I ricercatori accademici e privati che utilizzano UniProt, una banca dati unica e di alta qualità sulle proteine sviluppata in collaborazione con il SIB, beneficiano di un aumento dell'efficienza pari a 373-565 milioni di euro all'anno. Si tratta di un ritorno sull'investimento impressionante rispetto ai costi operativi annuali di 14,6 milioni di euro. UniProt genera anche benefici socioeconomici a lungo termine, come dimostrano le oltre 15.200 pubblicazioni scientifiche e le più di 183.000 pubblicazioni di brevetti che lo citano fino ad oggi. Questo valore è particolarmente importante per la Svizzera, dato che tre delle prime cinque organizzazioni che depositano brevetti sono aziende svizzere globali o loro filiali. Questi risultati sono stati pubblicati oggi in un caso di studio condotto dal CSIL in collaborazione con ELIXIR, nell'ambito del progetto PathOS finanziato dall'UE per comprendere e misurare meglio l'impatto della scienza aperta.
UniProt è la principale fonte mondiale di informazioni di alta qualità, complete e liberamente accessibili sulla sequenza e la funzione delle proteine. Frutto della collaborazione tra il SIB, l'Istituto europeo di bioinformatica (EMBL-EBI) e la Protein Information Resource (PIR), comprende una serie di banche dati che includono UniProtKB/Swiss-Prot, curata in base a criteri di eccellenza e gestita da il SIB.
UniProt è riconosciuto per la sua importanza fondamentale per la più ampia comunità delle scienze della vita e per la conservazione a lungo termine dei dati come risorsa al SIB, ELIXIR Core Data Resource e risorsa dati biologici core globale. È stato scelto per l'analisi costi-benefici da ELIXIR, che conduce un caso di studio sulle risorse bioinformatiche aperte per il progetto PathOS.
Quantificare i vantaggi e il valore della scienza aperta
La condivisione aperta di dati e conoscenze è sempre più riconosciuta come essenziale per accelerare il progresso scientifico, promuovere l’innovazione e rafforzare la fiducia del pubblico nella scienza. Sebbene siano state raccolte prove a sostegno di questi risultati positivi, manca ancora un metodo comune per misurare sistematicamente gli impatti accademici e socioeconomici.
UniProt è la principale fonte mondiale di informazioni di alta qualità, complete e liberamente accessibili sulla sequenza e la funzione delle proteine. Frutto della collaborazione tra il SIB, l'Istituto europeo di bioinformatica (EMBL-EBI) e la Protein Information Resource (PIR), comprende una serie di banche dati che includono UniProtKB/Swiss-Prot, curata in base a criteri di eccellenza e gestita da il SIB.
UniProt è riconosciuto per la sua importanza fondamentale per la più ampia comunità delle scienze della vita e per la conservazione a lungo termine dei dati come risorsa al SIB, ELIXIR Core Data Resource e risorsa dati biologici core globale. È stato scelto per l'analisi costi-benefici da ELIXIR, che conduce un caso di studio sulle risorse bioinformatiche aperte per il progetto PathOS.
Un nuovo quadro di riferimento specificamente studiato per misurare i benefici e gli impatti delle pratiche di scienza aperta sta colmando questa lacuna, con UniProt, una risorsa dati aperti essenziale e riconosciuta a livello globale per le scienze della vita, come primo caso di studio. Attraverso un'analisi costi-benefici adattata e una valutazione del "percorso di impatto", lo studio rileva che UniProt fornisce:
miglioramenti in termini di efficienza per gli utenti del settore accademico e privato pari a 373-565 milioni di euro all'anno, con una parte significativa di questo beneficio derivante dalla curatela dei dati da parte di esperti del gruppo Swiss-Prot del SIB con sede a Ginevra;
un beneficio netto diretto che supera i suoi costi operativi di 14,6 milioni di euro con un rapporto compreso tra 25 e 39 a uno;
un valore a lungo termine per la scienza e la società, accelerando la diffusione di nuove conoscenze e innovazioni, facilitando le collaborazioni tra università e settore privato e generando nuove idee imprenditoriali;
un forte valore per la Svizzera, con aziende o filiali svizzere globali che comprendono tre delle prime cinque organizzazioni che pubblicano brevetti in cui si menziona UniProt.
L’analisi fornisce ai finanziatori di UniProt – la Segreteria di Stato per la formazione, la ricerca e l'innovazione (SEFRI), il Laboratorio europeo di biologia molecolare (EMBL) e gli Istituti nazionali di sanità degli Stati Uniti (NIH) – prove concrete sul ritorno dei loro investimenti. Fornisce inoltre un argomento convincente a favore del finanziamento sostenibile delle risorse dati aperti in generale, comprese quelle fornite dal SIB e dall’infrastruttura europea di dati per le scienze della vita ELIXIR. Il quadro generale – sviluppato da CSIL, un istituto di ricerca economica, per il progetto PathOS di Horizon Europe – fornisce inoltre un potente strumento decisionale per promuovere politiche a favore della scienza aperta.
In un momento in cui le infrastrutture di dati vitali devono affrontare una crescente incertezza, questa analisi indipendente lo dimostra chiaramente: UniProt è una risorsa strategica e di grande impatto. Offre un valore eccezionale alla comunità scientifica globale, è alla base di decine di migliaia di brevetti e apporta benefici sproporzionati ai paesi che investono in essa.
I vantaggi immediati di UniProt superano di gran lunga i suoi costi
L'analisi costi-benefici adattata condotta dal CSIL per il caso di studio valuta specificamente i risultati a breve termine direttamente attribuibili a UniProt. Il costo operativo medio annuo è stato calcolato in 14,6 milioni di euro per il periodo 2017-2023, comprendente i costi di gestione coperti dai tre finanziatori e da altre fonti, oltre ai contributi degli utenti per il miglioramento dei dati sulle proteine.
I benefici per gli utenti sono stati identificati tramite un sondaggio e consistevano principalmente nel tempo risparmiato in tre aree:
accesso gratuito ai dati e alle conoscenze aperte di UniProt rispetto alla negoziazione dell'accesso ad alternative limitate o proprietarie (risparmio sui costi di transazione);
accesso diretto alle informazioni integrate in UniProt rispetto all'accesso separato a fonti diverse (risparmio sui costi di accesso);
semplificazione del lavoro quotidiano rispetto alla necessità di integrare, interpretare e verificare i dati provenienti da altre fonti (risparmio sui costi di manodopera).
Il valore monetario complessivo di questo risparmio di tempo è stato stimato tra 373 e 565 milioni di euro all'anno. Sebbene l'analisi non abbia potuto includere tutti i costi storici associati allo sviluppo di UniProt – quali gli investimenti iniziali, gli sforzi di espansione e gli aggiornamenti significativi – e non rifletta i benefici a lungo termine e indiretti (discussi di seguito), tale valore supera i costi operativi attuali della risorsa in un rapporto compreso tra 25 (stima minima) e 39 (stima massima) a uno.
La cura e la gestione dei dati offrono numerosi vantaggi agli utenti
Le interviste e i focus group hanno rivelato che il risparmio di tempo per gli utenti è in gran parte attribuibile all’impegno costante degli scienziati impiegati presso il SIB, EMBL-EBI e PIR nel migliorare l’accessibilità dei dati, potenziarne l’interoperabilità e curare con competenza le sequenze proteiche in Swiss-Prot integrandole con informazioni tratte dalla letteratura scientifica sulla struttura e la funzione delle proteine.
Il costo del lavoro legato alla curatela e alla gestione dei dati rappresenta la maggior parte dei costi operativi di UniProt. Tuttavia, come evidenziato nello studio, questo lavoro – in particolare la curatela esperta dei dati da parte del gruppo Swiss-Prot del SIB – non può essere svolto da altre organizzazioni esistenti né sostituito dalle tecnologie di intelligenza artificiale. Infatti, il sondaggio tra gli utenti non è riuscito a identificare un'alternativa pienamente comparabile a UniProt, con:
il 74% degli intervistati ha dichiarato che non avrebbe accesso agli stessi dati da risorse dati limitate o chiuse;
il 68% ha dichiarato che non sarebbe in grado di ricreare gli stessi dati.
Ciò che distingue davvero UniProt è la curazione dei dati da parte di esperti: l'intuizione umana che distilla la vasta mole di letteratura scientifica in conoscenze proteiche affidabili e di alta qualità. Questa curazione non solo catalizza la ricerca e l'innovazione di oggi, ma è fondamentale per costruire i sistemi di IA affidabili, etici e generalizzabili di domani.
Le cinque principali organizzazioni che hanno depositato brevetti citando UniProt
Genentech – 960 (Stati Uniti; filiale di F. Hoffmann-La Roche)
F. Hoffmann-La Roche – 948 (svizzera)
Novozymes – 705 (Danimarca)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale – 589 (Francia)
Novartis – 574 (Svizzera)
UniProt offre un valore a lungo termine alla scienza e alla società
La quantificazione degli impatti a lungo termine, effettuata attraverso l'analisi della letteratura scientifica e dei brevetti, ha dimostrato che UniProt contribuisce inoltre a:
Le cinque principali organizzazioni che hanno depositato brevetti citando UniProt
Genentech – 960 (Stati Uniti; filiale di F. Hoffmann-La Roche)
F. Hoffmann-La Roche – 948 (svizzera)
Novozymes – 705 (Danimarca)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale – 589 (Francia)
Novartis – 574 (Svizzera)
nuove conoscenze, con citazioni in oltre 15.200 pubblicazioni scientifiche in una vasta gamma di settori delle scienze della vita e della tecnologia – di cui il 31% direttamente correlato agli Obiettivi di Sviluppo Sostenibile (SDG) delle Nazioni Unite;
ricerca e sviluppo e innovazione, anche in Svizzera, con citazioni in oltre 183.000 pubblicazioni di brevetti – dove tre delle prime cinque organizzazioni che depositano brevetti sono aziende svizzere globali o loro filiali – oltre a citazioni di brevetti che fanno riferimento a UniProt in ulteriori brevetti a valle.
Sondaggi e interviste agli utenti hanno identificato ulteriori effetti a lungo termine resi possibili da UniProt, tra cui collaborazioni pubblico-private, sviluppo di prodotti e servizi e processi di produzione migliorati.
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Necessità di un finanziamento sostenibile delle infrastrutture di ricerca
Nel complesso, il caso di studio sostiene il valore scientifico e sociale delle politiche di scienza aperta, alle quali si sono impegnati la Svizzera, l'UE, altri paesi europei e gli Stati Uniti. Dimostra inoltre il ruolo delle infrastrutture di ricerca, di cui UniProt fa parte, nel sostenere la scienza aperta e più in generale le politiche economiche, sanitarie e ambientali.
Tali prove sono più cruciali che mai: nonostante gran parte delle risorse globali di biodati provenga da SIB, EMBL-EBI e altre istituzioni europee e americane, il finanziamento delle infrastrutture di ricerca rimane una questione aperta nei rispettivi paesi. Il SIB e tutti gli altri fornitori di risorse dati di alta qualità e attività strategiche relative ai dati necessitano di finanziamenti sostenibili per soddisfare le crescenti esigenze di accelerazione della ricerca, innovazione e soluzioni alle questioni globali.
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