SIB ist Teil eines neu gestarteten paneuropäischen Projekts, das untersucht, wie Mikroorganismen die Klimaresilienz von Pflanzen und Nutzpflanzen verbessern können. MICROBES4CLIME wird Forschern ein integriertes Infrastrukturnetzwerk zur Verfügung stellen, um unser Wissen über die Wechselwirkungen zwischen Bodenmikroorganismen, Pflanzen und der Umwelt zu erweitern. An diesem ehrgeizigen Vorhaben sind 30 Partner aus 13 Ländern beteiligt, um den Datenaustausch zu diesem Thema zu verbessern. SIB vertritt ELIXIR und die Schweiz. Unsere Teams werden durch Wissensrepräsentation und Fachwissen im Bereich Environmental Bioinformatics dazu beitragen, schnellere Erkenntnisse aus verschiedenen Datenquellen zu gewinnen.
Über MICROBES4CLIMATE
Dieses Projekt zielt darauf ab, Nutzern und Forschern unabhängig von ihrem Standort einen effizienten Zugang zu einem Cluster komplementärer Forschungsinfrastrukturen von Weltklasse zu ermöglichen. Damit wird es möglich sein, neugiergetriebene, interdisziplinäre Forschung zu terrestrischer Biodiversität und Ökosystemen, einschließlich landwirtschaftlicher und (agro-)forstwirtschaftlicher Ökosysteme, durchzuführen. Dies wird Aufschluss über die noch wenig verstandenen Wechselwirkungen zwischen Mikrobiomen im Boden und Pflanzen und deren Rolle bei der Reaktion auf den Klimawandel geben.
Die Rolle von Bodenmikroben durch vernetzte Infrastruktur aufdecken
Bodenmikroorganismen sind die zahlreichsten und vielfältigsten Lebewesen auf unserem Planeten. Sie spielen eine wichtige Rolle für verschiedene Lebensfunktionen, beispielsweise für die Gesundheit von Pflanzen. Angesichts der durch menschliche Aktivitäten stark bedrohten terrestrischen Biodiversität und Ökosysteme ist es von entscheidender Bedeutung, diese Wechselwirkungen zwischen Pflanzen und Mikroorganismen und ihr Potenzial für die Widerstandsfähigkeit besser zu verstehen.
Solche Untersuchungen sind jedoch äußerst datenintensiv, sowohl hinsichtlich der heterogenen Datentypen, die genutzt werden müssen, als auch hinsichtlich ihres schieren Volumens, und erfordern daher eine groß angelegte Koordinierung der vorhandenen Ressourcen, modernstes Daten-Know-how und den Aufbau von Kapazitäten.
SIB ist Teil des neu gestarteten und von der EU finanzierten Projekts MICROBES4CLIMATE, das sich dieser Herausforderung stellen will. Das Projekt sieht vor, eine breite Gemeinschaft von Wissenschaftlern durch ein integriertes Netzwerk spezialisierter Forschungsinfrastrukturen (RIs) in ganz Europa zu stärken, das wichtige Ressourcen und Dienstleistungen bereitstellt und sich an den Grundsätzen der offenen Forschungsdaten orientiert. Auf diese Weise werden mehr Erkenntnisse gewonnen und allgemein zugänglich gemacht, während die Notwendigkeit kostspieliger Neugenerierung von Daten in Experimenten reduziert wird.
Wissensrepräsentation für schnellere Erkenntnisse
Um Zusammenhänge zwischen Daten zu visualisieren, ist die Wissensrepräsentation hilfreich, damit Forscher herausfinden können, welche anderen Themen für ihre Ergebnisse relevant sind. SIB wird sein Fachwissen im Bereich der Wissensrepräsentation einbringen, um intuitive Abfragen zwischen Datensätzen zu ermöglichen, wodurch mehr Forscher schneller Erkenntnisse gewinnen können. Dieser Beitrag zu MICROBES4CLIMATE wird von unserer Abteilung für Wissensrepräsentation unter der Leitung von Tarcisio Mendes de Farias und Ana-Claudia Sima pilotiert. Diese Kompetenz wird in Großprojekten immer wichtiger und gefragter, wie die koordinierende Rolle von SIB in einem anderen europäischen Projekt, TRIPLE, zeigt , das kürzlich Fördermittel erhalten hat, um offene Forschungsdaten zu verwirklichen.
Die neu gegründete Gruppe Environmental Bioinformatics unter der Leitung von Robert Waterhouse wird ebenfalls einen Beitrag leisten und ihr Know-how bei der Entwicklung von datenwissenschaftlichen Lösungen für Umweltprobleme einbringen.
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Letztendlich wird das Projekt MICROBES4CLIMATE, das von der Microbial Resource Research Infrastructure MIRRI-ERIC koordiniert wird und dreißig Partner aus Europa und den USA zusammenbringt, den Weg für datengesteuerte Forschung ebnen, die unter anderem eine nachhaltige und widerstandsfähige Landwirtschaft ermöglicht.
