L'International Society for Computational Biology (ISCB) a décerné aujourd'hui à Amos Bairoch le prix « 2025 Accomplishments by a Senior Scientist Award », en reconnaissance de son leadership et de son innovation dans le développement des ressources et des infrastructures bioinformatiques. Cette prestigieuse distinction souligne la contribution pionnière et l'excellence continue de Genève et de la Suisse dans la mise à disposition de données, de connaissances et d'outils ouverts pour les sciences de la vie.
La cérémonie de remise des prix s'est déroulée lors de la 33e conférence annuelleconjointe Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) et de la 24e European Conference on Computational Biology (ECCB) qui se tiennent à Liverpool, au Royaume-Uni. Amos Bairoch a également prononcé un discours liminaire lors de l'événement d'aujourd'hui, revenant sur 40 ans de biocuration.
Un pionnier de la bioinformatique
Amos Bairoch est professeur émérite à l'Université de Genève et cofondateur et chef de groupe au SIB. Ses contributions innovantes et pionnières à la bioinformatique comprennent :
La cérémonie de remise des prix s'est déroulée lors de la 33e conférence annuelleconjointe Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) et de la 24e European Conference on Computational Biology (ECCB) qui se tiennent à Liverpool, au Royaume-Uni. Amos Bairoch a également prononcé un discours liminaire lors de l'événement d'aujourd'hui, revenant sur 40 ans de biocuration.
- l'introduction de l'idée d'analyser les séquences d'ADN et de protéines sur des ordinateurs personnels (au début des années 1980) plutôt que sur de gros ordinateurs centraux partagés par plusieurs institutions ;
- la création de la première version de Swiss-Prot (1986) avec près de 4 000 entrées de séquences protéiques vérifiées et précurseur d'UniProt (voir ci-dessous) ;
- la création de la base de données PROSITE (1988) sur les familles et les domaines de protéines, qui permet d'identifier les fonctions des protéines ;
- création de la base de données ENZYME (1990), devenue indispensable pour le développement de bases de données métaboliques ;
- lancement conjoint d'Expasy, le portail suisse des ressources bioinformatiques (1993) – le premier portail web consacré aux sciences de la vie et l'un des 150 premiers sites web au monde ;
- cofondation du SIB (1998) pour soutenir la stabilité à long terme de la recherche en bioinformatique en Suisse;
- cofondation d'UniProt (2002), la principale ressource mondiale de haute qualité, complète et librement accessible sur les séquences protéiques et les informations fonctionnelles, s'appuyant sur Swiss-Prot – depuis reconnue comme ELIXIR Core Data Resource et Global Core Biodata Resource ;
- création de Cellosaurus (2012), la première ressource centrale de connaissances sur les lignées cellulaires, reconnue depuis comme une ELIXIR Core Data Resource et une Global Core Biodata Resource.
Une reconnaissance vraiment méritée pour Amos, pionnier et visionnaire qui a façonné la bioinformatique tout au long de sa carrière. Son travail a établi la norme d'excellence en matière de biocuration, de données ouvertes et de ressources de qualité sur lesquelles s'appuient chaque jour d'innombrables chercheurs en sciences de la vie.
Un leader dans le domaine de la curation de données
Amos Bairoch a joué un rôle déterminant dans la définition de la norme en matière de curation des données : un processus hautement spécialisé qui consiste à ajouter en continu aux bases de données des informations pertinentes issues de la littérature scientifique et d'autres sources fiables. Dans UniProt, par exemple, cela implique d'annoter les séquences protéiques à l'aide de connaissances sur la structure, la fonction et d'autres caractéristiques des protéines, en combinant l'expertise en bioinformatique et en biologie des protéines.
En plus d'accomplir cette tâche lui-même, Amos Bairoch a également formé des biocurateurs avant même que des programmes de formation formels ou standardisés n'existent. La curation experte des données continue d'être une partie fondamentale du travail du SIB, faisant de Genève et de la Suisse un « hub » de la biocuration et contribuant à la valeur inestimable de nos resources de données pour accélérer les découvertes dans le domaine des sciences de la vie.
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Reference(s)
Crédit image : Jacqueline Brunner
