Die UNCAN-Plattform wird Forschern einen sicheren Zugang zu einem großen Pool kuratierter und harmonisierter Krebsdaten ermöglichen und so die Entdeckung dringend benötigter neuer Therapieansätze beschleunigen. Das SIB leitet die Arbeiten zur Gewährleistung der Interoperabilität und hohen Qualität der Daten innerhalb dieser föderierten Plattform, unter anderem durch neue KI-Tools zur Datenharmonisierung. Die Plattform wurde von der gemeinsamen öffentlich-privaten Partnerschaft UNCAN-Connect der EU und der Schweiz entwickelt und wird zur Umsetzung der EU-Krebsmission, zur Unterstützung des Europäischen Gesundheitsdatenraums und zur Förderung der Schweizer Strategie «Gesundheit 2030» beitragen.
Eine neue Ära vertrauenswürdiger grenzüberschreitender Datenaustausch
Die EU-Krebsmission zielt darauf ab, die Krebsprävention, -erkennung und -behandlung bis 2030 zu verbessern, indem sie Forschung, Innovation und Gesundheitspolitik auf eine Weise vereint, die durch isolierte Studien und Maßnahmen auf nationaler, regionaler oder lokaler Ebene nicht erreicht werden kann.
Die UNCAN-Plattform ist das Datenrückgrat der Mission. Ihre Entwicklung ist nicht nur ein Durchbruch in der Forschungsinfrastruktur an sich, sondern wird auch Wissen und Fachkenntnisse generieren, die mit dem European Health Data Space – einer neuen Verordnung für die sichere Nutzung und den Austausch aller elektronischen Gesundheitsdaten in der EU – im Einklang stehen.
UNCAN-Connect bringt 53 Forschungseinrichtungen, Unternehmen und Patientenorganisationen aus 19 Ländern zusammen, um die Plattform nach einem in einem früheren EU-Projekt entwickelten Konzept aufzubauen. Das SIB ist auch Partner des ergänzenden EU-Projekts CANDLE (National CAncer data Node DeveLopErs), das die Umsetzung der Plattform UNCAN.eu unterstützen wird. CANDLE wurde im Juni ins Leben gerufen und vereint 40 Partner aus 20 europäischen Ländern.
Aufbau der nächsten Generation der One Health-Dateninfrastruktur
In den letzten 175 Jahren folgte jeder Durchbruch in der Krebsbehandlung auf einen Durchbruch in Wissenschaft und Technologie. Die Strahlentherapie entstand kurz nach der Entdeckung der Röntgenstrahlen, die Chemotherapie nach der Entwicklung der chemischen Synthese und zuletzt die Immuntherapie nach Fortschritten in der Gentechnik. Obwohl diese bahnbrechenden Therapien unzählige Leben gerettet haben, ist Krebs immer noch für jeden vierten Todesfall in Europa verantwortlich – und ohne weitere Innovationen wird er bis 2035 voraussichtlich zur häufigsten Todes- und Krankheitsursache in der Region werden.
Eine neue Ära vertrauenswürdiger grenzüberschreitender Datenaustausch
Die EU-Krebsmission zielt darauf ab, die Krebsprävention, -erkennung und -behandlung bis 2030 zu verbessern, indem sie Forschung, Innovation und Gesundheitspolitik auf eine Weise vereint, die durch isolierte Studien und Maßnahmen auf nationaler, regionaler oder lokaler Ebene nicht erreicht werden kann.
Die UNCAN-Plattform ist das Datenrückgrat der Mission. Ihre Entwicklung ist nicht nur ein Durchbruch in der Forschungsinfrastruktur an sich, sondern wird auch Wissen und Fachkenntnisse generieren, die mit dem European Health Data Space – einer neuen Verordnung für die sichere Nutzung und den Austausch aller elektronischen Gesundheitsdaten in der EU – im Einklang stehen.
UNCAN-Connect bringt 53 Forschungseinrichtungen, Unternehmen und Patientenorganisationen aus 19 Ländern zusammen, um die Plattform nach einem in einem früheren EU-Projekt entwickelten Konzept aufzubauen. Das SIB ist auch Partner des ergänzenden EU-Projekts CANDLE (National CAncer data Node DeveLopErs), das die Umsetzung der Plattform UNCAN.eu unterstützen wird. CANDLE wurde im Juni ins Leben gerufen und vereint 40 Partner aus 20 europäischen Ländern.
Die UNCAN-Plattform (UNderstand CANcer) zielt darauf ab, diesen nächsten Durchbruch zu beschleunigen, indem sie zwei aktuelle Revolutionen nutzt: die Generierung riesiger Mengen an Daten aus den Lebenswissenschaften und die Entwicklung leistungsfähiger KI-Modelle. Die föderierte Plattform wird technische und administrative Hindernisse überwinden, um verschiedene Krebsdaten aus der Europäischen Union, der Schweiz, der Türkei und der Ukraine zu verknüpfen und zu katalogisieren, die Wissenschaftler, Kliniker, KI-Entwickler und andere Gesundheitsinnovatoren leicht finden und zusammenführen können, um neue Erkenntnisse über die Krebsbiologie zu gewinnen und neue Therapien zu entwickeln.
Das SIB ist Partner des von der EU und der Schweiz finanzierten Konsortiums, das die Plattform UNCAN-Connect aufbaut. Unsere Wissenschaftler leiten die Arbeiten, um sicherzustellen, dass die auf der Plattform hinterlegten klinischen und anderen Daten von hoher Qualität und harmonisiert sind, unter anderem durch den Einsatz modernster KI-Tools zur Angleichung der Daten an gemeinsame Standards. Diese Beiträge sowie die Beiträge zum verwandten CANDLE-Projekt (siehe Kasten) bauen auf den Erfahrungen mit der Koordinierung anderer innovativer Initiativen im Bereich Gesundheitsdaten auf, darunter der Schweizer Knotenpunkt des Federated European Genome-phenome Archive (FEGA), der europäische IMMUcan-Patientendatenatlas und Swiss Personalized Health Network (SPHN).
UNCAN-Connect wird dazu beitragen, die EU-Krebsmission in die Praxis umzusetzen und eine noch größere Gesundheitsdateninitiative, den in diesem Jahr verabschiedeten European Health Data Space (EHDS), zu unterstützen (siehe Kasten). Es unterstützt auch Schweizer Gesundheitsinitiativen wie die Nationale Strategie zur Prävention nicht übertragbarer Krankheiten und trägt zur Mission von das SIB bei, fundierte Kenntnisse über biologische Daten, Spitzentechnologien und interdisziplinäre Kooperationen zu nutzen, um Innovationen in Medizin und Gesundheit voranzutreiben.
UNCAN-Connect ist ein Beispiel dafür, wie das SIB zur nächsten Generation transnationaler Gesundheitsinfrastrukturen in Europa und weltweit beiträgt – unter anderem durch die Bereitstellung von KI-fähigen Daten und die Entwicklung rechtskonformer nationaler Data Hubs für die Suche und den sicheren Austausch sensibler Patientendaten.
Harmonisierung und Qualitätskontrolle von Krebsdaten in ganz Europa
Das Projekt UNCAN-Connect wird Anwendungsfälle für sechs wichtige Krebsarten bereitstellen: pädiatrische Krebserkrankungen, Lymphdrüsenkrebs, Bauchspeicheldrüsenkrebs, Eierstockkrebs, Lungenkrebs und Prostatakrebs. Die Daten stammen aus Krankenhäusern, Registern, Universitäten und Biobanken in den 19 Partnerländern und werden mit bestehenden europäischen Forschungsinfrastrukturen wie ELIXIR verknüpft, dessen Schweizer Knotenpunkt das SIB ist. Es wird eine Vielzahl von Patienten- und Tumorinformationen hinterlegt, darunter demografische, klinische und Lebensqualitätsdaten, genetische und molekulare Marker aus Genom-, Proteom- und anderen „Omik”-Analysen sowie Bilder von Tumoren und Organen.
Um neue Entdeckungen, auch durch KI, voranzutreiben, müssen diese Daten alle von gleichbleibend hoher Qualität sein, die gleichen Einheiten und Beschreibungen verwenden und die gleiche Struktur aufweisen, um eine zuverlässige und reproduzierbare Forschung zu ermöglichen. Die Wissenschaftler von das SIB werden die Projektpartner anleiten und koordinieren, um diese grundlegenden Anforderungen zu erfüllen, indem sie Richtlinien und Instrumente entwickeln, die Folgendes gewährleisten:
- vollständig interoperable Daten durch Standards für die Datenformatierung, -verarbeitung und -annotation, die den FAIR-Prinzipien (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable) und internationalen Richtlinien entsprechen und mit dem European Health Data Space (EHDS) und der EU-Datenschutz-Grundverordnung (DSGVO) in Einklang stehen;
- datenintegrität und Rückverfolgbarkeit durch eine formale Ablagerungspipeline und Herkunftsstandards;
- datenqualität durch ein spezielles Bewertungsinstrument.
Entwicklung innovativer KI-Tools für die Datenharmonisierung
Um die Umsetzung dieser Richtlinien zu erleichtern, werden unsere Wissenschaftler auch KI-Tools entwickeln, die Klinikern und Forschern dabei helfen, die in ihren Datensätzen verwendeten Begriffe den gängigen Standards zuzuordnen.
UNCAN-Connect entwickelt Tools und Infrastrukturen, mit denen wir die riesigen Datenmengen von Krebspatienten, die in ganz Europa gesammelt wurden, nutzen und für Forscher zugänglich und nutzbar machen können. Dies wird in den kommenden Jahrzehnten ein wichtiger Motor für neue Durchbrüche beim Verständnis und der Behandlung von Krebs sein.
Reference(s)
Bildnachweis: Keystone – Wissenschaftsfotobibliothek – Zephyr
