La17e édition de l'événement phare biennal du SIB, la [BC]2 Basel Computational Biology Conference, a poursuivi son succès de longue date en mettant en relation la communauté suisse et mondiale de la bioinformatique afin de partager les meilleures pratiques et les avancées, de favoriser la collaboration et de nourrir l'innovation. Des scientifiques, des représentants de l'industrie et des cliniciens de 31 pays ont exploré les développements de pointe en bioinformatique et en IA et ont acquis une multitude de conseils pratiques, allant du développement de grands modèles linguistiques au lancement de start-ups prospères. Organisé du 8 au 10 septembre, l'événement a également célébré les lauréats des SIB Bioinformatics Awards 2025 et des SIB Remarkable Outputs 2024.
Participez aux prochains événements phares en bioinformatique
- 2026 European Conference on Computational Biology (ECCB): organisée par le SIB à Genève du 31 août au 4 septembre, sur le thème « Biodiversité, IA et santé : relier les connaissances pour la société de demain ». En savoir plus
- 2027 [BC]2 Basel Computational Biology Conference: organisée par le SIB à Bâle du 20 au 22 septembre. Plus d'informations disponibles prochainement.
Favoriser l'échange de connaissances entre le monde universitaire, l'industrie et les soins de santé
[BC]2 2025 a réuni plus de 500 scientifiques, cliniciens et représentants de l'industrie pharmaceutique et d'autres secteurs afin de partager les dernières avancées en matière de bioinformatique et d'intelligence artificielle, ainsi que leurs applications dans la recherche sur les maladies, les études environnementales, les soins de santé et bien d'autres domaines. Les participants provenaient d'institutions et d'entreprises de premier plan en Europe et au-delà, notamment l'Imperial College London, l'université Johns Hopkins, l'Institut Max Planck, Google DeepMind, Novartis, AstraZeneca et Nestlé.
Participez aux prochains événements phares en bioinformatique
- 2026 European Conference on Computational Biology (ECCB): organisée par le SIB à Genève du 31 août au 4 septembre, sur le thème « Biodiversité, IA et santé : relier les connaissances pour la société de demain ». En savoir plus
- 2027 [BC]2 Basel Computational Biology Conference: organisée par le SIB à Bâle du 20 au 22 septembre. Plus d'informations disponibles prochainement.
L'importance de cet événement pour la communauté bioinformatique, ainsi que pour le secteur des sciences de la vie dans la ville hôte de Bâle et en Suisse, a été soulignée dans les discours de Lukas Engelberger, membre du Conseil d'État du canton de Bâle-Ville et chef du Département de la santé, et de Christophe Dessimoz, directeur exécutif du SIB. Sa réputation et sa pertinence ont été confirmées par une augmentation de 24 % du nombre de résumés soumis par rapport à l'édition 2023, ainsi que par un taux élevé de participants fidèles et de nouveaux participants ayant entendu parler de [BC]2 par un collègue. Les femmes représentaient 43 % de l'ensemble des participants, et la majorité des conférenciers invités et des orateurs principaux étaient des femmes, ce qui reflète les progrès continus en matière d'égalité des sexes.
Pleins feux sur la bioinformatique basée sur l'IA
Le comité scientifique [BC]2 a présenté un programme inspirant sur le thème « La bioinformatique rencontre l'IA : façonner l'avenir de la biologie basée sur les données ». Les conférences scientifiques et les affiches se sont concentrées sur six domaines d'application : la recherche sur le cancer, la science des données cliniques, l'omique unicellulaire et spatiale, les sciences de l'évolution et de l'environnement, ainsi que la conception et la recherche sur les protéines.
Parmi les moments forts, citons les conférences liminaires de :
- serena Nik-Zainal (Université de Cambridge), pionnièredu séquençage du génome entier, qui a présenté les avancées récentes dans l'identification des signatures mutationnelles du cancer grâce à une combinaison de méthodes computationnelles et expérimentales, et comment celles-ci peuvent éclairer les traitements personnalisés ;
- peer Bork (EMBL), bioinformaticien de renommée mondiale, qui a présenté Tara Ocean et d'autres collaborations contribuant à la création d'une ressource microbiologique à l'échelle planétaire, notamment une étude à venir sur les écosystèmes microbiens d'eau douce en Suisse et dans d'autres pays européens et sur les impacts des activités humaines, qui exploitera l'IA pour alimenter l'acquisition de données en temps réel ainsi que les ressources Le SIB pour le traitement des données ;
- julia Merkenschlager (Harvard Medical School), experte en immunologie, qui a décrit un nouveau modèle mathématique expliquant comment le système immunitaire assure une réponse anticorps forte et continue aux infections et aux vaccinations.
Soutenir les start-ups suisses dans le domaine de la bioinformatique
Les participants ont également bénéficié des conseils d'experts pour réussir leur transition du monde universitaire vers l'industrie. La session a abordé tous les aspects, des considérations juridiques, réglementaires et de propriété intellectuelle à la richesse des possibilités de développement commercial et de financement disponibles dans l'écosystème d'innovation suisse.
Roche et d'autres entreprises suisses du secteur des sciences de la vie ont présenté leur utilisation de l'IA et de la bioinformatique de pointe pour fournir des solutions de recherche et cliniques lors d'une session industrielle distincte. Les thèmes abordés comprenaient la découverte de médicaments (Genentech, Alithea Genomics), la médecine de précision (Novigenix) et les applications pharmaceutiques de l'omique spatiale (Roche).
Reconnaissance de l'excellence en biologie computationnelle
La conférence a mis en avant les réalisations exceptionnelles de bioinformaticiens du monde entier à travers des célébrations et des sessions spéciales.
Les lauréats 2025 des SIB Bioinformatics Awards ont été annoncés :
- Prix de la meilleure thèse : David Meyer, Hôpital universitaire et Université de Cologne, Allemagne, pour un article publié dans Nature Genetics sur un modèle mathématique permettant d'étudier les causes du vieillissement ;
- Prix de début de carrière : Michael Skinnider, Université de Princeton, branche de l'Institut Ludwig pour la recherche sur le cancer, États-Unis, pour avoir créé un « modèle linguistique biochimique » basé sur l'IA afin de cartographier les métabolites inconnus des mammifères ;
- Prix des ressources innovantes : scverse, une ressource open source pour les outils logiciels permettant de stocker et d'analyser les données génomiques unicellulaires et autres données « omiques » ; reçu par Ilan Gold, Helmholtz Munich, Allemagne.
Les lauréats, ainsi que les huit gagnants du prix SIB Remarkable Outputs 2024, ont présenté leurs travaux lors d'une brève allocution, tout comme les chercheurs qui ont soumis les meilleurs résumés, parmi lesquels figuraient Peter Skrinjar (Biozentrum) et Athina Gavriilidou (Université de Lausanne), tous deux membres du SIB.
Des prix ont été décernés pour chaque domaine thématique :
- Science des données cliniques : Cassandra Litchfield, Université de Zurich et Hôpital universitaire de Zurich, Suisse, qui a présenté un flux de travail bioinformatique permettant d'intégrer le séquençage du génome entier dans la pathologie moléculaire de routine des échantillons tumoraux ;
- Bioinformatique pour la recherche sur le cancer : Alen Stambolliu, Institut national de génétique moléculaire (INGM), Italie, qui a présenté le concept novateur selon lequel les éléments génétiques mobiles non codants pourraient servir de points de contrôle immunologiques dans le cancer ;
- Bioinformatique dans les maladies infectieuses : Benjamin Heiniger, membre du SIB, Agriscope, Suisse, qui a présenté un cadre protéogénomique permettant d'identifier des protéines jusqu'alors inconnues dans Mycobacterium tuberculosis;
- Processus évolutifs et environnementaux : Laura Voitl, Université de Berne, Suisse, qui a identifié des variantes génétiques chez des espèces animales domestiques à l'aide du séquençage à lecture longue ;
- Conception de protéines et modélisation d'assemblages moléculaires : Océane Follonier, membre du SIB, Université de Bâle, Suisse, qui a présenté une méthodologie de conception de vaccins basée sur l'IA pour un type de virus qui ne dispose actuellement d'aucun traitement ciblé ;
- Méthodes computationnelles pour l'omique unicellulaire et spatiale : Siyuan Luo, ETH Zurich, Suisse, qui a présenté un cadre de mesures de validation pour l'analyse des données omiques unicellulaires et spatiales.
Qingyao Huang, membre du SIB, Université de Zurich, Suisse, a également été récompensé pour avoir mis en avant les travaux du groupe de réflexion EcoImpact du SIB sur la promotion de la durabilité et de la conscience environnementale au travail.
Fournir des conseils pratiques en bioinformatique et en matière d'orientation professionnelle
[BC]2 comprenait une journée de tutoriels et d'ateliers au cours desquels les participants ont pu découvrir les dernières méthodes de bioinformatique et échanger leurs expériences pratiques et leurs idées de recherche. Les thèmes abordés comprenaient des conseils sur des ressources bioinformatiques spécifiques, l'utilisation de grands modèles linguistiques pour l'analyse de données biologiques et médicales, des solutions pour le partage de données sensibles et des techniques pour la découverte de protéines et de médicaments basées sur les données.
Les participants ont également pu profiter d'un espace « Boostez votre carrière » animé par l'équipe People and culture du SIB, qui a fourni des commentaires personnalisés sur les candidatures, des conseils pour les entretiens d'embauche, et bien plus encore.
Nous remercions chaleureusement tous les intervenants, sponsors et participants pour le succès de [BC]2 2025, et espérons vous revoir lors de la prochaine édition qui se tiendra du 20 au 22 septembre 2027.
Reference(s)
Crédit image : le SIB
