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Ottimizzazione dell'analisi dei dati generati dalla spettrometria di massa

prolfqua: un pacchetto R completo per l'analisi dell'espressione differenziale delle proteine

19 December 2023

La spettrometria di massa è uno strumento essenziale per quantificare la presenza di vari peptidi e proteine nei campioni biologici. Per semplificare questa analisi, il gruppo Proteome Informatics FGCZ guidato da Christian Panse ha sviluppato il pacchetto R prolfqua. In questo in silico talk, Witold Wolski presenta il design del pacchetto e come utilizzarlo per analizzare l'espressione differenziale di peptidi o proteine. Se siete interessati alla quantificazione delle proteine mediante spettrometria di massa e all'analisi dell'espressione differenziale, questo in silico talk fa al caso vostro!

Informazioni sulla serie di conferenze in silico – Le ultime novità nel campo della bioinformatica dagli scienziati del SIB

La serie di conferenze online in silico talks ha lo scopo di informare bioinformatici, scienziati biologici e medici sugli ultimi progressi compiuti dagli scienziati dello SIB su una vasta gamma di argomenti relativi a metodi, ricerca e risorse nel campo della bioinformatica. Iscriviti alla mailing list di in silico talks per rimanere aggiornato sugli ultimi sviluppi, ottenere approfondimenti esclusivi sui recenti articoli scientifici e scoprire come questi progressi potrebbero aiutarti nel tuo lavoro o nella tua ricerca.

Altoparlante

Name:

Witold E. Wolski

Institute:

ETHZ e Università di Zurigo

Group:

Proteome Informatics FGCZ

Witold E. Wolski ha conseguito il dottorato in chimica computazionale presso la Libera Università di Berlino, in Germania, sotto la supervisione di Knut Reinert, dopodiché ha intrapreso una ricerca post-dottorato presso la Scuola di Matematica e Statistica dell'Università di Newcastle, nel Regno Unito. Ha lavorato per cinque anni come ingegnere informatico presso la Bruker Daltonics di Brema, in Germania, dove ha sviluppato software per la spettrometria di massa. Successivamente si è trasferito in Svizzera per fornire supporto in bioinformatica nel laboratorio di Ruedi Aebersold. Witold ha contribuito alla spettrometria di massa computazionale e alla proteomica per oltre due decenni e ora lavora al gruppo del SIB guidato da Christian Panse presso il Functional Genomics Center di Zurigo. I suoi interessi di ricerca includono la modellizzazione matematica e statistica dei dati proteomici e metabolomici della spettrometria di massa e l'automazione dell'analisi dei dati.