Deux bioinformaticiens en début de carrière ont été récompensés pour leurs modèles mathématiques et d'intelligence artificielle, ainsi que pour une ressource collaborative destinée à l'analyse de données unicellulaires. Les trois lauréats des SIB Bioinformatics Awards 2025 ont présenté leurs travaux à plus de 500 scientifiques internationaux lors dela Basel Computational Biology Conference de cette année. Ces prix prestigieux sont ouverts aux chercheurs du monde entier et reflètent l'engagement de longue date du SIB en faveur de l'excellence dans le domaine de la bioinformatique.
Prix de début de carrière
Identification de composés biochimiques à l'aide de l'IA : Michael Skinnider
Michael Skinnider a reçu le prix Early Career Award 2025 pour son application innovante de la biologie computationnelle et de l'IA à un éventail impressionnant de questions et d'analyses biologiques, y compris le nouveau domaine de la métabolomique. Parmi ses trois réalisations professionnelles notables, on peut citer :
- le développement, alors qu'il était étudiant de premier cycle, d'un logiciel permettant de découvrir de nouveaux métabolites microbiens ayant des applications alimentaires, agricoles et médicales, qui a donné naissance à une entreprise dérivée couronnée de succès ;
- le développement, pendant son doctorat, d'une IA générative capable de prédire les structures probables de nouveaux médicaments de synthèse, qui a depuis été déployée dans de nombreux laboratoires médico-légaux et policiers ;
- l'utilisation de la même approche pour cartographier les métabolites des mammifères, dont la grande majorité reste inconnue. En plus de combler une lacune fondamentale dans notre compréhension des systèmes vivants, ce « modèle linguistique biochimique » aidera également à identifier de nouveaux biomarqueurs de maladies et de nouvelles cibles thérapeutiques.
Prix de thèse
Étude du vieillissement à l'aide d'un modèle de dommages moléculaires aléatoires : David Meyer
David Meyer a reçu le prix 2025 PhD Paper Award pour son article sur la modélisation mathématique publié dans Nature Aging, qui apporte des preuves solides que le vieillissement est causé par des dommages moléculaires aléatoires plutôt que par un processus biologique évolutif. Intitulé « Aging clocks based on accumulating stochastic variation » (Les horloges du vieillissement basées sur l'accumulation de variations stochastiques) et publié l'année dernière, cet article présente une approche novatrice pour résoudre une question de longue date et a déjà été cité plus de 90 fois.
Les juges ont également décerné des mentions honorables dans la catégorie Prix du meilleur article de doctorat à :
- Can Chen, de l'Université McGill, au Canada, pour l'article « Structure-aware protein self-supervised learning »(Apprentissage auto-supervisé des protéines tenant compte de leur structure)
- Yifan Zhao, actuellement à Harvard-MIT Health Sciences and Technology, États-Unis, pour l'article « Learning interpretable cellular and gene signature embeddings from single-cell transcriptomic data »(Apprentissage d'intégrations interprétables de signatures cellulaires etgénétiques à partir de donnéestranscriptomiques unicellulaires)
Prix de la ressource innovante
Une infrastructure communautaire pour les données « omiques » unicellulaires : scverse
scverse est un écosystème communautaire d'outils informatiques open source destinés à l'analyse de données génomiques unicellulaires et d'autres données omiques, la nouvelle frontière de la recherche en sciences de la vie. Le fait de les regrouper dans un cadre commun et open source facilite non seulement la création, le partage et l'utilisation des outils par les chercheurs, mais garantit également leur maintenance à long terme. Le prix « 2025 Innovative Resource Award » a été remis à Ilan Gold, membre de l'équipe centrale de scverse.
Un prix prestigieux et de longue date
Les SIB Bioinformatics Awards, qui ont lieu tous les deux ans depuis 2008, sont ouverts aux chercheurs du monde entier. Les lauréats sont sélectionnés par un jury international d'experts et annoncés lors de la [BC]2 Basel Computational Biology Conference, où ils bénéficient d'une large visibilité au sein de la communauté bioinformatique grâce à une conférence plénière.
![Ilan Gold presenting at the [BC]2 Basel Computational Biology Conference](/sites/default/files/styles/card_image/public/2025-10/ilan-gold-banner.webp?h=602a36b5&itok=YvC9BUMP)
![Michael Skinnider presenting at the [BC]2 Basel Computational Biology Conference](/sites/default/files/styles/card_image/public/2025-10/michael-skinnider-banner.webp?h=602a36b5&itok=tmJobPUi)
![David Meyer presenting at the [BC]2 Basel Computational Biology Conference](/sites/default/files/styles/card_image/public/2025-10/david-meyer-banner.webp?h=602a36b5&itok=JRGMwIRV)