Hannes Röst – Lauréat du prix SIB 2015 du meilleur article de fin d'études en bioinformatique
Hannes a reçu ce prix pour son mémoire intitulé « OpenSWATH permet l'analyse automatisée et ciblée de données MS acquises indépendamment des données », qui s'inscrivait dans le cadre de ses études doctorales au sein de l'équipe de Rudolf Aebersold à l'Institut de biologie moléculaire et systémique de l'ETH Zurich.
Quatre ans plus tard, Hannes est devenu professeur assistant à l'Université de Toronto au Canada. Avec son équipe, il développe des algorithmes open source pour analyser des données de spectrométrie de masse en vue de leur intégration avec d'autres données omiques dans le contexte de la santé humaine et des maladies. Pour en savoir plus sur les projets du groupe de Hannes, consultez la page web du groupe et suivez @hroest sur Twitter.
À propos des SIB Bioinformatics Awards et de notre série d'entretiens « Rencontre avec les anciens lauréats des SIB Awards »
Créés en 2008 dans le but de distinguer les jeunes bioinformaticiens en Suisse, les SIB Bioinformatics Awards ont depuis parcouru un long chemin : d'un seul prix national à trois prix différents aujourd'hui, récompensant 1) des bioinformaticiens internationaux en début de carrière (SIB Early Career Bioinformatician Award), 2) l'excellence au sein de la communauté suisse des doctorants (SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award) et 3) des ressources innovantes en bioinformatique (SIB Bioinformatics Resource Innovation Award). Au fil des ans, 21 prix ont été décernés, récompensant neuf lauréats pour leur début de carrière exceptionnel, dix étudiants diplômés pour leurs excellentes publications et deux ressources bioinformatiques pour leur caractère innovant.
En 2019, les SIB Bioinformatics Awards seront décernés pour la10e fois, ce qui sera une excellente occasion de prendre contact avec les anciens lauréats et de leur demander où ils en sont dans leur carrière : cette interview fait partie d'une série qui vous invite à rencontrer les anciens lauréats des SIB Bioinformatics Awards.
À quel stade de votre carrière étiez-vous lorsque vous avez reçu le prix SIB ? Qu'avez-vous ressenti ? Quel était le principal centre d'intérêt de vos recherches à cette époque ?
Lorsque j'ai reçu le prix SIB, je venais de terminer mon doctorat et j'étais sur le point d'entamer un postdoctorat à l'université de Stanford afin d'appliquer mes recherches en spectrométrie de masse computationnelle au domaine de la médecine personnalisée. Ce fut formidable de voir mes recherches récompensées. Ce prix m'a été extrêmement utile, tant pour soutenir mes recherches que pour obtenir des subventions par la suite.
Quels sont vos domaines de recherche actuels ?
Bioinformatique, spectrométrie de masse, protéomique, métabolomique, médecine personnalisée
Selon vous, quelle est la découverte la plus fascinante rendue possible par la bioinformatique ?
La capacité à mesurer quantitativement les phénotypes moléculaires à l'aide de technologies à haut débit (génome, transcriptome, protéome, métabolome) a été rendue possible par les progrès de la technologie et de la bioinformatique. Ces nouvelles données ont révélé une image systémique des processus moléculaires dans la cellule et nous ont permis d'étudier chaque patient à un niveau de détail sans précédent.
Collaborez toujours, apprenez à communiquer et essayez toujours de comprendre les problèmes d'un point de vue informatique et biologique.
Un message pour la future génération de bioinformaticiens ?
Collaborez toujours, apprenez à communiquer et essayez toujours de comprendre les problèmes d'un point de vue informatique et biologique.
