L'impatto delle varianti genetiche può dipendere dal genitore da cui provengono
Caratteristiche quali l'altezza, il metabolismo e il rischio di malattia possono...
Una soluzione per migliorare l'assemblaggio dei genomi
MAPACHE: Una pipeline flessibile per mappare il DNA antico
Il DNA rinvenuto nei resti fossili può fornirci ulteriori informazioni sulle specie estinte e sulle modalità di vita degli individui nelle civiltà antiche. Tuttavia, il livello di degradazione di questo DNA antico e il rischio di contaminazione rendono difficile la mappatura dell'intero genoma. In questo in silico talk, Samuel Neuenschwander del gruppo al SIB di Anna-Sapfo Malaspinas dell'Università di Losanna presenta MAPACHE, un flusso di lavoro che consente la mappatura del DNA antico per assemblare genomi in modo efficiente e riproducibile. Questo è stato pubblicato sulla rivista bioinformatica. Se siete interessati a lavorare con DNA antico o altri campioni di DNA che devono essere mappati, allora questo in silico talk fa al caso vostro.
Informazioni sulla serie di conferenze in silico – Le ultime novità nel campo della bioinformatica dagli scienziati del SIB
La serie di conferenze online in silico talks ha lo scopo di informare bioinformatici, scienziati biologici e medici sugli ultimi progressi compiuti dagli scienziati dello SIB su una vasta gamma di argomenti relativi a metodi, ricerca e risorse nel campo della bioinformatica. Iscriviti alla mailing list di in silico talks per rimanere aggiornato sugli ultimi sviluppi, ottenere approfondimenti esclusivi sui recenti articoli scientifici e scoprire come questi progressi potrebbero aiutarti nel tuo lavoro o nella tua ricerca.
Reference(s)
Neuenschwander S. et al., Mapache: una pipeline flessibile per mappare il DNA antico, Bioinformatica 2023
