BioMeXT Biomedical Information Extraction

Wir sind spezialisiert auf die Extraktion von Informationen aus biomedizinisch relevanten Textquellen, wie wissenschaftlicher Literatur, klinischen Aufzeichnungen oder sozialen Medien. Unser Schwerpunkt liegt insbesondere auf der Extraktion von domänenspezifischen Entitäten (wie Genen, Medikamenten, Krankheiten) und deren semantischen Beziehungen (z. B. Gen-Krankheits-Assoziationen). Unsere Tools werden häufig im Rahmen von Community-basierten Evaluierungswettbewerben (z. B. BioCreAtIvE)evaluiert . Darüber hinaus bieten wir eine Umgebung für die assistierte Kuration (ODIN), die in einem von den NIH finanzierten Projekt in der Kurations-Pipeline der RegulonDB-Datenbank zum Einsatz kommt .