Unsere Gruppe ist am Departement Biomedizin (DBM) der Universität Basel angesiedelt. Wir arbeiten mit Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern des DBM an Projekten, die ein breites Spektrum an Forschungsthemen abdecken, von der Zelldifferenzierung und Evolutionsbiologie bis hin zur Identifizierung molekularer Grundlagen verschiedener menschlicher Krankheiten. Dabei konzentrieren wir uns auf die Analyse, Interpretation und Visualisierung von Expressions-, epigenetischen und genomischen Daten, die hauptsächlich aus Next-Generation-Sequencing-Experimenten stammen.
Kernaktivitäten
Unsere Kernkompetenzen bieten allen Forschern der DBM eine zentrale Anlaufstelle für Fachwissen in den Bereichen Bioinformatik und Statistik. Wir unterstützen unsere Wissenschaftler bei der Analyse, Interpretation und Visualisierung von Expressions-, Epigenetik- und Genomdaten, die hauptsächlich aus Next-Generation-Sequencing-Experimenten stammen. Neben standardisierten Ansätzen bietet die Plattform auch maßgeschneiderte Lösungen für die individuellen Anforderungen einzelner Forschungsprojekte. Die Bioinformatik-Plattform bietet individuelle Schulungen und Beratung für Forscher an der DBM. Darüber hinaus organisiert sie in Zusammenarbeit mit Computational Biologists des Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research Trainings im Bereich Bioinformatik.
Hier sind einige der wichtigsten Dienstleistungen, die wir anbieten:
- Beratung zum Versuchsaufbau von Genomik-Experimenten;
- Datenanalyse und Visualisierung mit Schwerpunkt auf groß angelegter Genomik und Proteomik;
- Beratung in Statistik und Programmierung in R.
Bereich(e) der Anwendung
Grundlagenforschung
Bereich der Tätigkeit
Systembiologie
