Christoph Zechner – Co-lauréat du prix SIB 2012 récompensant le meilleur article de fin d'études en bioinformatique en Suisse
Christoph Zechner a reçu ce prix conjointement avec Jakob Ruess, coauteur de la publication « Moment-based inference predicts bimodality in transient gene expression » (L'inférence basée sur les momentsprédit la bimodalité dans l'expressiongénique transitoire). Cet article s'inscrit dans le cadre des études supérieures de Christoph au sein de l'équipe de Heinz Koeppl à l'ETH Zurich.
Depuis 2017, Christoph est chef de groupe à l'Institut Max Planck de biologie cellulaire et de génétique moléculaire et au Centre de biologie des systèmes de Dresde, en Allemagne. Ses recherches portent sur le développement d'approches statistiques pour étudier le traitement des signaux biologiques. Pour en savoir plus sur les différents projets de recherche de l'équipe de Christoph, consultez la page web du groupe et suivez @zechnerlab sur Twitter.
À propos des SIB Bioinformatics Awards et de notre série d'entretiens « Rencontre avec les anciens lauréats des SIB Awards »
Lancés en 2008 dans le but de distinguer de jeunes bioinformaticiens en Suisse, les SIB Bioinformatics Awards ont depuis parcouru un long chemin : d'un seul prix national à trois prix différents aujourd'hui, récompensant 1) des bioinformaticiens internationaux en début de carrière (SIB Early Career Bioinformatician Award), 2) l'excellence au sein de la communauté suisse des doctorants (SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award) et 3) des ressources bioinformatiques innovantes (SIB Bioinformatics Resource Innovation Award). Au fil des ans, 21 prix ont été décernés, récompensant neuf lauréats pour leur début de carrière exceptionnel, dix étudiants diplômés pour l'excellence de leurs publications et deux ressources bioinformatiques pour leur caractère innovant.
En 2019, les SIB Bioinformatics Awards seront décernés pour la10e fois, ce qui sera l'occasion de retrouver les anciens lauréats et de leur demander où ils en sont dans leur carrière : cette interview fait partie d'une série qui vous invite à rencontrer les anciens lauréats des SIB Bioinformatics Awards.
À quel stade de votre carrière étiez-vous lorsque vous avez reçu le prix SIB ? Qu'avez-vous ressenti ? Quel était le principal centre d'intérêt de vos recherches à cette époque ?
J'étais étudiant diplômé à l'ETH Zurich dans le laboratoire de Heinz Koeppl. J'ai beaucoup apprécié cette expérience et j'y ai passé un excellent moment. Je travaillais en étroite collaboration avec Jakob Ruess (co-lauréat) et nous étions bien sûr très enthousiastes lorsque nous avons appris que nous avions remporté le prix. Dans notre article, nous avons développé une méthode statistique pour étudier l'hétérogénéité dans la régulation de la transcription.
Quels sont vos domaines de recherche actuels ?
De manière générale, nous voulons comprendre comment des cellules génétiquement identiques traitent et répondent de manière fiable à des signaux, même si leurs processus intracellulaires varient considérablement d'une cellule à l'autre. Dans mon groupe, nous développons des approches théoriques et statistiques pour étudier le traitement des signaux biologiques à différentes échelles. Plus récemment, nous nous sommes intéressés à la manière dont la compartimentation subcellulaire peut améliorer la fidélité de la régulation génétique et du traitement de l'information. Bien que nos travaux soient purement théoriques, nous collaborons étroitement avec nos partenaires expérimentaux du MPI-CBG et à l'étranger.
Selon vous, quelle est la découverte la plus fascinante rendue possible par la bioinformatique ?
Je pense que la plupart des découvertes actuelles reposent fortement sur la bioinformatique et l'informatique. Il m'est donc difficile d'en choisir une seule. En ce qui concerne mon travail, l'aspect le plus important de la bioinformatique est peut-être l'analyse d'images. La capacité à suivre et à quantifier des molécules, des compartiments et des cellules dans des organismes entiers offre une opportunité sans précédent de comprendre la biologie.
Qu'aimez-vous faire pendant votre temps libre ?
Je passe la plupart de mon temps libre à faire du VTT.
J'encourage les scientifiques à s'aventurer de temps à autre dans des domaines nouveaux et inconnus
Un message pour la future génération de bioinformaticiens ?
J'encourage les scientifiques à s'aventurer de temps à autre dans des domaines nouveaux et inconnus. Parfois, les meilleures opportunités se présentent lorsque l'on ne se limite pas à ce que l'on connaît déjà. Dans mon passé, les projets les plus passionnants sont arrivés de manière tout à fait inattendue.
