Les chercheurs du SIB assurent la gestion, la mise en commun et l’analyse des données biomédicales pour plusieurs grands consortiums européens public-privé qui s’intéressent, directement ou indirectement, au diabète de type 2 (DT2). À l’occasion de la Journée mondiale du diabète, nous mettons en avant quatre conclusions issues d’études co-rédigées par nos chercheurs et leurs collaborateurs, et soutenues par ces consortiums.

Bioinformatique : des données à la découverte

La bioinformatique – la science qui consiste à stocker, relier, analyser et interpréter des données biologiques – façonne nos vies d’une manière que la plupart des gens ne voient jamais, qu’il s’agisse d’orienter les traitements contre le cancer ou d’éclairer les efforts de conservation. Cette série met en lumière des exemples illustrant comment les scientifiques du réseau SIB transforment les données en connaissances et en actions concrètes.

L’âge est le facteur de risque le plus important connu pour le DT2. Pourtant, le vieillissement et le DT2 laissent des profils de méthylation de l’ADN – des marqueurs chimiques qui contribuent à l’activation ou à la désactivation des gènes – presque totalement différents dans les îlots pancréatiques producteurs d’insuline. Les modifications liées à l’âge agissent conjointement sur les gènes impliqués dans la sécrétion d’insuline, tandis que celles liées au DT2 sont dispersées et semblent refléter un stress cellulaire. Un score de méthylation lié à l’âge a permis de distinguer les donneurs atteints de DT2 plus efficacement que le risque génétique. La combinaison de ces deux éléments pourrait affiner l’évaluation des risques.

Bioinformatique : des données à la découverte

La bioinformatique – la science qui consiste à stocker, relier, analyser et interpréter des données biologiques – façonne nos vies d’une manière que la plupart des gens ne voient jamais, qu’il s’agisse d’orienter les traitements contre le cancer ou d’éclairer les efforts de conservation. Cette série met en lumière des exemples illustrant comment les scientifiques du réseau SIB transforment les données en connaissances et en actions concrètes.

Avec le soutien d’OBELISK, un partenariat public-privé européen cofinancé par le Secrétariat d’État à la formation, à la recherche et à l'innovation (SEFRI).

Consultez l’étude dans Nature Communications

Un médicament potentiel pour améliorer la sécrétion d'insuline

Les cellules β productrices d’insuline provenant de 13 des 21 donneurs diabétiques ont retrouvé une partie de leur réponse au sucre après seulement trois jours passés à des taux de glucose normaux – ce qui est proche des taux de rémission observés après une chirurgie bariatrique ou un régime très hypocalorique. Les gènes activés au cours de cette récupération étaient similaires à ceux activés par le baricitinib, un médicament anti-inflammatoire approuvé pour le traitement de l’arthrite. Le traitement par le baricitinib a amélioré la sécrétion d’insuline dans les cellules β humaines et ralenti la défaillance des cellules β chez des souris diabétiques.

Avec le soutien de RHAPSODY, un projet de l’Initiative en matière de médicaments innovants (IMI) 2 cofinancé par le SERI.

Consultez l’étude dans Science Advances

Un test urinaire permettrait d'identifier les patients susceptibles de bénéficier d'un médicament contre les complications rénales du diabète

Le médicament atrasentan ralentit la progression de la maladie rénale chez les personnes atteintes de diabète de type 2, mais certains en tirent davantage profit que d’autres. Dans un essai portant sur plus de 3 000 patients, ceux qui présentaient un taux plus élevé d’une protéine urinaire appelée clusterine ont connu une évolution rénale plus défavorable. Six semaines de traitement à l’atrasentan ont permis de réduire les taux de clusterine de 43 % – et plus la baisse était importante, plus le risque de détérioration rénale grave était faible. Un test de dépistage de la clusterine pourrait aider les médecins à évaluer le risque rénal et à déterminer rapidement si le médicament est efficace.

Avec le soutien de BEAt-DKD, un projet IMI 2.

Consultez l’étude dans Nature Communications

Les signaux de l'insuline préservent la santé des cellules filtrantes des reins

La réduction des récepteurs de l'insuline et d'un facteur de croissance apparenté, l'IGF-1, dans les podocytes – les cellules rénales qui filtrent le sang – a provoqué une maladie rénale chez la souris et a entraîné la mort de plus de la moitié des podocytes cultivés en laboratoire en l'espace d'une semaine. Les podocytes dépourvus de récepteurs présentaient des taux plus élevés de messages ARN défectueux et des taux plus faibles de protéines clés associées au mécanisme (spliceosome) chargé d’éditer ces messages. De plus, le blocage de ce mécanisme a entraîné la mort des podocytes normaux, mais pas celle des cellules voisines. Cela ouvre une nouvelle voie pour comprendre la perte de podocytes dans les maladies rénales.

Avec le soutien de BEAt-DKD, un projet IMI 2.

Consultez l’étude dans eLife

Reference(s)

Crédit photo : Cellules pancréatiques productrices d'insuline. William E. Balch, The Scripps Research Institute