I ricercatori accademici e privati che utilizzano UniProt, una banca dati unica e di alta qualità sulle proteine sviluppata in collaborazione con il SIB, beneficiano di un aumento dell'efficienza pari a 373-565 milioni di euro all'anno. Si tratta di un ritorno sull'investimento impressionante rispetto ai costi operativi annuali di 14,6 milioni di euro. UniProt genera anche benefici socioeconomici a lungo termine, come dimostrano le oltre 15.200 pubblicazioni scientifiche e le più di 183.000 pubblicazioni di brevetti che lo citano fino ad oggi. Questo valore è particolarmente importante per la Svizzera, dato che tre delle prime cinque organizzazioni che depositano brevetti sono aziende svizzere globali o loro filiali. Questi risultati sono stati pubblicati oggi in un caso di studio condotto dal CSIL in collaborazione con ELIXIR, nell'ambito del progetto PathOS finanziato dall'UE per comprendere e misurare meglio l'impatto della scienza aperta.

UniProt è la principale fonte mondiale di informazioni di alta qualità, complete e liberamente accessibili sulla sequenza e la funzione delle proteine. Frutto della collaborazione tra il SIB, l'Istituto europeo di bioinformatica (EMBL-EBI) e la Protein Information Resource (PIR), comprende una serie di banche dati che includono UniProtKB/Swiss-Prot, curata in base a criteri di eccellenza e gestita da il SIB.

UniProt è riconosciuto per la sua importanza fondamentale per la più ampia comunità delle scienze della vita e per la conservazione a lungo termine dei dati come risorsa al SIB, ELIXIR Core Data Resource e risorsa dati biologici core globale. È stato scelto per l'analisi costi-benefici da ELIXIR, che conduce un caso di studio sulle risorse bioinformatiche aperte per il progetto PathOS.

Quantificare i vantaggi e il valore della scienza aperta

La condivisione aperta di dati e conoscenze è sempre più riconosciuta come essenziale per accelerare il progresso scientifico, promuovere l’innovazione e rafforzare la fiducia del pubblico nella scienza. Sebbene siano state raccolte prove a sostegno di questi esiti positivi, manca ancora un metodo comune per misurare sistematicamente gli impatti accademici e socioeconomici.

UniProt è la principale fonte mondiale di informazioni di alta qualità, complete e liberamente accessibili sulla sequenza e la funzione delle proteine. Frutto della collaborazione tra il SIB, l'Istituto europeo di bioinformatica (EMBL-EBI) e la Protein Information Resource (PIR), comprende una serie di banche dati che includono UniProtKB/Swiss-Prot, curata in base a criteri di eccellenza e gestita da il SIB.

UniProt è riconosciuto per la sua importanza fondamentale per la più ampia comunità delle scienze della vita e per la conservazione a lungo termine dei dati come risorsa al SIB, ELIXIR Core Data Resource e risorsa dati biologici core globale. È stato scelto per l'analisi costi-benefici da ELIXIR, che conduce un caso di studio sulle risorse bioinformatiche aperte per il progetto PathOS.

Un nuovo quadro di riferimento specificamente concepito per misurare i benefici e gli impatti delle pratiche di scienza aperta sta colmando questa lacuna, con UniProt — una risorsa dati aperti riconosciuta a livello globale come essenziale per le scienze della vita — come primo caso di studio. Attraverso un’analisi costi-benefici adattata e una valutazione del «percorso di impatto», lo studio rileva che UniProt offre:

  • miglioramenti in termini di efficienza per gli utenti del mondo accademico e del settore privato per un valore compreso tra 373 e 565 milioni di euro all’anno, con una parte significativa di questo beneficio derivante dalla curatela dei dati da parte di esperti del gruppo Swiss-Prot del SIB con sede a Ginevra;

  • un beneficio netto diretto che supera i suoi costi operativi di 14,6 milioni di euro con un rapporto compreso tra 25 e 39 a uno;

  • un valore a lungo termine per la scienza e la società, accelerando la diffusione di nuove conoscenze e innovazioni, facilitando le collaborazioni tra università e settore privato e generando nuove idee imprenditoriali;

  • un forte valore per la Svizzera, con aziende svizzere globali o loro filiali che rappresentano tre delle prime cinque organizzazioni che pubblicano brevetti in cui viene menzionato UniProt.

L’analisi fornisce ai finanziatori di UniProt – la Segreteria di Stato per la formazione, la ricerca e l'innovazione (SEFRI), il Laboratorio europeo di biologia molecolare (EMBL) e gli Istituti nazionali di sanità degli Stati Uniti (NIH) – prove concrete sul ritorno dei loro investimenti. Fornisce inoltre un argomento convincente a favore del finanziamento sostenibile delle risorse dati aperti in generale, comprese quelle fornite dal SIB e dall’infrastruttura europea di dati per le scienze della vita ELIXIR. Il quadro generale – sviluppato dal CSIL, un istituto di ricerca economica, per il progetto PathOS di Horizon Europe – costituisce inoltre un potente strumento decisionale per promuovere politiche a favore della scienza aperta.

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I vantaggi immediati di UniProt superano di gran lunga i suoi costi

L’analisi costi-benefici adattata, condotta dal CSIL per il caso di studio, valuta specificamente i risultati a breve termine direttamente attribuibili a UniProt. Il costo operativo medio annuo è stato calcolato in 14,6 milioni di euro per il periodo 2017-2023, comprendente i costi di gestione coperti dai tre finanziatori e da altre fonti, oltre ai contributi degli utenti per il miglioramento dei dati sulle proteine.

I benefici per gli utenti sono stati individuati tramite un sondaggio e consistevano principalmente nel risparmio di tempo in tre ambiti:

  • accesso gratuito ai dati e alle conoscenze aperte di UniProt rispetto alla necessità di negoziare l’accesso ad alternative soggette a restrizioni o proprietarie (risparmio sui costi di transazione);

  • l’accesso diretto alle informazioni integrate in UniProt rispetto all’accesso separato a fonti diverse (risparmio sui costi di accesso);

  • semplificazione del lavoro quotidiano rispetto alla necessità di integrare, interpretare e verificare i dati provenienti da altre fonti (risparmio sui costi di manodopera).

Il valore monetario complessivo di questo risparmio di tempo è stato stimato tra i 373 milioni e i 565 milioni di euro all’anno. Sebbene l’analisi non abbia potuto includere tutti i costi storici associati allo sviluppo di UniProt – quali gli investimenti iniziali, gli sforzi di espansione e gli aggiornamenti significativi – e non rifletta i benefici a lungo termine e indiretti (discussi di seguito), tale valore supera i costi operativi attuali della risorsa in un rapporto compreso tra 25 (stima minima) e 39 (stima massima) a uno.

La cura e la gestione dei dati offrono numerosi vantaggi agli utenti

Le interviste e i focus group hanno rivelato che il risparmio di tempo per gli utenti è in gran parte attribuibile agli sforzi costanti degli scienziati impiegati presso il SIB, EMBL-EBI e PIR volti a migliorare l’accessibilità dei dati, potenziarne l’interoperabilità e curare con competenza le sequenze proteiche in Swiss-Prot, integrandole con informazioni tratte dalla letteratura scientifica sulla struttura e la funzione delle proteine.

Il costo del lavoro relativo a questa cura e gestione dei dati rappresenta la maggior parte dei costi operativi di UniProt. Tuttavia, come evidenziato nello studio, questo lavoro – in particolare la cura dei dati da parte di esperti del gruppo Swiss-Prot del SIB – non può essere svolto da altre organizzazioni esistenti né sostituito da tecnologie di intelligenza artificiale. Infatti, il sondaggio tra gli utenti non è riuscito a individuare un’alternativa pienamente comparabile a UniProt, con:

  • il 74% degli intervistati ha dichiarato che non avrebbe accesso agli stessi dati da risorse dati soggette a restrizioni o chiuse;

  • il 68% ha dichiarato che non sarebbe in grado di ricreare gli stessi dati.

Le cinque principali organizzazioni che hanno depositato brevetti citando UniProt

  1. Genentech – 960 (Stati Uniti; controllata da F. Hoffmann-La Roche)

  1. F. Hoffmann-La Roche – 948 (svizzera)

  1. Novozymes – 705 (Danimarca)

  1. Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale – 589 (francese)

  1. Novartis – 574 (Svizzera)

UniProt offre un valore a lungo termine alla scienza e alla società

La quantificazione degli impatti a lungo termine, effettuata attraverso l’analisi della letteratura scientifica e dei brevetti, ha dimostrato che UniProt contribuisce inoltre a:

Le cinque principali organizzazioni che hanno depositato brevetti citando UniProt

  1. Genentech – 960 (Stati Uniti; controllata da F. Hoffmann-La Roche)

  1. F. Hoffmann-La Roche – 948 (svizzera)

  1. Novozymes – 705 (Danimarca)

  1. Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale – 589 (francese)

  1. Novartis – 574 (Svizzera)

  • nuove conoscenze, con citazioni in oltre 15'200 pubblicazioni scientifiche in un’ampia varietà di settori delle scienze della vita e della tecnologia – di cui il 31% direttamente correlato agli Obiettivi di Sviluppo Sostenibile (SDG) delle Nazioni Unite;

  • alla ricerca e sviluppo (R&S) e all’innovazione, anche in Svizzera, con citazioni in oltre 183.000 pubblicazioni di brevetti – dove tre delle prime cinque organizzazioni depositanti sono aziende svizzere globali o loro filiali – oltre a citazioni di brevetti che fanno riferimento a UniProt in ulteriori brevetti a valle.

Sondaggi e interviste agli utenti hanno individuato ulteriori effetti a lungo termine resi possibili da UniProt, tra cui collaborazioni pubblico-private, sviluppo di prodotti e servizi e processi produttivi ottimizzati.

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Necessità di un finanziamento sostenibile delle infrastrutture di ricerca

Nel complesso, il caso di studio sostiene il valore scientifico e sociale delle politiche di scienza aperta, alle quali si sono impegnati la Svizzera, l'UE, altri paesi europei e gli Stati Uniti. Dimostra inoltre il ruolo delle infrastrutture di ricerca, di cui UniProt fa parte, nel sostenere la scienza aperta e più in generale le politiche economiche, sanitarie e ambientali.

Tali prove sono più cruciali che mai: nonostante gran parte delle risorse globali di biodati provenga da SIB, EMBL-EBI e altre istituzioni europee e americane, il finanziamento delle infrastrutture di ricerca rimane una questione aperta nei rispettivi paesi. Il SIB e tutti gli altri fornitori di risorse dati di alta qualità e attività strategiche relative ai dati necessitano di finanziamenti sostenibili per soddisfare le crescenti esigenze di accelerazione della ricerca, innovazione e soluzioni alle questioni globali.

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