Les scientifiques du réseau SIB acquièrent des connaissances fondamentales sur la biodiversité et les défis liés à la conservation, qui contribuent à orienter les politiques et les solutions visant à préserver la vie sur Terre. À l’occasion de la Journée internationale de la diversité biologique de cette année, nous mettons aujourd’hui en avant un échantillon des récentes découvertes et avancées de ces équipes.
Bioinformatique : des données à la découverte
La bioinformatique – la science qui consiste à stocker, relier, analyser et interpréter des données biologiques – façonne nos vies d’une manière que la plupart des gens ne voient jamais, qu’il s’agisse d’orienter les traitements contre le cancer ou d’éclairer les efforts de conservation. Cette série met en lumière des exemples illustrant comment les scientifiques du réseau SIB transforment les données en connaissances et en actions concrètes.
Les microbes coralliens : une source précieuse de nouveaux médicaments potentiels
La reconstruction des génomes de plus de 4 000 espèces microbiennes récifales a révélé que 90 % d'entre elles étaient jusqu'alors inconnues et que les microbes coralliens présentent un fort potentiel pour la production de composés d'intérêt biomédical. Les génomes ont été assemblés à partir d'échantillons d'ADN prélevés lors d'une étude corallienne à l'échelle du Pacifique et de séquences issues de bases de données récifales existantes.
Bioinformatique : des données à la découverte
La bioinformatique – la science qui consiste à stocker, relier, analyser et interpréter des données biologiques – façonne nos vies d’une manière que la plupart des gens ne voient jamais, qu’il s’agisse d’orienter les traitements contre le cancer ou d’éclairer les efforts de conservation. Cette série met en lumière des exemples illustrant comment les scientifiques du réseau SIB transforment les données en connaissances et en actions concrètes.
Avec 95 % de ces microbes propres à un seul hôte – et seulement trois genres de coraux constructeurs de récifs échantillonnés lors de l'étude menée dans le Pacifique –, l'étude souligne la nécessité de protéger les écosystèmes récifaux avant que leur diversité moléculaire, en grande partie inconnue, ne disparaisse.
Publié dans Nature | Groupe SIB impliqué : Microbiome Research (ETH Zurich)
Une ressource pour la recherche sur les espèces venimeuses
L'initiative VenomsBase vise à unifier les données fragmentées issues de la recherche sur les venins, toutes espèces et disciplines confondues, au sein d'une base de connaissances ouverte et évolutive. En harmonisant et en intégrant les ensembles de données relatifs aux araignées, escargots et autres animaux venimeux – allant de la génomique et de la protéomique aux tests fonctionnels et aux métadonnées écologiques –, cette ressource permettra d'accélérer les découvertes en biologie évolutive, en pharmacologie et en sciences écologiques.
Publié dans Gigascience | Groupes du SIB impliqués : Bioinformatique évolutive (Université de Lausanne) et Swiss-Prot-Knowledgebases
Mobiliser les données sur la biodiversité cloisonnées
Des experts suisses ont souligné l’importance des données sur la biodiversité en tant que levier stratégique pour la conservation de la biodiversité lors de la Journée des données sur la biodiversité de Berne 2026, organisée conjointement par le SIB et l’Académie suisse des sciences naturelles (SCNAT) le 21 mai. Les discussions ont porté sur la mise en relation des données sur la biodiversité à grande échelle – entre la littérature, les observations de terrain, la génomique et les systèmes analytiques – afin de permettre la prise de décisions en matière de conservation fondées sur des données complètes, exploitables et actualisées. Lire le communiqué de presse
Un projet présenté lors de l’événement permettra de mettre à disposition des informations biologiques importantes pour la recherche et les évaluations en matière de biodiversité. Dirigée par le SIB, cette collaboration financée par le FNS développe un cadre de modélisation qui intègre les données traditionnelles sur la présence des espèces à trois types de données actuellement cloisonnés : la génomique, les traits extraits de la littérature et les changements taxonomiques au fil du temps. Lire l’article
Groupe du SIB impliqué : Environmental Bioinformatics
Les microbes apparentés s'associent à des organismes similaires
Une analyse phylogénétique portant sur plus de 1,15 million d'échantillons environnementaux et près de 183 000 groupes microbiens montre que des microbes étroitement apparentés se retrouvent systématiquement dans des communautés similaires. Ce phénomène s'observe dans tous les phylums et environnements étudiés – du sol aux océans – et persiste au-delà de milliards d'années d'évolution.
Ce « conservatisme communautaire » pourrait contribuer à affiner la définition, longtemps débattue, d’une espèce microbienne, en révélant des différences biologiques que l’identification actuelle basée sur l’ADN ne permet pas de mettre en évidence. Cette analyse a été rendue possible grâce à la plus grande base de données sur les écosystèmes microbiens mondiaux, MicrobeAtlas, développée par le même groupe du SIB.
Publié dans Nature Ecology & Evolution | Groupe SIB impliqué : Bioinformatique et biologie des systèmes (Université de Zurich)
La recherche sur la durabilité néglige des actions et des acteurs clés
Sur les 4,2 millions de publications analysées concernant la réalisation de la durabilité mondiale, seules 3,8 % mentionnent à la fois une action nécessaire et un acteur. L'analyse documentaire a également révélé que des actions telles que le « changement des normes sociales » et le « changement technologique » sont surreprésentées dans ces publications, tout comme des acteurs tels que les scientifiques et les entreprises, tandis que la réforme de la gouvernance, la société civile et le secteur public sont négligés. Ces lacunes dans les connaissances peuvent entraver la formation des coalitions intersectorielles nécessaires pour s'attaquer aux causes sous-jacentes de la perte de biodiversité.
Publié dans Nature Sustainability | Groupe SIB impliqué : Environmental Bioinformatics
En savoir plus sur la contribution du SIB à la protection de l'environnement
Reference(s)
Photo de Francesco Ungaro sur Unsplash
