Identifichiamo biomarcatori, bersagli farmacologici e altro ancora, avvalendoci dell'apprendimento automatico, dei modelli linguistici di grandi dimensioni, di altri modelli di intelligenza artificiale, della biostatistica e della biologia computazionale.
I nostri esperti possono supportare il vostro progetto con:
- analisi di imaging molecolare;
- assemblaggiode novo dei dati di sequenziamento;
- analisi di sequenziamento mirato, dell’esoma e dell’intero genoma;
- analisi comparativa del genoma;
- analisi dei dati metagenomici;
- analisi delle vie metaboliche e delle reti di regolazione trascrizionale (analisi funzionale);
- analisi omica;
- visualizzazione dei dati;
- previsione e annotazione genica.
Promuovere la medicina di precisione attraverso l'integrazione dei dati multi-omici
La sfida
Trasformare i big data multi-omici in informazioni funzionali per consentire la prevenzione , la diagnosi precoce e la previsione delle malattie, monitorarne la progressione e progettare trattamenti personalizzati.
La nostra soluzione
Conduciamo una potente integrazione dei dati grazie alla nostra innovativa competenza nell'analisi multiomica. In grado di gestire grandi set di dati multiomici eterogenei, i nostri team iniziano definendo la strategia di integrazione dei dati appropriata. Successivamente, costruiscono modelli statistici integrativi per analizzare e interpretare i dati. Infine, conducono analisi dei percorsi per facilitare la comprensione dei meccanismi molecolari in gioco. Ad esempio, nel progetto Rhapsody finanziato dall'UE, abbiamo integrato dati lipidomici, trascrittomici e clinici per identificare potenziali biomarcatori del diabete di tipo 2.
Impronta metabolica ambientale per caratterizzare l'impatto dei (bio)pesticidi
La sfida
Stimare il tempo di resilienza dei metaboliti esogeni nel suolo trattato con un pesticida, sintetico o derivato da materiali naturali.
La nostra soluzione
Eseguiamo modelli cinetici delle caratteristiche della cromatografia liquida-spettrometria di massa (LC-MS) a partire da dati metabolomici non mirati per prevedere la dissipazione di quelli derivanti dal trattamento. Ad esempio, collaboriamo con l'Università di Perpignan (Francia) per seguire il destino di un terreno trattato con un estratto vegetale.
Analisi del sequenziamento dell'intero genoma per caratterizzare i patogeni fungini in diversi ambienti
La sfida
Identificare l'eterogeneità genomica tra più microrganismi.
La nostra soluzione
Eseguiamo l'assemblaggiode novo del genoma, l'annotazione genica e il rilevamento delle varianti su diversi isolati di specie fungine con dati di sequenziamento dell'intero genoma. Collaboriamo con l'Ospedale universitario di Losanna (CHUV) per studi sulle specie Candida.
