BioMeXT Biomedical Information Extraction

Nous sommes spécialisés dans l'extraction d'informations à partir de sources textuelles pertinentes dans le domaine biomédical, telles que la littérature scientifique, les dossiers cliniques ou les réseaux sociaux. Nous nous concentrons en particulier sur l'extraction d'entités spécifiques à un domaine (telles que les gènes, les médicaments, les maladies) et leurs relations sémantiques (par exemple, les associations gène-maladie). Nos outils sont souvent évalués dans le cadre de concours organisés par la communauté (par exemple BioCreAtIvE). Nous fournissons également un environnement pour la curation assistée (ODIN), qui est utilisé dans le pipeline de curation de la base de données RegulonDB, dans le cadre d'un projet financé par le NIH.