DBM Bioinformatics Core Facility

Notre groupe est situé au sein du Département de biomédecine (DBM) de l'Université de Bâle. Nous collaborons avec des scientifiques du DBM sur des projets couvrant un large éventail de thèmes de recherche, allant de la différenciation cellulaire et de la biologie évolutive à l'identification des bases moléculaires de diverses maladies humaines. Pour ce faire, nous nous concentrons sur l'analyse, l'interprétation et la visualisation de données d'expression, épigénétiques et génomiques, qui proviennent principalement d'expériences de séquençage de nouvelle génération.

Activités principales

Notre plateforme centrale fournit une ressource centralisée d'expertise en biologie computationnelle et en statistiques à tous les chercheurs du DBM. Nous aidons nos scientifiques à analyser, interpréter et visualiser des données d'expression, épigénétiques et génomiques, principalement issues d'expériences de séquençage de nouvelle génération. Outre les approches standardisées, la plateforme peut également fournir des solutions personnalisées adaptées aux besoins de projets de recherche individuels. La plateforme de bioinformatique offre une formation et des conseils personnalisés aux chercheurs de la DBM. Elle organise également des formations en bioinformatique en collaboration avec des biologistes computationnels de l'Institut Friedrich Miescher pour la recherche biomédicale.

Voici quelques-uns des principaux services que nous proposons :

• Conseil sur la conception expérimentale d'expériences génomiques ;
• Analyse et visualisation des données, en particulier dans le domaine de la génomique et de la protéomique à grande échelle ;
• Conseil en statistiques et programmation en R.