UniProt erhält fast die Hälfte der heute angekündigten neuen Fördermittel aus dem Programm „Horizon Europe“, um drei wichtige Biodatenressourcen für die Lebenswissenschaften und die Biotechnologie zu sichern. An der Förderung sind die beiden europäischen Mitentwickler beteiligt: das SIB und das Europäische Bioinformatik-Institut des EMBL (EMBL-EBI). Dies unterstreicht den entscheidenden Wert von vier Jahrzehnten Schweizer Expertise in der Kuratierung und Verwaltung von Proteindaten für die Wettbewerbsfähigkeit Europas, die Datenhoheit und die Fähigkeit, gesundheitliche und ökologische Herausforderungen zu bewältigen. Zudem stärkt es die wichtige Bereitstellung offener Daten und Kenntnisse durch das SIB, die Forschung, Innovation und vertrauenswürdige KI untermauern.
Unterstützung von Biodaten-Ressourcen von strategischer Bedeutung für Europa
Die Europäische Kommission hat heute insgesamt 57 Millionen Euro zur Sicherung von drei Biodaten-Ressourcen angekündigt, um sicherzustellen, dass Forscher und Innovatoren weiterhin offenen und zuverlässigen Zugang zu wesentlichen Informationen über Gene, Proteine und wissenschaftliche Entdeckungen haben.
Neben UniProt handelt es sich dabei um: GENCODE, die Referenz-Genannotation des menschlichen und des Mausgenoms, die vom EMBL-EBI in Zusammenarbeit mit dem Centre for Genomic Regulation (CRG; 19 Millionen Euro) betrieben wird; sowie Europe PMC, das vom EMBL-EBI verwaltete Open-Access-Repositorium für Literatur aus den Lebenswissenschaften (8 Millionen Euro). Die Finanzierung steht unter dem Vorbehalt der Bewertung der Fördervereinbarungen gemäß den üblichen Verfahren von „Horizon Europe“.
Neue Finanzierungsquelle unterstützt die langfristige Nachhaltigkeit von UniProt
UniProt beschleunigt den wissenschaftlichen Fortschritt, Innovationen und die Entwicklung zuverlässiger KI-Systeme, indem es hochwertige, frei zugängliche Daten und Erkenntnisse zu Hunderten von Millionen Proteinen aus dem gesamten Stammbaum des Lebens bereitstellt. Als Beweis für ihre grundlegende Bedeutung für die Lebenswissenschaften und die Innovation wird die Ressource in über 200'000 wissenschaftlichen Publikationen und Patentveröffentlichungen erwähnt, sorgt für enorme Effizienzgewinne bei den Nutzern und war eine wesentliche Quelle für Trainingsdaten für AlphaFold – die mit dem Nobelpreis ausgezeichnete KI, die die Wirkstoffforschung, die Biotechnologie und weitere Bereiche durch die Vorhersage der 3D-Struktur von Proteinen revolutioniert hat (siehe unten). Diese Bedeutung spiegelt sich in ihrer Anerkennung als SIB-Ressource, ELIXIR Core Data Resource und globale Kern-Biodatenressource wider.
Unterstützung von Biodaten-Ressourcen von strategischer Bedeutung für Europa
Die Europäische Kommission hat heute insgesamt 57 Millionen Euro zur Sicherung von drei Biodaten-Ressourcen angekündigt, um sicherzustellen, dass Forscher und Innovatoren weiterhin offenen und zuverlässigen Zugang zu wesentlichen Informationen über Gene, Proteine und wissenschaftliche Entdeckungen haben.
Neben UniProt handelt es sich dabei um: GENCODE, die Referenz-Genannotation des menschlichen und des Mausgenoms, die vom EMBL-EBI in Zusammenarbeit mit dem Centre for Genomic Regulation (CRG; 19 Millionen Euro) betrieben wird; sowie Europe PMC, das vom EMBL-EBI verwaltete Open-Access-Repositorium für Literatur aus den Lebenswissenschaften (8 Millionen Euro). Die Finanzierung steht unter dem Vorbehalt der Bewertung der Fördervereinbarungen gemäß den üblichen Verfahren von „Horizon Europe“.
Die Wissensdatenbank benötigt stabile, nachhaltige Unterstützung, um einen unterbrechungsfreien Zugang zu gewährleisten, mit neuen Technologien und der stetig wachsenden Datenmenge zu Proteinen Schritt zu halten sowie sich an die sich wandelnden Bedürfnisse von Forschern, Industrie und KI-Entwicklern anzupassen. Derzeit profitieren die mehr als 100 Mitarbeiter, die UniProt an den drei Partnerinstitutionen – SIB, EMBL-EBI und der Protein Information Resource (PIR) – von der langjährigen Unterstützung durch die US-amerikanischen National Institutes of Health (NIH), das Schweizer Staatssekretariat für Bildung, Forschung und Innovation (SBFI) und das EMBL sowie von der jüngeren, kurzfristigeren Unterstützung durch die Novo Nordisk Foundation.
Die neue „Horizon Europe“-Förderung in Höhe von 30 Millionen Euro sorgt für eine weitere Diversifizierung und gibt der Nachhaltigkeit von UniProt einen willkommenen Schub. Die ab 2027 für bis zu sieben Jahre verfügbaren Mittel sollen die wissenschaftliche und technische Arbeit unterstützen, die erforderlich ist, um die Ressource zu pflegen, ihre Proteinsequenzen zu kuratieren (siehe unten) und mit dem wachsenden Volumen an biologischen Daten Schritt zu halten.
Die Förderung spiegelt das Engagement der EU für offene Wissenschaft und den Erhalt der für die internationale Forschungszusammenarbeit erforderlichen Infrastruktur wider.
Die Stärke Europas liegt in der Kombination aus nationalen Kompetenzen von Weltklasse und einer intensiven grenzüberschreitenden Zusammenarbeit. Diese Investition baut auf diesem einzigartigen Modell auf und verbindet komplementäres Fachwissen und Infrastruktur auf dem gesamten Kontinent, um die Wettbewerbsfähigkeit Europas in den Bereichen Wissenschaft, KI und Biotechnologie zu stärken.
Bestätigung der unverzichtbaren Schweizer Fachkompetenz im Bereich Biodaten
Das SIB entwickelt und pflegt die von Experten kuratierte Swiss-Prot-Knowledgebase von UniProt, die 1986 in Genf von Amos Bairoch ins Leben gerufen wurde, der später das SIB gründete. Zu den Aufgaben des Teams gehören:
- Qualitätskontrolle von Proteinsequenzen;
- die fachkundige Annotation von Proteinsequenzen mit verifizierten, aktuellen Informationen zu deren Struktur und Funktion, die aus der wissenschaftlichen Literatur zusammengestellt werden;
- Entwicklung von KI-Tools zur Verbesserung und Beschleunigung dieser Datenkuratierung;
- die Gewährleistung der Interoperabilität mit anderen Datenbanken und Wissensdatenbanken durch Metadaten- und Annotationsstandards wie Rhea für enzymatische Reaktionen und Gene Ontology für Funktionen;
- die Gewährleistung, dass das Wissen sowohl maschinenlesbar als auch für Menschen zugänglich ist.
Der Nutzen dieser Arbeit für die wissenschaftliche Gemeinschaft wurde in einer unabhängigen Studie aus dem Jahr 2025 quantifiziert, die die Effizienzgewinne für die Nutzer auf 373–565 Millionen Euro pro Jahr bezifferte – das 25- bis 39-Fache der durchschnittlichen jährlichen Betriebskosten von UniProt. Die Arbeit trägt zudem zu vertrauenswürdiger KI bei: Die Entwickler des mit dem Nobelpreis ausgezeichneten AlphaFold nutzten beispielsweise die Expertenannotationen, um die Leistung des Modells zu verstehen und Fehler zu beheben.
Die Entscheidung der EU, in UniProt zu investieren, und die Wahl des SIB als wichtigen Partner für die Umsetzung dieser Arbeit stärken die Position der Schweiz als internationaler Knotenpunkt für hochwertige Daten, KI-Fachwissen und Zusammenarbeit.
Da KI die Forschung und Innovation in den Lebenswissenschaften beschleunigt, wächst der Bedarf an zuverlässigen Daten und Wissen stetig. Diese ergänzende Förderung durch „Horizon Europe“ wird dazu beitragen, dass Wissenschaftler, Kliniker, Innovatoren und KI-Entwickler weiterhin Zugang zu der wachsenden Sammlung hochwertiger, von Experten kuratierter Informationen über Proteine in UniProt haben.
