Wir wandeln unstrukturierte öffentliche und proprietäre Daten in analysefertige, FAIR*-konforme Datensätze um: qualitätsgeprüft, annotiert, standardisiert und nachvollziehbar.
Unsere Experten unterstützen die Datenbasis Ihres Projekts durch:
- biologische und biomedizinische Daten zu extrahieren, neu zu formatieren und zwischen Systemen zu migrieren, um die Datenkonsistenz und die Rückverfolgbarkeit von Abfragen sicherzustellen;
- die langfristige Verwaltung und Speicherung von Biodaten sicherstellen;
- Erreichung von Zielen zur Dateninteroperabilität durch Datenannotation, Datenstandardisierung und föderierte Datenbanken – von lokaler bis internationaler Ebene sowie in regulierten oder akademischen Umgebungen (lesen Sie mehr über unsere Expertise im Bereich sensibler Daten);
- die Definition und Umsetzung von Datenmanagementplänen (DMP) für Forschungsvorhaben und Förderanträge.
*FAIR: Auffindbar, Zugänglich, Interoperabel und Wiederverwendbar
Machen Sie Ihre Daten FAIR, damit Sie sich auf das konzentrieren können, was Sie am besten können: Forschung und Entdeckung
Die Herausforderung
Unternehmen, Universitäten, Förderer, Datensatzverwalter und Verlage erwarten zunehmend, dass Daten FAIR sind, um die Zuverlässigkeit und das Innovationspotenzial der Datenanalyse durch gut annotierte Daten und Reproduzierbarkeit zu verbessern.
Unsere Lösung
Unabhängig davon, über welche biologischen oder biomedizinischen Daten Sie verfügen, wir verfügen über bewährte Fachkenntnisse, um diese FAIR zu machen und für die Veröffentlichung aufzubereiten. Dies ist Teil unserer Arbeit im Rahmen einer Reihe von Projekten, darunter mehrere europäische Projekte zu Diabetes, Krebs und Arthritis sowie andere Projekte, die sich mit verschiedenen Omics oder Daten unterschiedlicher biologischer Herkunft (z. B. Pflanzen, Bakterien, Pilze) befassen.
Harmonisierung Ihrer Datensätze zur Verbesserung der Gesundheitsversorgung
Die Herausforderung
Es fehlen interne Ressourcen, um mehrere Datensätze zu standardisieren und zu aggregieren.
Unsere Lösung
Wir organisieren große Datenbanken mit routinemäßigen Gesundheitsinformationen, klinischen Studien oder Forschungsdatensätzen, um diese mit öffentlichen Datensätzen zusammenzuführen.
Unterstützung bei der Identifizierung von antiinfektiösen und pro-metabolischen Naturstoffen
Die Herausforderung
Integrieren Sie große Mengen heterogener In-silico- und chemisch-biologischer Daten, um deren Austausch zwischen Partnern und die anschließende Datenanalyse zu ermöglichen.
Unsere Lösung
Wir erstellen eine RDF-Datenbank, die Daten aller Partner integriert und zentralisiert und die Datenverwaltung und -freigabe gemäß den FAIR-Prinzipien ermöglicht. Wir ermöglichen allen Partnern den Zugriff auf die resultierende Datenbank durch die Entwicklung einer benutzerfreundlichen Webseite. Dies tun wir beispielsweiseim Rahmen eines Sinergia-Projekts unter der Leitung der Universität Genf und der ETH Zürich, bei dem eine Bibliothek mit mehr als 15.500 Pflanzen erstellt und durchsucht wird, um neue Moleküle zur Behandlung von Tuberkuloseinfektionen sowie von Fettleibigkeit und den damit verbundenen Begleiterkrankungen zu finden.
