Le SIB s'efforce de faire progresser et d'harmoniser les pratiques de préservation numérique et de conservation des données en Europe, grâce à deux projets financés par l'UE qui ont démarré ce mois-ci. Les projets EOSC EDEN et FIDELIS s'appuient sur notre longue expertise dans la maintenance de ressources de données biologiques fiables et de haute qualité pour la communauté des sciences de la vie, et soutiennent notre mission qui consiste à encourager la recherche et l'innovation grâce à FAIR et aux données ouvertes.
L'EOSC vise à donner à l'Europe une position de leader mondial dans la gestion des données de recherche et à garantir que les scientifiques européens puissent profiter pleinement des avantages de la science basée sur les données. Le SIB apporte une expertise approfondie en bioinformatique, en ressources des sciences de la vie et en formation en tant que l'une des 170 organisations membres de l'initiative.
Promouvoir les pratiques de science ouverte en Europe et dans le monde
Le European Open Science Cloud vise à créer un réseau de données et de services FAIR (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable). Dans le cadre de cette initiative, notre unité de représentation des connaissances Vital-IT, SIB Biodata Resources et nos équipes Training contribuent à deux projets complémentaires visant à garantir la conservation à long terme des ressources de données européennes. Le projet EOSC EDEN se concentre sur l'amélioration des stratégies de conservation des données, tandis que le projet FIDELIS se concentre sur la création de référentiels numériques fiables.
L'EOSC vise à donner à l'Europe une position de leader mondial dans la gestion des données de recherche et à garantir que les scientifiques européens puissent profiter pleinement des avantages de la science basée sur les données. Le SIB apporte une expertise approfondie en bioinformatique, en ressources des sciences de la vie et en formation en tant que l'une des 170 organisations membres de l'initiative.
Les deux projets sont financés par Horizon Europe et réunissent plus de 30 organisations soigneusement sélectionnées pour leur expertise dans différents domaines. En tant que l'un des sept partenaires contribuant aux deux projets, le SIB contribuera à renforcer et à harmoniser les normes et les pratiques FAIR en matière de données en Europe, ce qui permettra également de faire progresser la science ouverte à l'échelle mondiale.
EOSC EDEN : Renforcer les stratégies de préservation numérique au niveau européen et national
Avec la création de volumes de données sans précédent dans toutes les disciplines, il est urgent d'adopter une approche systématique pour sélectionner les données à conserver à long terme. Le projet EOSC EDEN créera et partagera un cadre commun permettant d'identifier les données susceptibles d'être conservées à long terme, grâce à une évaluation de leur utilisation, de leur qualité et de leurs avantages pour la science et la société. Le projet prévoit également de créer un modèle permettant de réévaluer périodiquement les données candidates, ainsi que de mettre en place un registre européen répertoriant les services et les outils proposés par des référentiels et des archives fiables.
En tant que seul partenaire du projet représentant la bioinformatique, le SIB :
- veiller à ce que les exigences et les besoins des sciences de la vie soient pris en compte dans l'infrastructure européenne distribuée envisagée pour la conservation et l'accès à long terme des données ;
- recommander des normes et des vocabulaires de métadonnées pour les référentiels afin de garantir leur interopérabilité ;
- mettre en œuvre et diffuser des lignes directrices sur la conservation à long terme des données au sein de la communauté des sciences de la vie, dans le cadre d'un réseau d'experts en conservation des données.
FIDELIS : Mise en place d'un réseau européen de dépôts numériques fiables
Des dépôts numériques fiables (TDR) sont nécessaires pour préserver et maintenir accessibles, réutilisables et consultables les resources de données à long terme. Le projet FIDELIS harmonisera la définition des dépôts fiables et établira un réseau européen de TDR afin de favoriser et de soutenir l'environnement scientifique envisagé par l'EOSC.
La contribution du SIB comprend :
- définir les attributs indispensables des objets numériques dans le domaine des sciences de la vie ;
- guider les référentiels vers l'obtention du statut de TDR dans le contexte de l'EOSC ;
- exploiter la puissance de la représentation des connaissances pour faciliter l'échange d'informations entre les référentiels, en aidant ces derniers à se décrire sémantiquement de manière standardisée, harmonisée et lisible par machine ;
- améliorer les compétences des acteurs clés en définissant les besoins de formation des parties prenantes, en élaborant une stratégie de formation et en mettant en place des interventions de formation.
Apporter son expertise en gestion des données à un troisième projet EOSC
Le SIB contribue également à un projet visant à faire de l'EOSC le « European Research Commons », un écosystème mondial fiable offrant un accès transparent à des résultats et des services de recherche interopérables et de haute qualité. Lancé en avril, le projet EOSC Data Commons développera des services innovants pour améliorer et accélérer la gestion du cycle de vie des données dans un continuum européen de données et de calcul. Cela comprend une plateforme pour la découverte basée sur l'IA de données et d'outils dans l'ensemble des résultats de la recherche européenne, à laquelle le SIB contribuera. Notre implication dans les trois projets EOSC garantira leur coordination stratégique et contribuera ainsi à la mise en œuvre réussie de la vision globale de l'EOSC.

Les membres du consortium EOSC EDEN et FIDELIS, dont le SIB, ont donné le coup d'envoi des deux projets lors d'une réunion organisée début février 2025 par le CSC - IT Center for Science, l'organisation partenaire chargée de la coordination des projets, à Helsinki, en Finlande. Crédit : Andrea Greco, Trust-IT Services.
En savoir plus sur le travail du SIB pour faire progresser les données de recherche ouvertes
Reference(s)
Légende/crédit de l'image : Le logo EOSC est la propriété exclusive de l'European Open Science Cloud Association AISBL (EOSC-A).