La Global Biodata Coalition ed ELIXIR hanno pubblicato i risultati della loro ultima rigorosa selezione delle risorse di biodati ritenute essenziali per le scienze della vita. Le risorse Il SIB Bgee e Cellosaurus sono state incluse nelle Global Core Biodata Resources, a riconoscimento della loro importanza a livello mondiale. A livello europeo, SWISS-MODEL è riconosciuto come ELIXIR Core Data Resource, insieme ad altri strumenti e iniziative del SIB riconosciuti per la prima volta in altre categorie. Una grande testimonianza del lavoro svolto dai team del SIB per fornire risorse di alta qualità, che conferma la posizione di leadership della Svizzera come fornitore internazionale di risorse di biodati.
Informazioni sulle risorse globali di dati biologici fondamentali (GCBR)
I GCBR sono risorse designate come di importanza critica nella comunità delle scienze della vita a livello mondiale. Sono selezionati dalla Global Biodata Coalition (GBC), una coalizione internazionale di finanziatori della ricerca con l'obiettivo di coordinare meglio gli approcci per il finanziamento, la gestione e la crescita efficienti delle risorse di biodati in tutto il mondo. La sua costituzione è stata co-guidata da Il SIB.
Riconoscimento per le risorse del SIB sulla scena mondiale
L'elenco iniziale delle risorse globali di dati biologici fondamentali (GBCR - vedi riquadro) è stato annunciato nel 2022 e comprendeva tre risorse al SIB: Rhea, UniProt e STRING. Quest'anno, dopo un processo di selezione in cui 50 esperti indipendenti hanno valutato oltre 90 software e database, sono state aggiunte altre 15 risorse. Due di queste sono banche dati curate con competenza dai team del SIB, ad esempio parte del portafoglio di risorse del SIB: Bgee, una banca dati sull'espressione genica curata con competenza e sviluppata all'interno del gruppo di Marc Robinson-Rechavi e Frédéric Bastian, e Cellosaurus, un database di curazione da esperti sulle linee cellulari, sviluppato dal gruppo di Amos Bairoch e Lydie Lane.
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Riconoscimento da parte di ELIXIR delle risorse sviluppate in Europa
ELIXIR è un'organizzazione intergovernativa che riunisce risorse nel campo delle scienze della vita provenienti da tutta Europa. Attraverso un'attenta valutazione, le risorse ritenute essenziali per la comunità vengono riconosciute in varie categorie, quali:
- Riserve di dati fondamentali (CDR) – strumenti software e banche dati di importanza fondamentale per la conservazione a lungo termine dei dati biologici
- Banche dati di deposito (DD) – archivi raccomandati per il deposito di dati sperimentali
- Risorse di interoperabilità raccomandate (RIR) – strumenti che facilitano le attività a sostegno del principio FAIR nella ricerca scientifica
Riconoscimento per le risorse del SIB sulla scena europea
SWISS-MODEL, una suite di software e database per la modellazione dell'omologia delle strutture proteiche sviluppata dal gruppo di Torsten Schwede del SIB, è stata ora inclusa nelle ELIXIR Core Data Resources. Questo sviluppo porta a 5 il numero delle risorse SIB presenti in questo elenco, con SWISS-MODEL che si aggiunge a Cellosaurus, Rhea, STRING e UniProt.
Informazioni sul ricettario FAIR
Creato in collaborazione da scienziati del mondo accademico e dell'industria farmaceutica, il FAIR Cookbook mira a sviluppare e diffondere linee guida sui processi necessari per rendere e mantenere i dati FAIR.È già una risorsa raccomandata dai programmi IMI/IHI e Horizon Europe Health.ELIXIR-CH (il SIB) co-dirige questa risorsa, la sua manutenzione e la sua evoluzione, insieme ai colleghi dei nodi di Lussemburgo, Regno Unito e Spagna, e con la partecipazione dell'Ufficio per la strategia della scienza dei dati del NIH statunitense.
Primo riconoscimento per i database di deposito del SIB e le risorse di interoperabilità raccomandate
ModelArchive è un archivio aperto per le strutture proteiche determinate computazionalmente. Ora è stato incluso anche nel database ELIXIR Deposition, un insieme di archivi raccomandati per i dati sperimentali a integrazione delle ELIXIR Core Data Resources.
Come Model Archive facilita la condivisione delle strutture proteiche predette dal computer
Inoltre, il Bgee SPARQL Endpoint e il FAIR Cookbook - una risorsa online, aperta e live per le scienze della vita (vedi riquadro) - sono stati entrambi inseriti nelle risorse di interoperabilità raccomandate da ELIXIR.
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La Svizzera come fornitore di risorse di alta qualità a livello mondiale
Questi sviluppi rafforzano ulteriormente il modello del SIB per mantenere la posizione della Svizzera come fornitore leader di software e database aperti di alta qualità che consentono progressi nel campo delle scienze della vita. Il Paese afferma la sua posizione come terzo fornitore mondiale di GCBR e secondo fornitore europeo di ELIXIR CDR. Questi riconoscimenti mirano anche a fungere da forte segnale affinché queste risorse siano ulteriormente sostenute verso la loro sostenibilità a lungo termine.
Leggi il comunicato internazionale della Global Biodata Coalition
