scverse, eine Reihe grundlegender Tools für die Analyse von Einzelzell-Omics-Daten, wurde mit dem SIB Bioinformatik Innovative Resource Award 2025 ausgezeichnet. Die Jury war besonders beeindruckt von scverses Fokus auf Interoperabilität, Benutzerfreundlichkeit und Community-Management sowie seiner soliden Governance und der Betonung offener Wissenschaftsprinzipien.Der Forschungssoftware-Ingenieur Ilan Gold, der die Auszeichnung im Namen des Entwicklungsteams des Theis Lab entgegennahm, setzte sich nach der Zeremonie mit uns zusammen, um uns über die Bedeutung dieser Auszeichnung zu berichten.
Wie wird die Auszeichnung Ihrer Arbeit in Zukunft helfen?
Um scverse zu einer erfolgreichen Ressource zu machen, waren viele verschiedene Fähigkeiten erforderlich. Es fühlt sich sehr gut an, dafür und für die gesamte damit verbundene Arbeit Anerkennung und externe Bestätigung zu erhalten. Die Anerkennung wird von praktischem Nutzen sein. Unsere größte Herausforderung als Konsortium besteht darin, Informationen über scverse zu verbreiten. Diese Auszeichnung eröffnet uns neue Möglichkeiten, mehr Forscher zu unseren Konferenzen einzuladen, Praktika anzubieten und Studenten einzustellen. Vielleicht hat dieser Student eine großartige Idee, die zu einem Stipendium führt, und daraus entsteht dann der nächste Zweijahresvertrag für einen Entwickler.
Haben Sie einen Rat für zukünftige Generationen von Bioinformatikern?
Als Softwareentwickler ist es wichtig, sich nicht zu viel vorzunehmen und schrittweise Fortschritte zu schätzen. Es ist in Ordnung, ein Paket zu veröffentlichen, das nur eine begrenzte Anzahl von Funktionen erfüllt. Wenn das Paket gut funktioniert und hinsichtlich Eingabe, Ausgabe, Typen und Speicherorten sehr klar ist, werden die Leute die Einfachheit und Klarheit wirklich zu schätzen wissen.
Das sieht man häufig bei JavaScript. Es gibt viele kleine Pakete, die kleine Aufgaben gut erfüllen. Sie werden am häufigsten heruntergeladen. Das liegt nicht nur daran, dass sie einfach sind, sondern auch daran, dass ihre Funktionen so klar definiert sind.
Außerdem möchte ich Bioinformatiker ermutigen, sich unbeschwert und frei zu fühlen, mit den Leuten zu sprechen, die Software warten, denn wir möchten wirklich von Ihnen hören. Wenn Sie einen Bedarf, einen Wunsch oder eine Funktion haben, die in scverse fehlt, wenden Sie sich gerne an uns. Wir möchten dieses Feedback.
Woran arbeiten Sie derzeit?
Mein Fokus liegt derzeit darauf, die Engpässe bei der Ein- und Ausgabe zu beseitigen. Ich konzentriere mich sehr darauf, die Zeit zu reduzieren, die zum Einlesen von Dateien in den Speicher oder zum Schreiben auf die Festplatte benötigt wird.