Lukas Burger – Lauréat du Prix SIB 2009 pour les jeunes bioinformaticiens
Lukas Burger a reçu le prix en 2009 pour son projet intitulé « Comment prédire les interactions physiques entre les résidus protéiques en se basant uniquement sur des données séquentielles, à l'aide d'alignements multiples de séquences de protéines similaires » dans l'équipe du chef de groupe SIB Erik van Nimwegen au Biozentrum de l'Université de Bâle.
Dix ans plus tard, Lukas travaille comme chercheur associé en biologie computationnelle au sein du groupe de Dirk Schübeler à l'Institut Friedrich Miescher pour la recherche biomédicale (FMI) à Bâle. Lisez notre interview et visitez la page web du groupe Schübeler pour en savoir plus sur le travail de Lukas.
J'ai reçu ce prix à la fin de mon doctorat et j'ai été très honoré.
À propos des SIB Bioinformatics Awards et de notre série d'entretiens « Rencontre avec les anciens lauréats des SIB Awards »
Lancés en 2008 dans le but de distinguer de jeunes bioinformaticiens en Suisse, les SIB Bioinformatics Awards ont depuis parcouru un long chemin : d'un seul prix national à trois prix différents aujourd'hui, récompensant 1) des bioinformaticiens internationaux en début de carrière (SIB Early Career Bioinformatician Award), 2) l'excellence au sein de la communauté suisse des doctorants (SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award) et 3) des ressources bioinformatiques innovantes (SIB Bioinformatics Resource Innovation Award). Au fil des ans, 21 prix ont été décernés, récompensant neuf lauréats pour leur début de carrière exceptionnel, dix étudiants diplômés pour l'excellence de leurs publications et deux ressources bioinformatiques pour leur caractère innovant.
En 2019, les SIB Bioinformatics Awards seront décernés pour la10e fois, ce qui sera l'occasion de retrouver les anciens lauréats et de leur demander où ils en sont dans leur carrière : cette interview fait partie d'une série qui vous invite à rencontrer les anciens lauréats des SIB Bioinformatics Awards.
À quel stade de votre carrière étiez-vous lorsque vous avez reçu le prix SIB ? Qu'avez-vous ressenti ? Quel était le principal centre d'intérêt de vos recherches à cette époque ?
J'ai reçu ce prix à la fin de mon doctorat et j'ai été très honoré. À cette époque, je m'intéressais à la prédiction des contacts protéiques et je commençais à m'intéresser à la génomique, en particulier aux méthodes permettant d'identifier les sites de liaison des protéines de liaison à l'ARN.
Quels sont vos domaines de recherche actuels ?
Régulation transcriptionnelle et épigénétique.
Selon vous, quelle est la découverte la plus fascinante rendue possible par la bioinformatique ?
L'assemblage de génomes à l'aide du séquençage aléatoire.
Qu'aimez-vous faire pendant votre temps libre ?
Lire, danser et jouer du piano.
Un message pour la future génération de bioinformaticiens ?
Il existe de nombreux domaines de recherche en bioinformatique et je ne peux évidemment parler que de la génomique, en particulier lorsqu'elle est appliquée à la recherche sur la régulation transcriptionnelle.
Pour moi, deux choses ont été déterminantes. Tout d'abord, j'ai eu la chance d'avoir d'excellents mentors, tant pendant mon doctorat qu'au FMI, qui m'ont enseigné les compétences nécessaires en matière de statistiques et d'analyse de données, ainsi que l'esprit critique scientifique. Ensuite, j'ai pu bénéficier d'une interaction étroite avec des biologistes, qui m'ont permis de comprendre les détails et les problèmes expérimentaux, ainsi que les questions biologiques sous-jacentes. Je recommanderais donc à toute personne souhaitant travailler dans un domaine similaire au mien d'interagir étroitement avec des personnes ayant une formation théorique ou statistique et avec des biologistes.
