Nous rassemblons des communautés interdisciplinaires, harmonisons et connectons des données diverses, et fournissons une infrastructure de recherche à grande échelle, tant au niveau national qu'international. Cela permet de réaliser des avancées majeures pour la santé humaine et planétaire, de maximiser les investissements publics dans la science et de renforcer la réputation, la souveraineté et la compétitivité de la Suisse.
Découvrez nos mandats, projets et initiatives sur :
L'indépendance et la position établie du SIB dans l'écosystème favorisent les collaborations entre les parties prenantes. Notre travail commun a par exemple abouti au tout premier projet national dans le domaine de la génétique médicale, qui rassemble tous les centres universitaires suisses spécialisés dans cette discipline.
Fédérer la communauté suisse de bioinformatique
Le SIB fédère la communauté nationale de bioinformatique à travers un réseau de groupes affiliés, dont les dirigeants sont des experts reconnus dans le domaine. Leurs institutions d'accueil sont partenaires du SIB et représentent les principales institutions universitaires et de recherche de Suisse.
La fédération de cette communauté est d'une importance capitale pour la Suisse – et fait partie de notre mandat confié par le Secrétariat d'État à la formation, à la recherche et à l'innovation (SEFRI) – afin de maintenir la bioinformatique suisse à la pointe des sciences de la vie et de l'innovation au niveau mondial. Cette capacité, unique dans le pays, maximise également l'impact des investissements publics et privés en augmentant l'interopérabilité des données, en développant des normes communes conformes aux normes internationales et en facilitant la collaboration scientifique.
Le SIB propose à son réseau national des activités communes pour partager les meilleures pratiques et favoriser les collaborations, par exemple sous la forme de groupes de discussion. Le SIB organise également des événements scientifiques et des conférences et apporte son soutien dans des domaines allant de la gestion des subventions et de la promotion scientifique à l'expertise juridique ou au transfert de technologie. Le fil conducteur de toutes ces activités est l'excellence scientifique et la collaboration.
Enfin, ce réseau national confère également au SIB la légitimité nécessaire pour représenter la Suisse dans les initiatives internationales liées à la bioinformatique et pour accroître la visibilité de notre pays en matière d'excellence scientifique et d'innovation.
Relier la bioinformatique suisse aux initiatives mondiales en matière de données
La communauté suisse de bioinformatique doit être reliée aux efforts internationaux afin d'éviter que les chercheurs ne soient isolés dans le paysage scientifique. Grâce à des activités telles que l'établissement et la mise en œuvre de normes internationales visant à accroître l'interopérabilité des données, la participation à des initiatives fédérées en tant que nœud suisse ou la direction de lots de travaux au niveau européen (voir ci-dessous), le SIB renforce la visibilité de la Suisse dans le monde.
Le SIB a établi des liens et des collaborations avec des organisations mondiales telles que :
- ELIXIR, l'organisation intergouvernementale qui rassemble les ressources en sciences de la vie de toute l'Europe, dont le SIB est le nœud suisse. Notre implication couvre un large éventail de thèmes, allant de la maintenance de logiciels libres et de bases de données suisses pour les sciences de la vie dans le cadre du Service Delivery Plan, à la co-direction de work packages dans des projets ou plateformes européens. Un exemple clé en est la co-direction des efforts européens visant à favoriser le partage ouvert des données génomiques du SARS-CoV-2 dans le cadre du projet ELIXIR-CONVERGE.
Les ressources du SIB sélectionnées comme ELIXIR Core Data Resources
- La Global Alliance for Genomics & Health (GA4GH), une organisation mondiale qui vise à permettre le partage responsable des données génomiques et dont le SIB est membre, a publié une déclaration sur la protection de la vie privée.
- La Global Biodata Coalition, forum destiné aux bailleurs de fonds de la recherche visant à favoriser une gestion efficace et la croissance des ressources biodatographiques dans le monde entier. Notre institut a contribué à sa création et nos anciens directeurs exécutifs font désormais partie du Comité consultatif scientifique.
Les ressources du SIB sélectionnées comme ressources mondiales de base en biodonnées
Mise en œuvre d'infrastructures de recherche nationales et internationales
Grâce à nos activités de coordination nationale, notre institut est naturellement positionné pour mettre en place des infrastructures nationales ou internationales, que ce soit dans le domaine des données de recherche ouvertes (ORD) ou des données de recherche clinique.
Coordination des données de recherche ouvertes
Depuis sa création, le SIB s'engage en faveur de la science ouverte et de la diffusion la plus large possible des principes FAIR. L'ORD est coordonné au SIB grâce aux ressources ouvertes développées par ses membres, qui constituent des éléments essentiels à la mise en œuvre de la science ouverte.
Nous faisons progresser la science ouverte en Suisse et en Europe grâce à notre participation à l'European Open Science Cloud (EOSC), une initiative stratégiquement importante qui permet aux chercheurs d'accéder et de partager des données et des services de recherche au-delà des disciplines et des frontières. Le SIB est membre de l'association EOSC, partenaire de divers projets EOSC visant à garantir la conservation à long terme, la fiabilité et la découvrabilité des ressources de données européennes, et partenaire d'une collaboration suisse visant à relier les données, les services et les infrastructures de recherche nationaux à l'EOSC.
Coordination des données issues de la recherche clinique
De nombreux projets européens public-privé consacrés au diabète, au cancer ou à l'obésité s'appuient sur notre expertise pour la coordination, la gestion et l'analyse de données sensibles provenant de différents pays. En jouant régulièrement le rôle de Data Coordination Centre dans ces projets, nous répondons à un besoin crucial de disposer d'un partenaire fiable, neutre et efficace, capable d'interagir avec des acteurs du secteur privé et du monde universitaire et de surmonter des défis scientifiques et juridiques complexes grâce à des solutions techniques innovantes. Notre approche fédérée de l'analyse et des bases de données est un exemple de ces solutions : découvrez comment nous l'avons appliquée dans le cadre d'un projet de lutte contre le diabète.
Découvrez nos contributions à des projets publics-privés européens
Nous coordonnons également les données de recherche clinique dans le cadre de grandes infrastructures nationales telles que le Swiss Personalized Health Network (SPHN), qui rend les données de santé interopérables et partageables pour la recherche en Suisse. Dans ce contexte, nous avons également mis en place et continuons à coordonner BioMedIT, qui fournit une infrastructure informatique sécurisée, des services et des compétences pour la recherche biomédicale en Suisse. Le SPHN est placé sous la responsabilité de l'Académie suisse des sciences médicales (ASSM) en collaboration avec le SIB.
Nous soutenons également la recherche clinique, la surveillance des agents pathogènes et les diagnostics grâce à des solutions d'infrastructure que nous coordonnons et développons dans le cadre de grands consortiums. Citons par exemple le Centre for Pathogen Bioinformatics, qui renforce l'infrastructure bioinformatique et la collaboration entre les parties prenantes pour la préparation aux épidémies nationales et mondiales, et SwissGenVar, une initiative nationale qui relie toutes les grandes institutions universitaires de génétique médicale en Suisse.
Découvrez notre Centre de bioinformatique des agents pathogènes
Coordination des données environnementales
Les chercheurs et les praticiens dans le domaine de la conservation s'appuient également sur notre expertise en matière de données pour obtenir des informations exploitables en matière de protection de l'environnement. Dans le cadre du projet « Biodiversity Meets Data », par exemple, nous facilitons l'utilisation de diverses données sur la biodiversité et l'environnement provenant de multiples sources, et permettons l'utilisation de ces données pour surveiller et évaluer la biodiversité européenne à une échelle jusqu'alors impossible.
