José Aguilar-Rodríguez – Preisträger des SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award 2017
José Aguilar-Rodríguez erhielt die Auszeichnung für seine Arbeit„A thousand empirical adaptive landscapes and their navigability”(Tausendempirische adaptive Landschaften undihre Navigierbarkeit), die auf seiner Arbeit als Doktorand im Team von SIB-Gruppenleiter Andreas Wagner an der Universität Zürich basiert.
Derzeit ist José Aguilar-Rodríguez Postdoktorand im Labor von Dmitri Petrov am Department of Biology der Stanford University und im Labor von Daniel Jarosz am Department of Chemical & Systems Biology der Stanford University School of Medicine. Dort setzt er seine Forschungen fort, um besser zu verstehen, wie Genotypen in Phänotypen abgebildet werden, indem er untersucht, wie die Fitness oder der phänotypische Effekt einer Mutation durch die Umgebung und den genetischen Hintergrund, in dem sie auftritt, beeinflusst wird. Um mehr über Josés Arbeit zu erfahren, besuchen Sie seine Webseite und folgen Sie @jaguilarrod auf Twitter.
Über die SIB Bioinformatics Awards und unsere Interviewreihe «Treffen Sie die früheren Preisträger der SIB Awards»
Die SIB Bioinformatics Awardswurden 2008 ins Leben gerufen, um junge Bioinformatiker in der Schweiz auszuzeichnen. Seitdem haben sie sich weiterentwickelt: von einer einzigen nationalen Auszeichnung zu drei verschiedenen Preisen, mit denen heute 1) internationale Nachwuchsbi informatiker (SIB Early Career Bioinformatician Award), 2) herausragende Leistungen innerhalb der Schweizer Doktoranden-Community (SIB Best Swiss Bioinformatics Graduate Paper Award) und 3) innovative Bioinformatik-Ressourcen (SIB Bioinformatics Resource Innovation Award) ausgezeichnet werden. Im Laufe der Jahre wurden 21 Auszeichnungen verliehen, darunter neun Preisträger für ihre herausragende frühe Karriere, zehn Doktoranden für ihre exzellente Publikation und zwei Bioinformatik-Ressourcen für ihren innovativen Aspekt.
2019 werden die SIB Bioinformatics Awards zumzehnten Mal verliehen. Dies ist eine gute Gelegenheit, um mit früheren Preisträgern in Kontakt zu treten und sie zu fragen, wo sie heute in ihrer Karriere stehen: Dieses Interview ist Teil einer Serie, in der Sie ehemalige Preisträger der SIB Bioinformatics Awards kennenlernen können.
Was sind Ihre aktuellen Forschungsinteressen?
Meine Forschungsschwerpunkte sind die Evolution biologischer Systeme und die grundlegenden Organisationsprinzipien des Lebens. Genauer gesagt zielt meine Forschung darauf ab, aufzuklären, wie Genotypen in verschiedenen biologischen Systemen auf Phänotypen abgebildet werden, und wichtige Erkenntnisse für die Evolution, Entwicklung und Krankheiten zu gewinnen. Dieses Ziel ist breit genug gefasst, um viele der genetischen und evolutionären Phänomene zu erfassen, die mich faszinieren, wie Robustheit, Evolutionsfähigkeit, Epistase, Pleiotropie, phänotypische Heterogenität, Genexpressionsrauschen oder Proteinfehlübersetzung. In meiner Forschung versuche ich, die mechanistische Perspektive der Systembiologie in einen evolutionären Rahmen zu integrieren. Da ich am liebsten biologische Forschung betreibe, die Experimente mit Theorie verbindet, versuche ich während meiner Postdoc-Zeit meine experimentellen Fähigkeiten zu verbessern, ohne dabei die computergestützten und quantitativen Fähigkeiten zu vernachlässigen, die ich während meiner Promotion in Zürich erworben habe.
Was ist Ihrer Meinung nach die faszinierendste Entdeckung, die durch die Bioinformatik ermöglicht wurde?
Die rechnergestützten Werkzeuge der Bioinformatik haben in Kombination mit Sequenzierungstechnologien der nächsten Generation revolutionäre Veränderungen in Bereichen wie Populationsgenetik, quantitative Genetik oder mikrobielle Ökologie und Evolution bewirkt. Es gibt einfach zu viele Entdeckungen, die dank der Verbindung zwischen Bioinformatik und Hochdurchsatztechnologien in diesen Bereichen gemacht wurden, um nur eine hervorzuheben. Wenn ich jedoch gezwungen wäre, eine aus der Geschichte der Bioinformatik auszuwählen, würde ich mich für die Erkenntnis von Zuckerkandl und Pauling in den frühen sechziger Jahren entscheiden, dass Biomoleküle (DNA und Proteine) Informationsträger sind, die als „Dokumente der Evolutionsgeschichte” zur Rekonstruktion der „Genealogie” des Lebens verwendet werden können.
Was machst du gerne in deiner Freizeit?
Ich liebe es, Bücher zu lesen. In letzter Zeit fasziniert mich die klassische Antike und ich lese hauptsächlich über das antike Griechenland, aber im Allgemeinen sind meine Leseinteressen sehr breit gefächert und reichen von Science-Fiction bis zur Wissenschaftsgeschichte. Ich habe eine große Abenteuerlust, die ich mit Reisen um die Welt zu stillen versuche, vor allem um antike Ruinen oder Naturlandschaften zu besuchen, und jetzt genieße ich die natürliche Schönheit Kaliforniens beim Wandern oder Campen. Diesen Sommer möchte ich mir Zeit nehmen, um meine Segelkenntnisse in der Bucht von San Francisco zu verbessern und Tauchen zu lernen. Außerdem schwimme ich gerne und verbringe Zeit mit guten Freunden.
Ich sehe die Bioinformatik als ein sehr leistungsfähiges Werkzeug, um biologische Entdeckungen in Verbindung mit experimentellen Hochdurchsatztechnologien zu ermöglichen
Haben Sie einen Rat für die nächste Generation von Bioinformatikern?
Ich sehe die Bioinformatik als ein sehr leistungsfähiges Werkzeug, das in Verbindung mit experimentellen Hochdurchsatztechnologien biologische Entdeckungen ermöglicht. Daher halte ich es für entscheidend, ein tiefes Verständnis der biologischen Systeme zu haben, die von Interesse sind, sowie der Details der experimentellen Methoden, mit denen die zu analysierenden Daten generiert werden. In diesem Sinne halte ich es auch für sehr wichtig, nie zu vergessen, dass ein Bioinformatiker trotz eines soliden theoretischen oder statistischen Hintergrunds in erster Linie ein Biologe sein sollte, der versucht, Fragen zu lebenden Systemen zu beantworten. Und es ist eine wirklich faszinierende Zeit für Biologen, mit vielen spannenden Möglichkeiten für junge Wissenschaftler!
