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Une passion démesurée pour les coléoptères ou une course à l'armement contre les plantes ?

27 octobre 2019

Vous êtes biologiste évolutionniste travaillant avec des données génomiques, ou simplement passionné par les coléoptères ? Si vous utilisez les ressources OrthoDB ou BUSCO du SIB et souhaitez les voir utilisées dans le cadre d'une étude de génomique fonctionnelle, cette dernière édition des in silico talks est faite pour vous. Robert Waterhouse, chef du groupe SIB à l'Université de Lausanne, vous emmène dans les coulisses de l'un de ses récents articles et explique comment lui et ses collègues ont identifié les signatures génomiques qui ont accompagné le passage à une alimentation végétale chez les coléoptères - considéré comme un facteur clé de leur diversification - ainsi que les workflows et les ressources bioinformatiques associés.

À propos de la série in silico talks - Les dernières avancées en bioinformatique par les scientifiques du SIB

La série in silico talks a pour but d'informer les bioinformaticiens, les spécialistes des sciences de la vie et les cliniciens des dernières avancées réalisées par les scientifiques du SIB sur un large éventail de sujets liés aux méthodes, à la recherche et aux ressources en bioinformatique. Restez au courant des derniers développements, obtenez des informations exclusives sur les articles récents et découvrez comment ces avancées pourraient vous aider dans votre travail ou votre recherche en vous inscrivant à la liste de diffusion in silico talks.

Intervenants

Name:

Robert Waterhouse

Institute:

Université de Lausanne

Les études de premier cycle de Rob en biochimie cellulaire et moléculaire à l'université d'Oxford et son expérience professionnelle dans le domaine biopharmaceutique ont nourri son intérêt précoce pour la biologie computationnelle. La formalisation de sa formation par un master en bioinformatique à l'Imperial College de Londres lui a apporté les compétences nécessaires pour poursuivre ses études doctorales en génomique comparative. La thèse de Rob portait sur l'analyse comparative computationnelle des génomes d'insectes, en particulier le système immunitaire des moustiques vecteurs de maladies. Au cours de ses recherches postdoctorales à la Faculté de médecine de l'Université de Genève, Rob a développé et supervisé des projets en génomique des arthropodes dans le cadre de nombreuses collaborations internationales, afin de comprendre les principes de l'évolution moléculaire et de la biologie génomique. En tant que boursier Marie Curie International Outgoing Fellow au Massachusetts Institute of Technology, il a mené avec succès l'analyse comparative de plusieurs génomes de moustiques. De retour en Suisse, Rob développe son groupe de recherche indépendant en tant que professeur assistant du Fonds national suisse de la recherche scientifique (Professeur boursier FNS) et chef de groupe au SIB Institut Suisse de Bioinformatiqueau Département d'écologie et d'évolution de l'Université de Lausanne, où il se concentre sur la génomique évolutive et fonctionnelle comparative des arthropodes.

Vidéo

Duration:

14 minutes 33 secondes

Licence:

Cette vidéo est disponible sous la licence Creative Commons CC-BY-4.0

Reference(s)

Seppey et al. Signatures génomiques accompagnant le changement alimentaire vers la phytophagie chez les coléoptères polyphages. Genome Biology 2019.

DOI:

https://doi.org/10.1186/s13059-019-1704-5