'European Open Science Cloud (EOSC), un'iniziativa strategicamente importante che consente ai ricercatori di accedere e condividere dati e servizi di ricerca attraverso le discipline e i confini. Il SIB è membro dell'Associazione EOSC, partner in vari progetti EOSC per garantire la conservazione a lungo termine, l'affidabilità e la reperibilità delle risorse di dati europee, nonché partner in una collaborazione svizzera per collegare i dati, i servizi e le infrastrutture di ricerca nazionali con EOSC.
Coordinamento dei dati della ricerca clinica
Molti progetti europei pubblico-privati che affrontano il diabete, il cancro o l'obesità si affidano alla nostra esperienza per il coordinamento, la gestione e l'analisi di dati sensibili provenienti da diversi paesi. Agendo regolarmente come Data Coordination Centre in questi progetti, soddisfiamo l'esigenza fondamentale di un partner affidabile, neutrale ed efficiente, in grado di interagire con attori del settore privato e del mondo accademico e di superare complesse sfide scientifiche e legali attraverso soluzioni tecniche innovative. Il nostro approccio federato all'analisi e alla banca dati è un esempio di queste soluzioni: scoprite come lo abbiamo applicato nel contesto di un progetto per la lotta al diabete.
Esplora i nostri contributi ai progetti pubblico-privati europei
Coordiniamo anche i dati della ricerca clinica in grandi infrastrutture nazionali come la Swiss Personalized Health Network (SPHN), che rende i dati sanitari interoperabili e condivisibili per la ricerca in Svizzera. In questo contesto, abbiamo anche implementato e continuiamo a coordinare BioMedIT, che fornisce infrastrutture informatiche sicure, servizi e competenze per la ricerca biomedica in Svizzera. La SPHN è sotto la responsabilità dell'Accademia Svizzera delle Scienze Mediche (SAMS) in collaborazione con il SIB.
Supportiamo ulteriormente la ricerca clinica, la sorveglianza dei patogeni e la diagnostica attraverso soluzioni infrastrutturali che coordiniamo e sviluppiamo nell'ambito di grandi consorzi. Ne sono un esempio il Centro di bioinformatica dei patogeni, che rafforza l'infrastruttura bioinformatica e la collaborazione tra le parti interessate per la preparazione alle epidemie a livello nazionale e globale, e SwissGenVar, un'iniziativa nazionale che collega tutte le principali istituzioni accademiche di genetica medica in Svizzera.
Coordinamento dei dati ambientali
Anche i ricercatori e gli operatori nel campo della conservazione si affidano alla nostra competenza in materia di dati per ottenere informazioni utili alla protezione dell'ambiente. Nel progetto Biodiversity Meets Data, ad esempio, stiamo facilitando l'uso di dati diversificati sulla biodiversità e sull'ambiente provenienti da più fonti, consentendo l'utilizzo di tali dati per il monitoraggio e la valutazione della biodiversità europea su una scala finora impossibile.