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Optimierung der Analyse von Daten aus der Massenspektrometrie

prolfqua: Ein umfassendes R-Paket für die Analyse der differentiellen Expression von Proteinen

19 Dezember 2023

Die Massenspektrometrie ist ein unverzichtbares Werkzeug zur Quantifizierung verschiedener Peptide und Proteine in biologischen Proben. Um diese Analyse zu optimieren, hat die Proteome Informatics FGCZ-Gruppe unter der Leitung von Christian Panse das R-Paket prolfqua entwickelt. In diesem in silico talk stellt Witold Wolski das Design des Pakets vor und erklärt, wie es zur Analyse der differentiellen Expression von Peptiden oder Proteinen verwendet werden kann. Wenn Sie sich für die Proteinquantifizierung mittels Massenspektrometrie und differentielle Expressionsanalyse interessieren, ist dieser Vortrag genau das Richtige für Sie!

Über die in silico talks-Reihe - Das Neueste aus der Bioinformatik von SIB-Wissenschaftlern

Mit der Online-Reihe in silico talks möchten wir Bioinformatiker, Biowissenschaftler und Kliniker über die neuesten Fortschritte der SIB-Wissenschaftler zu einem breiten Spektrum von Bioinformatik-Methoden, -Forschung und -Ressourcen informieren. Bleiben Sie auf dem Laufenden, erhalten Sie exklusive Einblicke in die neuesten Veröffentlichungen und erfahren Sie, wie diese Fortschritte Ihnen bei Ihrer Arbeit oder Forschung helfen können, indem Sie sich in die in silico talks-Mailingliste eintragen.

Sprecher

Name:

Witold E. Wolski

Institute:

ETH Zürich & Universität Zürich

Group:

Proteome Informatics FGCZ

Witold E. Wolski promovierte in Computational Chemistry an der Freien Universität Berlin unter der Betreuung von Knut Reinert und absolvierte anschließend ein Postdoktorat an der School of Mathematics and Statistics der University of Newcastle, Großbritannien. Er arbeitete fünf Jahre lang als Softwareentwickler bei Bruker Daltonics in Bremen, wo er Software für die Massenspektrometrie entwickelte. Anschließend zog er in die Schweiz, um im Labor von Ruedi Aebersold im Bereich Bioinformatik zu arbeiten. Witold ist seit über zwei Jahrzehnten auf dem Gebiet der computergestützten Massenspektrometrie und Proteomik tätig und arbeitet derzeit bei der SIB-Gruppe unter der Leitung von Christian Panse am Functional Genomics Center Zurich. Seine Forschungsinteressen umfassen die mathematische und statistische Modellierung von massenspektrometrischen Proteomik- und Metabolomikdaten sowie die Automatisierung der Datenanalyse.