Les membres du SIB dirigent ou participent à plusieurs projets qui ont obtenu un financement de swissuniversities à la suite d'un appel à projets visant à promouvoir les données de recherche ouvertes (ORD). De l'intégration de données multi-omiques à un programme de formation pour les gestionnaires de données, ils contribueront à ouvrir la voie à la stratégie nationale ORD dans le domaine des sciences de la vie. S'appuyant sur les synergies entre plusieurs institutions suisses, ils s'alignent également sur la proposition d'une infrastructure nationale visant à favoriser le partage et la réutilisation des données de recherche en sciences de la vie, l'écosystème SwissBioData.
Une vision commune pour la mise en libre accès des données de la recherche en Suisse
Pour soutenir la stratégie et le plan d'action nationaux pour la R&D, swissuniversities a lancé un appel à projets 2022. « Le fait que ces projets, menés par des membres du SIB ou impliquant des membres du SIB, aient été sélectionnés pour bénéficier d'un financement est une formidable réussite. La diversité des thèmes abordés, allant des données omiques et structurelles à la formation et aux collections botaniques, souligne l'urgence d'un besoin transversal de rendre les données partageables et réutilisables dans les sciences de la vie », déclare Christophe Dessimoz, directeur exécutif du SIB. De plus, chaque projet est pleinement conforme aux principes énoncés dans la proposition SwissBioData ecosystem (SBDe), soutenant ainsi fermement le partage des données FAIR dans les sciences de la vie. Cela renforce encore les perspectives de cette initiative, qui a déjà pris de l'ampleur récemment, et démontre une vision commune pour la R&D en Suisse.
Projets bénéficiaires d'une subvention (de plus amples informations sur chaque projet seront bientôt disponibles) :
Les projets ont été soumis à l'appel « Open Science I Phase B – ORD programme » (en allemand), qui vise à fournir un soutien ascendant pour promouvoir l'excellence dans les pratiques ORD ainsi que pour définir, établir et promouvoir les rôles des experts en ORD tels que les gestionnaires de données et les scientifiques des données. Les chefs de groupe et les membres de l'institut dirigent ou contribuent à ces projets, qui combinent des expertises complémentaires et couvrent plusieurs institutions suisses :
- Gestion des connaissances dans le cadre de l'initiative « Jardins botaniques numériques »
Participation du SIB : Ana Claudia Sima et Tarcisio Mendes de Farias, Université de Lausanne
Autres institutions impliquées : Université de Fribourg (chef de file), Université de Neuchâtel, École polytechnique fédérale de Zurich (ETHZ) - ModelArchive : meilleures pratiques en matière de données de recherche ouvertes pour les modèles macromoléculaires computationnels
Responsables du groupe SIB impliqués : Torsten Schwede et Markus Lill, Université de Bâle (maison chef de file), Andrea Cavalli, Institut de recherche en biomédecine, Vincent Zoete et Olivier Michielin, Université de Lausanne et Matteo Dal Peraro, EPFL.
Autres institutions participantes : Université Rutgers (États-Unis), Institut européen de bioinformatique du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL-EBI) (Royaume-Uni), Université de Californie à San Francisco (États-Unis), Université du Maryland (États-Unis) - OMNIBENCHMARK : Favoriser l'évaluation ouverte et continue des méthodes
Responsable du groupe SIB impliqué : Mark D. Robinson, Université de Zurich - scFAIR : Normalisation et gestion des métadonnées sur les cellules individuelles
Responsables du groupe SIB impliqués : Marc Robinson-Rechavi et Frédéric Bastian, Université de Lausanne (cheffe de file), Bart Deplancke, EPFL - Intégration standardisée des données biomédicales multi-omiques
Responsables du groupe SIB impliqués : Mihaela Zavolan et Erik von Nimwegen, Université de Bâle (établissement chef de file).
Autre institution impliquée : EPFL - Swiss Data Stewardship Environment : formation et réseau, pour développer un cours de certification national (CAS) en gestion des données
Participation du SIB : Patricia Palagi, responsable Training
Autres institutions impliquées : Université de Lausanne (maison pilote), Haute École Pédagogique Vaud (HEP Vaud), Université de Genève, Haute École de Gestion de Genève (HEG Genève), Centre d'expertise suisse en sciences sociales (FORS), Université de Zurich, Haute école d'art et de design Zurich (ZHAW)
