Die UNCAN-Plattform wird Forschern einen sicheren Zugang zu einem großen Pool kuratierter und harmonisierter Krebsdaten ermöglichen und so die Entdeckung dringend benötigter neuer Therapieansätze beschleunigen. Das SIB leitet die Arbeiten zur Gewährleistung der Interoperabilität und hohen Qualität der Daten innerhalb dieser föderierten Plattform, unter anderem durch neue KI-Tools zur Datenharmonisierung. Die Plattform wurde von der gemeinsamen öffentlich-privaten Partnerschaft UNCAN-Connect der EU und der Schweiz entwickelt und wird zur Umsetzung der EU-Krebsmission, zur Unterstützung des Europäischen Gesundheitsdatenraums und zur Förderung der Schweizer Strategie «Gesundheit 2030» beitragen.
Eine neue Ära vertrauenswürdiger grenzüberschreitender Datenaustausch
Die EU-Krebsmission zielt darauf ab, die Krebsprävention, -erkennung und -behandlung bis 2030 zu verbessern, indem sie Forschung, Innovation und Gesundheitspolitik auf eine Weise vereint, die durch isolierte Studien und Massnahmen auf nationaler, regionaler oder lokaler Ebene nicht erreicht werden kann.
Die UNCAN-Plattform ist das Datenrückgrat der Mission. Ihre Entwicklung ist nicht nur an sich ein Durchbruch in der Forschungsinfrastruktur, sondern wird auch Wissen und Fachkompetenz generieren, die mit dem European Health Data Space im Einklang stehen – einer neuen Verordnung für die sichere Nutzung und den Austausch aller elektronischen Gesundheitsdaten in der gesamten EU.
UNCAN-Connect bringt 53 Forschungseinrichtungen, Unternehmen und Patientenorganisationen aus 19 Ländern zusammen, um die Plattform aufzubauen, und folgt dabei einem Konzept, das in einem früheren EU-Projekt namens 4.UNCAN.eu entwickelt wurde. SIB ist auch Partner des ergänzenden EU-Projekts CANDLE (National CAncer data Node DeveLopErs), das die Umsetzung der UNCAN-Plattform unterstützen wird. CANDLE startete im Juni und vereint 40 Partner aus 20 europäischen Ländern.
Aufbau der nächsten Generation der One Health-Dateninfrastruktur
In den vergangenen 175 Jahren folgte auf jeden Durchbruch in der Krebsbehandlung ein Durchbruch in Wissenschaft und Technik. Die Strahlentherapie entstand kurz nach der Entdeckung der Röntgenstrahlen, die Chemotherapie nach der Entwicklung der chemischen Synthese und zuletzt die Immuntherapie nach Fortschritten in der Gentechnik. Obwohl diese bahnbrechenden Therapien unzählige Leben gerettet haben, ist Krebs in Europa immer noch für jeden vierten Todesfall verantwortlich – und wird ohne weitere Innovationen voraussichtlich bis 2035 zur häufigsten Todes- und Krankheitsursache in der Region werden.
Eine neue Ära vertrauenswürdiger grenzüberschreitender Datenaustausch
Die EU-Krebsmission zielt darauf ab, die Krebsprävention, -erkennung und -behandlung bis 2030 zu verbessern, indem sie Forschung, Innovation und Gesundheitspolitik auf eine Weise vereint, die durch isolierte Studien und Massnahmen auf nationaler, regionaler oder lokaler Ebene nicht erreicht werden kann.
Die UNCAN-Plattform ist das Datenrückgrat der Mission. Ihre Entwicklung ist nicht nur an sich ein Durchbruch in der Forschungsinfrastruktur, sondern wird auch Wissen und Fachkompetenz generieren, die mit dem European Health Data Space im Einklang stehen – einer neuen Verordnung für die sichere Nutzung und den Austausch aller elektronischen Gesundheitsdaten in der gesamten EU.
UNCAN-Connect bringt 53 Forschungseinrichtungen, Unternehmen und Patientenorganisationen aus 19 Ländern zusammen, um die Plattform aufzubauen, und folgt dabei einem Konzept, das in einem früheren EU-Projekt namens 4.UNCAN.eu entwickelt wurde. SIB ist auch Partner des ergänzenden EU-Projekts CANDLE (National CAncer data Node DeveLopErs), das die Umsetzung der UNCAN-Plattform unterstützen wird. CANDLE startete im Juni und vereint 40 Partner aus 20 europäischen Ländern.
Die UNCAN-Plattform (UNderstand CANcer) zielt darauf ab, diesen nächsten Durchbruch zu beschleunigen, indem sie zwei aktuelle Revolutionen nutzt – die Generierung riesiger Mengen an Daten aus den Lebenswissenschaften und die Entwicklung leistungsfähiger KI-Modelle. Die föderierte Plattform wird technische und governancebezogene Hindernisse überwinden, um vielfältige Krebsdaten in ganz Europa zu verknüpfen und zu katalogisieren, die Wissenschaftler, Kliniker, KI-Entwickler und andere Gesundheitsinnovatoren leicht finden und bündeln können, um neue Erkenntnisse über die Krebsbiologie zu gewinnen und neue Therapien zu entwickeln.
Das SIB ist Partner in dem von der EU und der Schweiz finanzierten Konsortium, das die Plattform namens UNCAN-Connect aufbaut. Unsere Wissenschaftler leiten die Arbeiten, um sicherzustellen, dass die in der Plattform hinterlegten klinischen und sonstigen Daten von hoher Qualität und harmonisiert sind, unter anderem durch den Einsatz modernster KI-Tools zur Angleichung der Daten an gemeinsame Standards. Diese Beiträge sowie diejenigen zum verwandten CANDLE-Projekt (siehe Kasten) bauen auf Erfahrungen bei der Koordination anderer innovativer gesundheitsbezogener Dateninitiativen auf, darunter der Schweizer Knotenpunkt des Federated European Genome-phenome Archive (FEGA), der europäische IMMUcan-Patientendatenatlas und das Swiss Personalized Health Network (SPHN).
Das UNCAN-Connect-Projekt wird dazu beitragen, die EU-Krebsmission in die Praxis umzusetzen – und als Grundlage für eine noch grössere Gesundheitsdateninitiative dienen, den in diesem Jahr verabschiedeten European Health Data Space (EHDS) (siehe Kasten). Es unterstützt zudem Schweizer Gesundheitsinitiativen wie die Strategie Health2030 und trägt zur Mission des SIB bei, fundiertes Wissen über biologische Daten, modernste Technologien und interdisziplinäre Kooperationen zu nutzen, um medizinische und gesundheitliche Innovationen voranzutreiben.
UNCAN ist ein Beispiel dafür, wie das SIB zur nächsten Generation transnationaler Gesundheitsinfrastrukturen in Europa und weltweit beiträgt – unter anderem durch die Bereitstellung von KI-fähigen Daten und die Entwicklung gesetzeskonformer nationaler Data Hubs für die Suche und den sicheren Austausch sensibler Patientendaten.
Harmonisierung und Qualitätskontrolle von Krebsdaten in ganz Europa
Das Projekt UNCAN-Connect wird Anwendungsfälle für sechs wichtige Krebsarten bereitstellen: Kinderkrebs, Lymphdrüsenkrebs, Bauchspeicheldrüsenkrebs, Eierstockkrebs, Lungenkrebs und Prostatakrebs. Die Daten stammen aus Krankenhäusern, Registern, Universitäten und Biobanken in den Partnerländern und werden mit bestehenden europäischen Forschungsinfrastrukturen wie ELIXIR verknüpft, dessen Schweizer Knotenpunkt das SIB ist. Es wird eine Vielzahl von Patienten- und Tumorinformationen gespeichert, darunter demografische, klinische und Lebensqualitätsdaten, genetische und molekulare Marker aus Genom-, Proteom- und anderen „Omik”-Analysen sowie Bilder von Tumoren und Organen.
Um neue Entdeckungen, auch durch KI, zu fördern, müssen diese Daten alle von gleichbleibend hoher Qualität sein, die gleichen Einheiten und Beschreibungen verwenden und die gleiche Struktur aufweisen, um eine zuverlässige und reproduzierbare Forschung zu ermöglichen. Die Wissenschaftler von das SIB werden die Projektpartner anleiten und koordinieren, um diese grundlegenden Anforderungen zu erfüllen, indem sie Richtlinien und Instrumente entwickeln, die Folgendes gewährleisten:
- vollständig interoperable Daten durch Standards für die Datenformatierung, -verarbeitung und -annotation, die den FAIR-Prinzipien (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable) und internationalen Richtlinien entsprechen und mit dem European Health Data Space (EHDS) und der EU-Datenschutz-Grundverordnung (DSGVO) in Einklang stehen;
- datenintegrität und Rückverfolgbarkeit durch eine formale Ablagerungspipeline und Herkunftsstandards;
- datenqualität durch ein spezielles Bewertungsinstrument.
Entwicklung innovativer KI-Tools für die Datenharmonisierung
Um die Umsetzung dieser Richtlinien zu erleichtern, werden unsere Wissenschaftler auch KI-Tools entwickeln, die Klinikern und Forschern dabei helfen, die in ihren Datensätzen verwendeten Begriffe den gängigen Standards zuzuordnen.
Das Projekt UNCAN-Connect entwickelt Instrumente und Infrastrukturen, die es uns ermöglichen, die riesigen Datenmengen von Krebspatienten, die in ganz Europa gesammelt wurden, zu nutzen und für Forscher zugänglich und nutzbar zu machen. Dies wird in den kommenden Jahrzehnten ein wichtiger Motor für neue Durchbrüche im Verständnis und in der Behandlung von Krebs sein.
Reference(s)
Bildnachweis: Keystone – Wissenschaftsfotobibliothek – Zephyr
