Nous transformons des données publiques et propriétaires non structurées en ensembles de données FAIR* prêts à être analysés : contrôlées en termes de qualité, annotées, normalisées et traçables.
Nos experts soutiennent la base de données de votre projet en :
- l'extraction, le reformatage et la migration de données biologiques et biomédicales d'un système à l'autre, afin de garantir la cohérence des données et la traçabilité des requêtes ;
- assurant la gestion et le stockage à long terme des données biologiques ;
- atteindre les objectifs d’interopérabilité des données grâce à l’annotation, à la normalisation des données et aux bases de données fédérées – à l’échelle locale comme internationale, et dans des environnements réglementés ou universitaires (pour en savoir plus, consultez notre expertise en matière de données sensibles) ;
- définissant et mettant en œuvre des plans de gestion des données (DMP) pour les propositions de recherche et les demandes de financement.
*FAIR : Findable (facilement trouvable), Accessible (accessible), Interoperable (interopérable) et Reusable (réutilisable)
Rendez vos données FAIR pour vous permettre de vous concentrer sur ce que vous faites le mieux : la recherche et la découverte
Le défi
Les entreprises, les universités, les bailleurs de fonds, les gestionnaires de jeux de données et les éditeurs attendent de plus en plus que les données soient FAIR, afin d’améliorer la fiabilité et le potentiel d’innovation de l’analyse des données grâce à des données bien annotées et à la reproductibilité.
Notre solution
Quelles que soient les données biologiques ou biomédicales dont vous disposez, nous avons une expertise éprouvée pour les rendre FAIR et les présenter sous une forme prête à être publiée. C'est ce que nous faisons dans le cadre de plusieurs projets européens sur le diabète, le cancer, l'arthrite, ainsi que d'autres projets traitant de multiples -omiques ou de données d'origine biologique diverse (par exemple, plantes, bactéries, champignons).
Harmoniser vos ensembles de données pour faire progresser les soins de santé
Le défi
Les ressources internes sont insuffisantes pour normaliser plusieurs ensembles de données afin de les agréger.
Notre solution
Nous organisons de grandes bases de données contenant des informations de santé courantes, des essais cliniques ou des ensembles de données de recherche afin de permettre leur fusion avec des ensembles de données publics.
Soutenir l'identification de produits naturels anti-infectieux et pro-métaboliques
Le défi
Intégrer de grands volumes de données hétérogènes in silico et chimio-biologiques afin de permettre leur partage entre les partenaires et leur analyse ultérieure.
Notre solution
Nous construisons une base de données RDF qui intègre et centralise les données de tous les partenaires, et permet la gestion et le partage des données selon les principes FAIR. Nous permettons à tous les partenaires d'accéder à la base de données ainsi constituée grâce au développement d'une page web conviviale. C'est ce que nous faisons dans le cadre d'un projet Sinergia mené par l'Université de Genève et l'ETH Zurich, par exemple, avec la création et l'exploitation d'une bibliothèque de plus de 15 500 plantes afin de trouver de nouvelles molécules pour traiter la tuberculose ainsi que l'obésité et les comorbidités associées.
