Il SIB fa parte di un progetto paneuropeo di recente avvio che studia come i microrganismi possano migliorare la resilienza climatica delle piante e delle colture. MICROBES4CLIMATE fornirà ai ricercatori una rete integrata di infrastrutture per potenziare le nostre conoscenze sull'interazione tra microrganismi del suolo, piante e ambiente. In questa ambiziosa impresa, 30 partner provenienti da 13 paesi si stanno unendo per potenziare la condivisione dei dati sull'argomento, con il SIB che rappresenta ELIXIR e la Svizzera. I nostri team saranno coinvolti nel consentire una comprensione più rapida delle fonti di dati, attraverso la rappresentazione delle conoscenze e le competenze in Environmental Bioinformatics.
Informazioni su MICROBES4CLIMATE
Questo progetto mira a fornire agli utenti e ai ricercatori, indipendentemente dalla loro ubicazione, un accesso efficiente a un cluster di infrastrutture di ricerca complementari di livello mondiale. Grazie a queste, sarà possibile condurre ricerche interdisciplinari guidate dalla curiosità che affrontano la biodiversità terrestre e gli ecosistemi, compresi quelli agricoli e (agro)forestali. Ciò farà luce sulle interazioni ancora poco comprese tra i microbiomi nel suolo e nelle piante e il loro ruolo nelle risposte ai cambiamenti climatici.
Svelare il ruolo dei microbi del suolo attraverso infrastrutture interconnesse
I microrganismi del suolo sono gli organismi viventi più numerosi e diversificati del pianeta. Svolgono un ruolo fondamentale in varie funzioni vitali, come la salute delle piante. Poiché la biodiversità terrestre e gli ecosistemi sono gravemente minacciati dalle attività umane, è fondamentale comprendere meglio queste interazioni tra piante e microrganismi e il loro potenziale di resilienza.
Tali ricerche richiedono tuttavia un'enorme quantità di dati, sia in termini di eterogeneità dei tipi di dati da utilizzare che di volume, e necessitano quindi di un coordinamento su larga scala delle risorse esistenti, di competenze all'avanguardia nel campo dei dati e dello sviluppo di capacità.
Il SIB fa parte del progetto MICROBES4CLIMATE, recentemente avviato e finanziato dall'UE, che mira ad affrontare questa sfida. Il progetto propone di potenziare un'ampia comunità di scienziati attraverso una rete integrata di infrastrutture di ricerca (RI) specializzate in tutta Europa, offrendo risorse e servizi chiave e allineandosi ai principi dei dati di ricerca aperti. In questo modo, sarà possibile acquisire maggiori conoscenze e renderle ampiamente accessibili, riducendo al contempo la necessità di rigenerare dati in esperimenti che spesso possono essere costosi.
Rappresentazione delle conoscenze per consentire analisi più rapide
Per visualizzare le connessioni tra i dati, la rappresentazione della conoscenza è preziosa per aiutare i ricercatori a scoprire quali altri argomenti sono rilevanti per i loro risultati. Il SIB contribuirà con la sua esperienza nella rappresentazione della conoscenza per consentire interrogazioni intuitive tra i set di dati, consentendo così a un maggior numero di ricercatori di raccogliere informazioni più rapidamente. Questo contributo a MICROBES4CLIMATE sarà guidato dalla nostra unità di rappresentazione della conoscenza, guidata da Tarcisio Mendes de Farias e Ana-Claudia Sima. Questa competenza è sempre più essenziale e ricercata nei progetti su larga scala, come dimostra il ruolo di coordinamento di Il SIB in un altro progetto europeo, TRIPLE, che ha recentemente ricevuto finanziamenti per rendere realtà i dati di ricerca aperti.
Anche il gruppo di Environmental Bioinformatics di recente costituzione, guidato da Robert Waterhouse, contribuirà e sfrutterà il proprio know-how nello sviluppo di soluzioni di scienza dei dati per affrontare le sfide ambientali.
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In definitiva, il progetto MICROBES4CLIMATE, coordinato dalla Microbial Resource Research Infrastructure MIRRI-ERIC e che riunisce trenta partner provenienti da tutta Europa e dagli Stati Uniti, aprirà la strada alla ricerca basata sui dati che consentirà un'agricoltura sostenibile e resiliente, oltre ad altri vantaggi.