Microbial Evolution

Il nostro obiettivo è comprendere come funziona l'evoluzione a livello molecolare e come gli organismi si adattano alle condizioni mutevoli attraverso mutazioni casuali e ricombinazioni. Gli agenti patogeni costituiscono eccellenti modelli per lo studio di questi processi. Applichiamo moderne tecniche di sequenziamento per decifrare il genoma di migliaia di particelle di HIV e sviluppiamo nuovi algoritmi per chiarire le interazioni tra l'HIV e il sistema immunitario. Abbiamo sviluppato un metodo in grado di prevedere l'evoluzione dei virus influenzali sulla base del loro albero filogenetico (nextflu.org). Tali previsioni possono aiutare a garantire che il vaccino contro l'influenza stagionale sia efficace contro i virus in circolazione.

Il gruppo sviluppa la risorsa SIB Nextstrain, uno strumento software per monitorare l'evoluzione dei patogeni in tempo reale