En préparant la Suisse à participer à des initiatives européennes et internationales de partage de données, l'initiative SENPro favorisera la science ouverte, accélérera la collaboration et l'innovation et renforcera la souveraineté numérique nationale. Un prototype de nœud EOSC suisse sera créé afin de regrouper les données, les services et les infrastructures de recherche de toutes les disciplines et institutions, dans un cadre commun d'interopérabilité, de découvrabilité et de réutilisabilité conforme aux normes européennes. Le SIB codirige les tests communautaires du prototype avec le Centre d'expertise suisse en sciences sociales (FORS) et coordonne le développement de l'un de ses services de recherche intégrés, Swiss Galaxy.

Une collaboration entre les pionniers suisses de la recherche sur les données

SENPro (Swiss EOSC Node Prototype) est un consortium entre l'ETH Zurich (Centre suisse de calcul scientifique (CSCS), bibliothèque, services informatiques scientifiques, initiatives et infrastructures de recherche), FORS, le SIB, Swiss National Science Foundation, Switch, l'Université de Bâle (Centre de données et de services pour les sciences humaines (DaSCH), l'infrastructure numérique suisse pour la recherche en arts et sciences humaines (DARIAH)), l'Université de Lausanne (Hôpital universitaire de Lausanne (CHUV), Département des ressources d'information et des archives (UNIRIS)) et l'Université de Zurich (Bibliothèque, Infrastructure suisse commune pour les ressources linguistiques et technologiques (CLARIN)). Financé par le programme Open Science II de swissuniversities, le projet s'appuie sur la vaste expertise des partenaires dans la mise en place d'infrastructures de recherche nationales et européennes.

SENPro : l'étape stratégique de la Suisse vers le leadership fédéré en matière de données

La science ouverte renforce l'innovation et la compétitivité en favorisant la collaboration scientifique, la transparence et l'efficacité. Consciente de cela, la communauté internationale de la recherche s'efforce d'améliorer le partage des données et des services de recherche, élément clé de la science ouverte. En Europe, la Fédération EOSC est en train de créer un écosystème de nœuds nationaux et thématiques qui permettra aux chercheurs d'accéder à ces ressources et de les partager de manière transparente, au-delà des disciplines et des frontières.

Une collaboration entre les pionniers suisses de la recherche sur les données

SENPro (Swiss EOSC Node Prototype) est un consortium entre l'ETH Zurich (Centre suisse de calcul scientifique (CSCS), bibliothèque, services informatiques scientifiques, initiatives et infrastructures de recherche), FORS, le SIB, Swiss National Science Foundation, Switch, l'Université de Bâle (Centre de données et de services pour les sciences humaines (DaSCH), l'infrastructure numérique suisse pour la recherche en arts et sciences humaines (DARIAH)), l'Université de Lausanne (Hôpital universitaire de Lausanne (CHUV), Département des ressources d'information et des archives (UNIRIS)) et l'Université de Zurich (Bibliothèque, Infrastructure suisse commune pour les ressources linguistiques et technologiques (CLARIN)). Financé par le programme Open Science II de swissuniversities, le projet s'appuie sur la vaste expertise des partenaires dans la mise en place d'infrastructures de recherche nationales et européennes.

SENPro représente une étape stratégique pour la Suisse afin de participer à l'EOSC et à d'autres écosystèmes de partage de données en pleine évolution, tout en préservant la souveraineté et la compétitivité nationales. Le projet permettra de concevoir et de tester un prototype de nœud EOSC suisse qui réunira les données et les services de recherche importants au niveau national dans un cadre commun aligné sur les normes européennes, les pratiques FAIR (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable) et les réglementations suisses et européennes en matière de partage de données. Cela permettra :

  • accélérera les découvertes et l'innovation en offrant aux chercheurs un accès simplifié à des données et services de recherche interdisciplinaires, y compris des ressources « à longue traîne » qui ne font pas partie de l'infrastructure de recherche spécifique à un domaine existant ;
  • créer un écosystème de données suisse « prêt pour l'avenir et l'IA » qui pourra se connecter à l'EOSC ainsi qu'aux futurs espaces de données européens et aux usines d'IA afin de transformer les données en solutions exploitables ;
  • soutenir une infrastructure de recherche durable grâce à une meilleure réutilisation de la recherche publique et à des investissements stratégiques de la part des bailleurs de fonds et des institutions ;
  • rehausser le profil et la compétitivité de la Suisse en Europe en améliorant la visibilité des resources de données nationales (voir également ci-dessous) ;
  • soutenir l'élaboration de politiques fondées sur des données probantes, reposant sur une science transparente et des données fiables.

Le SIB est partenaire de SENPro, aux côtés d'autres fournisseurs d'infrastructures de recherche suisses, d'établissements d'enseignement supérieur, de réseaux nationaux de recherche et d'éducation et d'hôpitaux universitaires qui couvrent ensemble les sciences sociales, les sciences humaines, les sciences de la vie, la linguistique et la santé (voir encadré). Cette initiative collaborative nationale s'appuie sur le rôle joué par le SIB et d'autres partenaires dans la mise en œuvre de l'EOSC en tant que membres de l'association EOSC et dans le cadre d'autres projets. Elle contribue également à la mission du SIB qui consiste à repousser les limites de la science des données, à fournir aux chercheurs et aux cliniciens des resources de données exceptionnelles, et à fédérer et représenter la bioinformatique suisse.

Voir la contribution du SIB à d'autres projets EOSC

En savoir plus sur l'EOSC

Construire un nœud EOSC suisse durable et axé sur la communauté

SENPro est développé en étroite collaboration avec des chercheurs suisses afin de garantir qu'il réponde à leurs besoins. Dans ce cadre, le SIB co-dirige les travaux avec FORS afin de tester et d'affiner le prototype avec des scientifiques et des infrastructures de recherche. Cela comprend la collecte de commentaires sur la facilité d'utilisation, l'interopérabilité et l'alignement avec les normes suisses et européennes.

Cette approche communautaire aboutira à une feuille de route pour la transition du prototype vers un hub national durable. Une fois la phase initiale terminée, les universités et les instituts de recherche de toute la Suisse seront invités à rejoindre et à développer davantage le nœud, afin d'élargir ses ressources et d'assurer son impact à long terme.

Renforcer la compétitivité et la souveraineté de la Suisse

L'un des services que SENPro vise à intégrer est Swiss Galaxy, une plateforme ouverte et interdisciplinaire qui permettra une analyse transparente des données à l'aide d'outils informatiques sur mesure développés en Suisse. Financé par swissuniversities, son développement est dirigé par l'ETH Zurich par l'intermédiaire du groupe du SIB Biomedical Informatics, qui développe également et intégrera l'outil Metagraph. Swiss Galaxy bénéficie en outre de la contribution de quatre ressources du SIB : Bgee, OMA, OrthoDB et SWISS-MODEL.

Ensemble, SENPro et Swiss Galaxy renforceront la compétitivité de la Suisse en :

  • élargissant l'accès à des données de recherche de haute qualité et en augmentant la visibilité des services, des ressources et des formations nationaux, tout en réduisant la fragmentation et en améliorant l'alignement national et européen ;
  • facilitant les analyses interdisciplinaires ;
  • favorisant la transparence, la reproductibilité et la collaboration ;
  • soutenant la recherche interdisciplinaire sur les défis sociétaux urgents.

Ces initiatives garantissent en outre la souveraineté des données en les conservant dans le pays et en veillant à ce que leurs propriétaires en gardent le contrôle. Les projets assurent également la contribution active et continue de la Suisse à la création d'espaces de données FAIR, transparents et démocratiques.

Reference(s)

Image : consortium SENPro