Il SIB Istituto Svizzero di Bioinformatica è stato recentemente invitato all'AI-Bioscience Collaborative Summit di Washington DC per il suo ruolo di primo piano nella fornitura di dati di alta qualità. Il ruolo del SIB come co-organizzazione leader di UniProt, il database open-access di alta qualità leader a livello mondiale per le sequenze proteiche e le informazioni funzionali, è stato sottolineato durante tutto l'evento. Il Summit ha sottolineato il ruolo fondamentale che i database curati svolgono nel progresso dei modelli di IA, citando UniProt come una risorsa essenziale che ha reso possibile il lavoro innovativo riconosciuto dal recente Premio Nobel per la Chimica nel campo della biologia strutturale.
UniProt è un consorzio che riunisce le forze dei team al SIB Istituto Svizzero di Bioinformatica, dell'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) e del Protein Information Resource (PIR) negli Stati Uniti*. In questi istituti, oltre 100 esperti sono coinvolti in attività che vanno dalla cura di dati affidabili sulle proteine allo sviluppo di software e all'assistenza agli utenti. Questa risorsa è una delle basi di conoscenza più utilizzate nelle scienze della vita, con oltre 5,5 milioni di utenti e 2.000 citazioni all'anno. Grazie ai suoi set di dati di alta qualità, UniProt supporta i modelli di intelligenza artificiale e accelera le scoperte e le applicazioni in diversi campi, dalla medicina alla conservazione dell'ambiente.
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Temi di convergenza, dati aperti e collaborazione
Uno dei temi centrali del Summit è stata la convergenza tra IA e biotecnologie, con particolare attenzione ai grandi set di dati aperti, un ambito direttamente correlato alla missione del SIB.
UniProt è un consorzio che riunisce le forze dei team al SIB Istituto Svizzero di Bioinformatica, dell'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) e del Protein Information Resource (PIR) negli Stati Uniti*. In questi istituti, oltre 100 esperti sono coinvolti in attività che vanno dalla cura di dati affidabili sulle proteine allo sviluppo di software e all'assistenza agli utenti. Questa risorsa è una delle basi di conoscenza più utilizzate nelle scienze della vita, con oltre 5,5 milioni di utenti e 2.000 citazioni all'anno. Grazie ai suoi set di dati di alta qualità, UniProt supporta i modelli di intelligenza artificiale e accelera le scoperte e le applicazioni in diversi campi, dalla medicina alla conservazione dell'ambiente.
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Maggiori informazioni sull'impatto delle risorse del SIB
La discussione sull'importanza della collaborazione tra discipline e paesi per lo sviluppo dell'IA ha fatto eco al posizionamento del nostro istituto. Il SIB sta collegando tutti i campi delle scienze della vita con risorse, servizi e formazione per consentire l'integrazione di una grande varietà di set di dati e l'applicazione delle scoperte in un'ampia gamma di settori.
Set di dati di riferimento di alta qualità come catalizzatori per scoperte vincitrici del Premio Nobel
Un tema ricorrente è stata l'urgente necessità di disporre di set di dati completi per far progredire i modelli di IA e i potenziali rischi legati alla compartimentazione dei dati proprietari, che soffoca l'innovazione. Il recente Premio Nobel per la Chimica (AlphaFold e RosettaFold) esemplifica il potenziale dell'IA nelle bioscienze e nelle biotecnologie. Set di dati di riferimento di alta qualità come UniProt sono stati evidenziati come fattori fondamentali per il raggiungimento di questi risultati.
Sfide di finanziamento per le risorse dati all'avanguardia
Il SIB sostiene da tempo modelli di finanziamento sostenibili a supporto delle risorse essenziali per la ricerca. Durante il Summit, i partecipanti hanno sottolineato l'importanza cruciale di questo tema. Nonostante il loro comprovato valore nei progressi delle bioscienze guidati dall'intelligenza artificiale e il loro ruolo di lunga data come acceleratori della ricerca, molte risorse dati devono affrontare carenze di finanziamenti e mancano di incentivi per la manutenzione a lungo termine.
La necessità di benchmarking e valutazione
Il benchmarking e la valutazione dei modelli di IA, campi in cui anche il SIB è attivo e riconosciuto, sono essenziali per garantire l'efficacia e costruire la fiducia degli utenti. La valutazione è fondamentale sia per convalidare le prestazioni del modello che per aumentare l'accettazione tra i potenziali utenti. Le sfide relative alle risorse dati, come l'eterogeneità dei dati, i limiti di leggibilità delle macchine e le complesse esigenze di metadati, rappresentano ostacoli significativi all'interoperabilità dei set di dati. La mancanza di metodi di valutazione standardizzati per i modelli di apprendimento automatico aggiunge complessità agli sforzi di integrazione dell'IA. CASP e CAMEO (sviluppati presso il SIB) sono stati citati più volte come strumenti fondamentali per migliorare l'affidabilità e le prestazioni dell'IA nella bioinformatica strutturale.
Un appello per la condivisione standardizzata dei dati e per l'adozione di quadri normativi in materia di sicurezza
Il vertice AI-Bioscience è stato una piattaforma stimolante per rafforzare la richiesta di standardizzazione della condivisione dei dati e dei quadri di sicurezza, essenziali per la trasparenza e la collaborazione transfrontaliera. Il SIB è convinta che l'IA svolgerà un ruolo cruciale nella risoluzione di complesse questioni biologiche. Questo vertice è stato un'occasione preziosa per condividere prospettive sul progresso verso questo obiettivo e per sottolineare il ruolo indispensabile dei dati curati nell'IA.
Partecipazione globale e sostegno di alto livello
Il vertice è stato co-organizzato dal Dipartimento di Stato degli Stati Uniti, Microsoft, le Accademie Nazionali degli Stati Uniti, la Fondazione Nazionale per la Scienza degli Stati Uniti e l'Istituto Nazionale di Standard e Tecnologia (NIST). Tra i partecipanti figuravano rappresentanti di istituzioni accademiche, industrie e uffici scientifici provenienti da Europa, Regno Unito, Francia, Germania, Brasile, India, Giappone, Corea, Israele e Sudafrica. Il SIB è stato invitato per il suo ruolo di leader mondiale nella fornitura di risorse dati. L'importanza del vertice è stata sottolineata dal discorso del Segretario di Stato americano Antony Blinken durante la seconda giornata.
