Paul Thomas rejoint Alan Bridge à la tête du plus grand groupe du SIB, basé à Genève. Pionnier de la biologie computationnelle pour la génomique, chercheur principal d'une ressource d'importance mondiale sur la fonction des gènes et l'un des chercheurs les plus cités au monde, sa nomination renforce encore notre position de leader mondial dans la production de connaissances fiables et prêtes pour l'IA pour la recherche et l'innovation en sciences de la vie.
Stimuler la compétitivité suisse et le progrès mondial
UniProt, GO et d'autres ressources développées conjointement par l'équipe Swiss-Prot sont mentionnées dans plus de 6 300 brevets déposés par des entités suisses, notamment Roche, Novartis, Nestlé, l'EPFL et l'ETH Zurich. Ces ressources sont également citées dans plus de 150 000 articles scientifiques à travers le monde, dans un large éventail de domaines liés aux sciences de la vie et aux technologies. UniProt a également contribué au premier modèle d'IA récompensé par un prix Nobel en tant que source de données d'entraînement fiables.
En savoir plus sur la contribution du SIB au modèle d'IA récompensé par le prix Nobel
En savoir plus sur les avantages d'UniProt pour la science et la société
Renforcer les sources de connaissances biologiques les plus fiables au monde
Le groupe Swiss-Prot, basé à Genève et dirigé par Alan Bridge depuis 2018, développe une suite complète de ressources qui stimulent la recherche et l'innovation en fournissant aux scientifiques et aux développeurs d'IA des données et des connaissances de référence sur les entités biologiques. Parmi celles-ci figurent UniProt, la source d'informations sur les protéines la plus utilisée au monde, et Rhea, une base de données sur les réactions biochimiques, toutes deux reconnues internationalement comme essentielles pour les sciences de la vie dans le monde entier.
Stimuler la compétitivité suisse et le progrès mondial
UniProt, GO et d'autres ressources développées conjointement par l'équipe Swiss-Prot sont mentionnées dans plus de 6 300 brevets déposés par des entités suisses, notamment Roche, Novartis, Nestlé, l'EPFL et l'ETH Zurich. Ces ressources sont également citées dans plus de 150 000 articles scientifiques à travers le monde, dans un large éventail de domaines liés aux sciences de la vie et aux technologies. UniProt a également contribué au premier modèle d'IA récompensé par un prix Nobel en tant que source de données d'entraînement fiables.
En savoir plus sur la contribution du SIB au modèle d'IA récompensé par le prix Nobel
En savoir plus sur les avantages d'UniProt pour la science et la société
L'arrivée de Paul Thomas renforce notre expertise en matière de biocuration et de développement de ressources de connaissances afin de garantir que nos ressources continuent de répondre aux besoins en constante évolution des utilisateurs. Elle renforce également la contribution de longue date du SIB à la ressource Gene Ontology (GO), la base de connaissances sur les fonctions génétiques reconnue à l'échelle internationale qu'il continue de codiriger. Les gains d'efficacité et les projets communs rendus possibles par le regroupement d'UniProt, de GO, de Rhea et d'autres ressources dans le cadre d'une stratégie commune permettront de garantir leur mise à jour en fonction de la quantité toujours croissante de données produites et de continuer à fournir la base de modèles d'IA responsables et reproductibles pour la découverte de médicaments, les biotechnologies, la protection de l'environnement, etc.
En savoir plus sur la reconnaissance internationale d'UniProt et de Rhea
Consultez les ressources développées par le groupe Swiss-Prot
Un bref CV
- Directeur, Division de bioinformatique, École de médecine Keck, Université de Californie du Sud, États-Unis
- Directeur, Gene Ontology Consortium
- Professeur de sciences de la population et de la santé publique, École de médecine Keck, Université de Californie du Sud, États-Unis
- Professeur de biologie quantitative et computationnelle, Université de Californie du Sud, États-Unis
- Directeur, Biologie des systèmes évolutifs, Laboratoire d'intelligence artificielle, SRI International, Californie, États-Unis
- Directeur, Informatique protéique, Celera Genomics, Maryland, États-Unis
- Chercheur, SmithKline Beecham Pharmaceuticals, Pennsylvanie, États-Unis
- Doctorat en biophysique, Université de Californie à San Francisco, États-Unis
Attirer les meilleurs talents américains au SIB et à Genève
Paul Thomas, professeur à la Keck School of Medicine de l'Université de Californie du Sud, contribuera à la mission du SIB en tant que défenseur de données et d'outils de bioinformatique de haute qualité et librement accessibles, une grande partie de ses travaux étant disponibles via GO et d'autres ressources publiques. Ses nombreuses collaborations avec les scientifiques du SIB dans le cadre de divers projets et consortiums lui ont permis d'acquérir une solide compréhension de notre organisation.
Un bref CV
- Directeur, Division de bioinformatique, École de médecine Keck, Université de Californie du Sud, États-Unis
- Directeur, Gene Ontology Consortium
- Professeur de sciences de la population et de la santé publique, École de médecine Keck, Université de Californie du Sud, États-Unis
- Professeur de biologie quantitative et computationnelle, Université de Californie du Sud, États-Unis
- Directeur, Biologie des systèmes évolutifs, Laboratoire d'intelligence artificielle, SRI International, Californie, États-Unis
- Directeur, Informatique protéique, Celera Genomics, Maryland, États-Unis
- Chercheur, SmithKline Beecham Pharmaceuticals, Pennsylvanie, États-Unis
- Doctorat en biophysique, Université de Californie à San Francisco, États-Unis
Parmi les faits marquants de sa carrière, on peut citer
- ses travaux pionniers sur la prédiction des fonctions des gènes codant pour des protéines dans le cadre du projet Génome humain, publiés dans l'article sur le premier génome humain entièrement séquencé en 2001 ;
- son inclusion dans la prestigieuse liste des chercheurs les plus cités au cours des dix dernières années, reflétant ses contributions révolutionnaires dans le domaine de la génomique ;
- l'élaboration de normes mondiales de biocuration pour l'annotation des séquences d'ADN avec des informations sur la fonction des gènes ;
- la création de l'image la plus complète à ce jour de la fonction des gènes humains, en collaboration avec les membres du groupe Swiss-Prot, publiée cette année dans Nature.
Un investissement stable est nécessaire pour les resources de données essentielles
Le maintien de l'excellence des ressources indispensables du SIB dans le domaine des sciences de la vie nécessite non seulement un leadership scientifique et opérationnel, mais aussi un financement à long terme. L'incertitude actuelle concernant les règles de financement public à long terme, en particulier aux États-Unis, et les contraintes budgétaires au niveau fédéral suisse doivent être transformées en investissements ambitieux afin de préserver cette infrastructure essentielle. La compétitivité et la réputation internationale de la Suisse dépendent de telles mesures, tout comme les collaborations et les découvertes qui apportent des solutions aux défis urgents en matière de santé, d'environnement et de société.
Reference(s)
Crédit image : Paul Thomas