DBM Bioinformatics Core Facility

Il nostro gruppo fa parte del Dipartimento di Biomedicina (DBM) dell'Università di Basilea. Collaboriamo con gli scienziati del DBM su progetti che coprono un ampio spettro di argomenti di ricerca, dalla differenziazione cellulare e la biologia evolutiva all'identificazione delle basi molecolari di varie malattie umane. A tal fine, ci concentriamo sull'analisi, l'interpretazione e la visualizzazione dei dati relativi all'espressione, all'epigenetica e al genoma, che derivano principalmente da esperimenti di sequenziamento di nuova generazione.

Attività principali

La nostra struttura centrale fornisce una risorsa centralizzata di competenze in biologia computazionale e statistica a tutti i ricercatori del DBM. Aiutiamo i nostri scienziati nell'analisi, nell'interpretazione e nella visualizzazione dei dati di espressione, epigenetici e genomici, derivati principalmente da esperimenti di sequenziamento di nuova generazione. Oltre agli approcci standardizzati, la piattaforma può anche fornire soluzioni personalizzate in base alle esigenze dei singoli progetti di ricerca. La struttura centrale di bioinformatica offre formazione e consulenza individuali ai ricercatori del DBM. La struttura organizza anche corsi di formazione in bioinformatica in collaborazione con biologi computazionali del Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research.

Ecco alcuni dei servizi principali che forniamo:

• Consulenza sulla progettazione sperimentale di esperimenti di genomica;
• Analisi e visualizzazione dei dati con particolare attenzione alla genomica e alla proteomica su larga scala;
• Consulenza in statistica e programmazione in R.