Systems and Synthetic Ecology

Notre groupe développe des approches computationnelles et de bioinformatique pour comprendre et manipuler les communautés microbiennes. Nous combinons la modélisation mécanistique et l'analyse basée sur les données avec des expériences de laboratoire ciblées afin de découvrir comment les microbes utilisent et échangent des ressources, et comment ces interactions façonnent l'assemblage, la stabilité et le fonctionnement des communautés. En reliant les traits métaboliques au niveau des espèces à la dynamique au niveau des écosystèmes, nous construisons des cadres prédictifs pour le comportement du microbiome dans les systèmes environnementaux et associés à l'hôte, et développons des ressources curatées pour l'analyse comparative des interactions écologiques.