Microbial Evolution

Notre objectif est de comprendre comment l'évolution fonctionne au niveau moléculaire et comment les organismes s'adaptent aux conditions changeantes grâce à des mutations aléatoires et à la recombinaison. Les agents pathogènes constituent d'excellents modèles pour étudier ces processus. Nous utilisons des techniques de séquençage modernes pour déchiffrer le génome de milliers de particules de VIH et développons de nouveaux algorithmes pour élucider les interactions entre le VIH et le système immunitaire. Nous avons mis au point une méthode permettant de prédire l'évolution des virus de la grippe à partir de leur arbre phylogénétique (nextflu.org). Ces prédictions peuvent aider à garantir que le vaccin contre la grippe saisonnière correspond aux virus en circulation.

Le groupe développe la ressource SIB Nextstrain, un outil logiciel permettant de suivre l'évolution des agents pathogènes en temps réel