Dall'analisi del genoma umano sono stati individuati circa 20.300 geni codificanti proteine. In occasione del suo decimo anniversario, l'Human Proteome Project (HPP) annuncia la validazione sperimentale del 90,4% del proteoma umano con elevata rigorosità, una pietra miliare significativa. La pubblicazione sottolinea il ruolo della risorsa Il SIB neXtProt come base di conoscenza di riferimento dell'HPP.
Informazioni su HPP, un'iniziativa comunitaria e scientifica aperta
Nel 2010, la Human Proteome Organization ha lanciato il Progetto Proteoma Umano, creando un quadro internazionale per la collaborazione globale, la condivisione dei dati, la garanzia della qualità e il miglioramento dell'annotazione accurata del proteoma codificato dal genoma. Nel corso del decennio successivo, l'HPP ha stabilito collaborazioni, sviluppato linee guida e metriche e intrapreso una rianalisi dei dati della comunità precedentemente depositati, aumentando continuamente la copertura del proteoma umano. Per un viaggio interattivo nella storia della proteomica, date un'occhiata alla cronologia dell'HUPO
Il SIB Resource neXtProt è il database di riferimento ufficiale del progetto HPP: in stretta collaborazione con altri partner chiave del progetto, come PeptideAtlas o Human Protein Atlas, centralizza, standardizza e ridistribuisce i dati e offre una serie di indicatori per misurare i progressi del progetto. In particolare, neXtProt fornisce uno stato di "esistenza della proteina" per ogni voce, che indica il tipo di prova a sostegno dell'esistenza della proteina. Per saperne di più
In occasione del suo decimo anniversario e utilizzando questi indicatori, HPP riporta un progetto del proteoma umano completo al 90,4% e altamente rigoroso (vedi Riferimenti): in altre parole, oltre il 90% delle proteine previste è stato ora validato sperimentalmente.
"Siamo molto orgogliosi di partecipare a questa avventura guidata dalla comunità per approfondire la nostra conoscenza e comprensione delle proteine umane attraverso neXtProt. Si tratta di un risultato straordinario", afferma Lydie Lane, coautrice dell'articolo e Associate Group Leader presso CALIPHO.
La prossima sfida dell'HPP sarà quella di comprendere il ruolo svolto da ciascuna di queste proteine nella salute e nelle malattie umane e utilizzare queste conoscenze per migliorare la nostra comprensione, diagnosi e trattamento dei tumori, delle malattie cardiovascolari e infettive.
Reference(s)
Adhikari S et al. Un modello altamente rigoroso del proteoma umano, Nature Communications, 2020.
Omen G S et al. La ricerca sul proteoma umano raggiunge un traguardo importante: secondo l'HUPO Human Proteome Project,oltre il 90% delle proteine umane previste è ora rilevabile in modo attendibile, J. Proteome Res., 2020.
