Trasformiamo dati pubblici e proprietari non strutturati in set di dati FAIR* pronti per l'analisi: sottoposti a controllo di qualità, annotati, standardizzati e tracciabili.
I nostri esperti supportano la struttura dei dati del vostro progetto attraverso:
- estraendo, riformattando e migrando dati biologici e biomedici tra i vari sistemi, per garantire la coerenza dei dati e la tracciabilità delle query;
- garantendo la gestione e l’archiviazione a lungo termine dei dati biologici;
- raggiungendo gli obiettivi di interoperabilità dei dati attraverso l’annotazione, la standardizzazione e l’utilizzo di database federati – su scala locale o internazionale e in contesti regolamentati o accademici (scopri di più sulla nostra competenza in materia di dati sensibili);
- definendo e implementando Piani di Gestione dei Dati (DMP) per proposte di ricerca e richieste di finanziamento.
*FAIR: reperibili (Findable), accessibili (Accessible), interoperabili (Interoperable) e riutilizzabili (Reusable)
Rendere i tuoi dati FAIR per permetterti di concentrarti su ciò che sai fare meglio: ricerca e scoperta
La sfida
Aziende, università, enti finanziatori, gestori di set di dati ed editori si aspettano sempre più spesso che i dati siano FAIR, al fine di migliorare l'affidabilità e il potenziale innovativo dell'analisi dei dati grazie a dati ben annotati e alla riproducibilità.
La nostra soluzione
Qualunque siano i dati biologici o biomedici di cui disponete, abbiamo una comprovata esperienza nel renderli FAIR e nel confezionarli in modo che siano pronti per la pubblicazione. Questo è ciò che facciamo nell'ambito di una serie di iniziative, come diversi progetti europei sul diabete, il cancro, l'artrite, nonché altri progetti che trattano dati multipli -omici o di diversa origine biologica (ad esempio piante, batteri, funghi).
Armonizzare i vostri set di dati per migliorare l'assistenza sanitaria
La sfida
Mancano le risorse interne per standardizzare più set di dati al fine di aggregarli.
La nostra soluzione
Organizziamo grandi database contenenti informazioni sanitarie di routine, dati relativi a sperimentazioni cliniche o ricerche per consentirne l'integrazione con i database pubblici.
Supportare l'identificazione di prodotti naturali anti-infettivi e pro-metabolici
La sfida
Integrare grandi volumi di dati eterogenei in silico e chemo-biologici per consentirne la condivisione tra i partner e la successiva analisi dei dati.
La nostra soluzione
Costruiamo un database RDF che integra e centralizza i dati di tutti i partner e consente la gestione e la condivisione dei dati secondo i principi FAIR. Consentiamo a tutti i partner di accedere al database risultante attraverso lo sviluppo di una pagina web di facile utilizzo. Questo è ciò che stiamo facendo nell'ambito di un progetto Sinergia guidato dall'Università di Ginevra e dall'ETH di Zurigo, ad esempio, con la creazione e l'estrazione di una libreria di oltre 15.500 piante per trovare nuove molecole per il trattamento dell'infezione da tubercolosi, dell'obesità e delle comorbilità ad esse associate.
