La bioinformatique est fondamentale pour la médecine de précision. Mais pourquoi ? Comment les hôpitaux et les chercheurs tirent-ils profit de la bioinformatique pour aider les patients ? La chaîne de télévision Canal9, le département d'oncologie de l'UNIL/CHUV et le SIB se sont associés pour répondre à ces questions. Quatre courts métrages de vulgarisation, tirés directement du documentaire « Santé personnalisée, santé sur mesure », ont été réalisés. Chacun d'entre eux explique différents aspects de la médecine de précision : du comité multidisciplinaire des tumeurs et de la pathologie à la modélisation moléculaire et à l'oncologie.
Le comité moléculaire des tumeurs
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Découvrez le comité multidisciplinaire de tumeurs moléculaires au cœur de l'oncologie personnalisée. Les téléspectateurs suivent le cas d'un patient atteint d'un cancer de la peau dont la tumeur est analysée par des pathologistes, des biologistes, des bioinformaticiens, des scientifiques spécialisés en modélisation moléculaire et des oncologues, qui travaillent tous dans le même but : rechercher les mutations pathogènes dans l'ADN du patient et lui proposer le meilleur traitement personnalisé possible.
L'institut de pathologie
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Le chemin est long entre la première consultation d'un patient chez un oncologue et le pronostic final. Chaque tumeur est différente, et les pathologistes et bioinformaticiens travaillent en étroite collaboration pour décrire les caractéristiques morphologiques, moléculaires et génétiques qui aideront finalement l'oncologue à établir un pronostic définitif.
Bioinformatique et modélisation moléculaire
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Une fois que les pathologistes et les bioinformaticiens ont identifié les mutations potentiellement pathogènes, il appartient aux spécialistes de la modélisation moléculaire de comprendre comment une mutation donnée interfère avec la fonction d'une protéine. À partir d'informations issues de différentes bases de données et d'études menées dans le monde entier, la modélisation moléculaire permet de visualiser et de déterminer le type de traitement qui pourrait être le plus efficace pour un type de tumeur donné.
Bioinformatique en oncologie
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La quantité de données cliniques produites chaque jour est colossale. Les bioinformaticiens ne se contentent pas de les analyser et de les gérer, ils les remodèlent, les interprètent et leur donnent un sens, transformant ainsi ces « mégadonnées » en « données intelligentes ». Grâce à diverses plateformes d'analyse gérées par des bioinformaticiens, les « données intelligentes » sont ensuite utilisées par les hôpitaux et les médecins, qui peuvent ainsi prendre les décisions médicales les plus adaptées à chaque patient. Dans cette vidéo, découvrez certaines des applications déjà utilisées couramment ainsi que les défis à relever.
Le projet, co-dirigé par Stéphane Wicky (producteur et réalisateur à Canal9) et Vincent Zoete (Group Leader au SIB), a été financé par la Fondation Leenaards et est le fruit d'une collaboration entre :
- Le groupe de modélisation moléculaire du SIB et les équipes Outreach et Clinical Bioinformatics du SIB ;
- Canal9 (la télévision cantonale valaisanne) ;
- L'Université de Lausanne, le Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) et son Comité tumoral moléculaire (TBM), l'EPFL
- Ludwig Cancer Research
- Plateforme SantéPerSo
- Médecine & Hygiène