Evolutionary Bioinformatics

Au sein du groupe Bioinformatique évolutive, nous nous intéressons à l'évolution du génome animal, en particulier aux questions soulevées par la biologie évolutive du développement (Evo-Devo). Pour cela, nous développons des méthodes et des bases de données permettant d'extraire des informations fiables à partir de données génomiques et transcriptomiques. Notre projet principal est Bgee, une base de données pour l'expertise en expression génétique. Tout en développant Bgee, nous menons des recherches sur les ontologies, la biocuration et les méthodes statistiques pour la transcriptomique. Notre objectif biologique est de relier l'Evo-Devo à la génomique évolutive. Nous étudions notamment le rôle de la duplication des gènes dans la divergence entre les gènes et entre les espèces.

Le groupe développe la SIB Resource Bgee, une base de données d'expression génique expertement curatée